HLA-B39
|
||
| HLA-B (alfa) -β2MG ze związanym peptydowym | ||
|
głównym kompleksem zgodności tkankowej (ludzki), klasa I, B39
|
||
| Allele | B*3901, 3902, 3903, . . | |
| Struktura (Patrz HLA-B ) | ||
| Udostępnione dane | ||
| Umiejscowienie | rozdz.6 6p21.31 | |
HLA-B39 (B39) jest serotypem HLA - B . Serotyp identyfikuje bardziej powszechne produkty genu HLA-B*39.
B39 jest rozszczepionym antygenem szerokiego antygenu B16 i jest siostrzanym typem B38 . B39 jest najczęściej spotykany na zachodnim brzegu Pacyfiku, w Japonii i z najwyższą częstotliwością w nowym świecie. W Europie występuje w Skandynawii i północnej Rosji.
Serotyp
| B*39 | B39 | B16 | B38 | Próbka | |
| allel | % | % | % | rozmiar (N) | |
| 95 | 476 | ||||
| 87 | 96 | ||||
| 77 | 20 | ||||
| 82 | 245 | ||||
| 94 | 508 | ||||
| 48 | 57 | ||||
| 97 | 13 | ||||
| 82 | 127 | ||||
| 69 | 16 | ||||
| Połączenie alleli z IMGT/ HLA Databease w EBI | |||||
Serologia dla najpowszechniejszych alleli B39, B*3901 i B*3906 jest dobra, ale niektóre produkty alleli nie są dobrze wykrywane. Biorąc pod uwagę zróżnicowane zaangażowanie tych alleli w testowanie chorób, powinno ono obejmować typowanie w wysokiej rozdzielczości.
| częstotliwość | ||
| ref. | Populacja | (%) |
| Wenezuela Perja Mountain Bari | 23,9 | |
| Meksyk Mixtec Oaxaca | 8.8 | |
| USA Arizona Pima | 7.3 | |
| Latynosi z południowego Teksasu w USA | 5.6 | |
| Meksyk Zaptotec Oaxaca | 4.5 | |
| Kanonik Navajo z Nowego Meksyku | 3.7 | |
| Oman | 2.5 | |
| PNG Wanigela | 2.3 | |
| Tunezja Tunis | 2.3 | |
| Rdzenni mieszkańcy Ameryki Północnej | 1.9 | |
| Amerykanin latynoski | 1.7 | |
| Brazylia Belo Horizonte | 1.6 | |
| Dakota Południowa Lakota Sioux | 1.5 | |
| Kubański biały | 1.4 | |
| Azory S. Maria i S. Miguel | 1.3 | |
| Australia Nowa Południowa Walia | 1.1 | |
| Finlandia | 1.1 | |
| Portugalia północna | 1.1 | |
| Centrum Portugalii | 1.0 | |
| Hiszpania Wschodnia Andaluzja Cygańska | 1.0 | |
| Brazylia Terena | 0,9 | |
| Irlandia Północna | 0,9 | |
| Wyspa Azory Terceira | 0,8 | |
| Kaukaski pop z USA2 | 0,8 | |
| Brazylia | 0,7 | |
| Amerykanie z Filadelfii rasy kaukaskiej | 0,7 | |
| Indie Andhra Pradesh Golla | 0,5 | |
| Tajlandia | 0,4 |
Allele
| częstotliwość | ||
| ref. | Populacja | (%) |
| Tajwański Saisiat | 54,9 | |
| Tajwan Tsou | 24,5 | |
| Dakota Południowa Lakota Sioux | 22,5 | |
| Tajwan Taroko | 21.8 | |
| Tajwański Atayal | 19.8 | |
| PNG Wanigela | 16.7 | |
| Japonia Ainu Hokkaido | 16.0 | |
| Tajwan Bunun | 14,9 | |
| Kanonik Navajo z Nowego Meksyku | 14.6 | |
| Tajwan Thao | 13.3 | |
| Tajwan Rukai | 13.0 | |
| Tajwan Ami | 10.2 | |
| Stany Zjednoczone Hawaje Okinawa | 7.7 | |
| Papua-Nowa Gwinea Wosera | 7.0 | |
| Papua-Nowa Gwinea Madang | 6.4 | |
| Meksyk Mixtec Oaxaca | 5.9 | |
| Tajwan Puyuma | 5.0 | |
| Tajwan Paiwan | 4.9 | |
| Nowa Kaledonia | 4.8 | |
| Japonia Środkowa | 4.4 | |
| Samoa Amerykańskie | 4.0 | |
| Rdzenni mieszkańcy Ameryki Północnej w USA | 4.0 | |
| Tajwan Hakka | 3.6 | |
| Ind. Australijski półwysep Cape York | 3.5 | |
| Japonia (5) | 3.5 | |
| Filipiny Ivatan | 3.0 | |
| Brazylia | 2.9 | |
| Chiny Guangxi Maonan | 2.8 | |
| Gruzja Tbilisi Gruzini | 2.8 | |
| Chiny Yunnan Nu | 2.6 | |
| Tajlandia | 2.5 | |
| Wyspa Azory Terceira | 2.4 | |
| Singapurski Chińczyk | 2.4 | |
| rumuński | 2.3 | |
| Chiny Yunnan Lisu | 2.2 | |
| Ind. Australijskie Yuendumu | 2.1 | |
| Chiny Kanton | 2.0 | |
| Chorwacja | 2.0 | |
| Francja Południowo-Wschodnia | 1.9 | |
| Georgia Svaneti Svans | 1.9 | |
| PNG Płaskowyż Karimui | 1.9 | |
| Azory Centralne Wyspy | 1.8 | |
| Hiszpania Andaluzja Wschodnia | 1.8 | |
| Uganda Kampala | 1.6 | |
| Meksyk Zaptotec Oaxaca | 1.5 | |
| Singapur tajski | 1.5 | |
| Chiny Guangzhou Han | 1.4 | |
| Chiny Qinghai Hui | 1.4 | |
| Republika Czeska | 1.4 | |
| Madera | 1.4 | |
| Ind. Australijska Kimberly | 1.3 | |
| Finlandia | 1.1 |
Choroba
B39 jest sugerowany jako czynnik zapalenia tętnic i kamieni żółciowych Takayasu w Meksyku. Powikłania kostno-stawowe brucelozy wydają się być związane z B39. W kilku badaniach zaobserwowano związek ze spondyloartropatiami i łuszczycowym zapaleniem stawów. Wydaje się, że łuszczycowe zapalenie stawów jest powiązane z MICA -A9, która jest ściśle związana z HLA-B39. Wydaje się również, że B39 jest zaangażowany w wariant zespołu Fishersa zespołu Guillain-Barré .
Wydaje się, że B39 chroni przed kardiomiopatią w chorobie Chagi , co wskazuje na możliwy selektywny czynnik jej wzrostu w Nowym Świecie. Choroba Chagi jest wywoływana przez trypanosomy przenoszone przez krwiopijne owady występujące w tropikalnych regionach, w których rosną palmy.
Południowa Kalifornia zgłasza obecnie przypadki choroby Chagi z zanieczyszczonych transfuzji i może już być siedliskiem wektora.
W zapaleniu tętnic Takayasu
zapalenie tętnic Takayasu ma związek z B39. Związek z B*3902 zwiększa ryzyko zawału płuc , choroby niedokrwiennej serca , niedomykalności zastawki aortalnej , nadciśnienia układowego , zwężenia tętnicy nerkowej , choroby naczyń mózgowych i zaburzeń widzenia. Stwierdzono, że B * 3906, powszechny u rdzennych mieszkańców Mezoameryki, jest związany z tą samą chorobą.
| częstotliwość | ||
| ref. | Populacja | (%) |
| Meksyk Mixe Oaxaca | 38,7 | |
| Meksyk Zaptotec Oaxaca | 13.4 | |
| Meksyk Mixtec Oaxaca | 5.9 | |
| meksykańscy metysi | 1.2 | |
| Japonia pop5 | 0,9 | |
| Kubański Biały | 0,7 | |
| Izrael Aszk. i Non Ashk. Żydzi | 0,5 | |
| Japonia Środkowa | 0,5 | |
| Senegal Niokholo Mandenka | 0,5 | |
| B*3903 | ||
|---|---|---|
| PNG New Britain Rabaul | 13.2 | |
| Brazylia Terena | 11.2 | |
| Argentyna Toba Rosario | 5.2 | |
| Brazylia | 0,7 | |
| Finlandia | 0,6 | |
| Kenia Luo | 0,6 | |
| Rdzenni mieszkańcy Ameryki Północnej | 0,5 | |
| B*3904 | ||
| Argentyna Toba Rosario | 1.2 | |
| Georgia Svaneti Svans | 0,6 | |
| Jordan Amman | 0,3 | |
| Shijiazhuang Tianjian Han | 0,1 | |
| Japonia Środkowa | 0,1 | |
| rumuński | 0,1 | |
| B*3905 | ||
| Wenezuela Perija Yucpa | 36.1 | |
| Meksyk Zaptotec Oaxaca | 12.7 | |
| Meksyk Mixtec Oaxaca | 9.8 | |
| meksykańscy metysi | 4.9 | |
| Arizona Pima | 4.5 | |
| Meksyk Guadalajara Mestizos | 2.4 | |
| Argentyna Toba Rosario | 2.3 | |
| Amerykanin latynoski | 2.1 | |
| Meksyk Mixe Oaxaca | 1.9 | |
| Kubański Biały | 1.4 | |
| Meksykański Chihuahua Tarahumara | 1.1 | |
| Rdzenni mieszkańcy Ameryki Północnej w USA | 0,5 | |
| Shijiazhuang Tianjian Han | 0,2 | |
| B*3907 | ||
| Shijiazhuang Tianjian Han | 0,6 | |
| Singapur tajski | 0,5 | |
| Chiny Południowe Han | 0,2 | |
| B*3908 | ||
| Meksyk Zaptotec Oaxaca | 2.2 | |
| meksykańscy metysi | 1.2 | |
| Meksyk Mixtec Oaxaca | 1.0 | |
| Brazylia | 0,7 | |
| Amerykanin latynoski | 0,6 | |
| B*3909 | ||
| Wenezuela Perija Yucpa | 34,9 | |
| Tajlandia pop3 | 3.1 | |
| Brazylia Terena | 1.7 | |
| Chiny Południowe Han | 1.4 | |
| Argentyna Toba Rosario | 1.2 | |
| Chiny Qinghai Hui | 0,9 | |
| B*3910 | ||
| sudański | 2.5 | |
| Senegal Niokholo Mandenka | 2.1 | |
| Południowoafrykański Natal Zulus | 1.5 | |
| Kamerun Beti | 1.4 | |
| Hiszpania Andaluzja Wschodnia | 1.2 | |
| Kenia Luo | 1.1 | |
| Izraelscy Arabowie Druzowie | 1.0 | |
| Kenia Nandi | 1.0 | |
| Gwinea Bissau | 0,8 | |
| Kenia | 0,7 | |
| Mali Bandiagara | 0,7 | |
| Maroko Nador Metalsa Klasa I | 0,7 | |
| Kamerun Bamileke | 0,6 | |
| Kamerun Jaunde | 0,5 | |
| Izrael Aszk. i Non Ashk. Żydzi | 0,5 | |
| Arabia Saudyjska Guraiat i Grad | 0,5 | |