Ideowirus
| Klasyfikacja wirusów | |
|---|---|
| Idaeovirus | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Kitrinoviricota |
| Klasa: | Alsuviricetes |
| Zamówienie: | Martelliwirusy |
| Rodzina: | Mayoviridae |
| Rodzaj: | Ideowirus |
Idaeovirus to rodzaj wirusów ssRNA o dodatniej czułości , który obejmuje dwa gatunki: wirus karłowatej maliny (RBDV) i idaeowirus Privet . RBDV ma dwa zależne od żywiciela klady : jeden dla malin ; drugi do winorośli . Infekcje stanowią znaczne obciążenie w rolnictwie, powodując spadek plonów i jakości plonów. RBDV ma synergistyczny związek z wirusem plamistości liści maliny , z koinfekcją znacznie zwiększającą stężenie wirionów w zainfekowanych roślinach. Wirus jest przenoszony przez zapylanie ziarnami pyłku zakażonymi RBDV, które najpierw infekują znamię słupka , zanim wywołają infekcję ogólnoustrojową.
Wirusologia
RBDV nie ma otoczki z izometrycznym płaszczem białkowym o średnicy około 33 nanometrów. Wewnątrz płaszcza białkowego znajduje się genom wirusa, który jest dwudzielny, z RNA określanymi jako RNA-1 i RNA-2. RNA-1 ma długość 5449 nukleotydów i zawiera jedną otwartą ramkę odczytu (ORF), która koduje połączone białko zawierające metylotransferazę , helikazę i polimerazę RNA zależną od RNA domeny. RNA-2 ma długość 2231 nukleotydów i zawiera dwie ORF, jedną na końcu 5', a drugą na końcu 3'. Pierwsza ORF koduje białko przemieszczające się z komórki do komórki, podczas gdy druga ORF jest wyrażana jako subgenomowa nić RNA . Ta nić, RNA-3, ma długość 946 nukleotydów i koduje białko płaszcza. Wykazano, że infekcja nie występuje, jeśli RNA-3 jest nieobecny lub jest wystarczająco uszkodzony.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Ideowirus | Dwudziestościan, izometryczny | Bez koperty | Liniowy | Dwustronny |
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez penetrację do komórki gospodarza. Replikacja jest zgodna z modelem replikacji wirusa z dodatnią nicią RNA. Transkrypcja wirusowa z dodatnią nicią RNA jest metodą transkrypcji. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez ruch wirusowy kierowany przez kanaliki. Rośliny służą jako naturalny żywiciel. Drogi przenoszenia są związane z pyłkami.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ideowirus | Rośliny | Nic | Cytoplazma | Cytoplazma | Związany z pyłkiem |
Diagnoza
W celu wykrycia RBDV opracowano jednoetapowe reakcje łańcuchowe polimerazy z odwrotną transkrypcją . Wirusy są wzbogacane o przeciwciała w mikrostudzienkach PCR, po czym następuje liza cząstek wirusa, a następnie odwrotna transkrypcja wirusowego RNA. Dzięki włączeniu do całego procesu odwrotnej transkryptazy i polimerazy DNA zabieg można przeprowadzić w jednym kroku. Testy te są wystarczająco czułe, aby zidentyfikować konkretny szczep wirusa.
Leczenie
RBDV można wyeliminować z zainfekowanych roślin za pomocą procedury, która najpierw stosuje termoterapię , a następnie krioterapię zainfekowanych pędów . Zastosowanie ciepła do zainfekowanych roślin powoduje powiększenie wakuoli w zainfekowanych komórkach, które później zostają zabite podczas krioterapii. Dodanie kwasu Fe-etylenodiaminotetraoctowego lub kwasu Fe-etylenodiaminodi(o)hydroksyfenylooctowego po krioterapii stymuluje odrost i zapobiega chlorozie z rozwijających się w pędach roślin. Stosując tę metodę, około 80% pędów przeżywa wstępną terapię cieplną, a 33% przeżywa krioterapię i pomyślnie odrasta.