Methanosarcinaceae

Methanosarcinaceae
Methanosarcina barkeri fusaro
Klasyfikacja naukowa
Domena:	Archeony
Królestwo:	euryarchaeota
Gromada:	euryarchaeota
Klasa:	Metanomikrobia
Zamówienie:	Methanosarcinales
Rodzina:	Methanosarcinaceae Balch i Wolfe 1981
Rodzaje
Halomethanococcus Yu i Kawamura 1988 metanimikrokoki Metanokokody Metanohalob Metanohalofil Metanolobus Metanometyloworany metanosalsum Methanosarcina „ Ca. Methanovorans” Chadwick i in. 2022

W taksonomii Methanosarcinaceae to rodzina Methanosarcinales . _ _

Filogeneza

Obecnie akceptowana taksonomia jest oparta na Liście nazw prokariotycznych z obowiązującą nomenklaturą (LPSN) i National Center for Biotechnology Information (NCBI)

LTP na bazie 16S rRNA _01_2022	53 białka markerowe oparte na GTDB 07-RS207
Methanohalobium Zhilina i Zavarzin 1988 Methanosalsum Boone i Baker 2002 Methanococcoides Sowers and Ferry 1985 Methanohalophilus Paterek i Smith 1988 Methanometylovorans Lomans et al. 2004 Methanolobus König i Stetter 1983 Methanimicrococcus Sprenger et al. 2000 Methanosarcina Kluyver i van Niel 1936	Methanimicrococcus Methanosarcina Methanohalobium Methanosalsum Methanococcoides Methanohalophilus Methanomethylovorans Methanolobus

Biochemia

Godną uwagi cechą Methanosarcinaceae jest to, że są metanogenami , które włączają niezwykły aminokwas pirolizynę do swoich enzymów. Enzym metylotransferaza monometyloaminy katalizuje reakcję monometyloaminy do metanu . Enzym ten obejmuje pirolizynę. Niezwykły aminokwas jest wstawiany przy użyciu unikalnego tRNA , którego antykodonem jest UAG. W większości organizmów iw większości białek Methanosarcinaceae UAG jest kodonem stop . Jednak w tym enzymie i gdziekolwiek indziej włączona jest pirolizyna, prawdopodobnie poprzez kontekstowe markery na mRNA, zamiast czynnika uwalniania wstawiany jest tRNA obciążony pirolizyną . Mają także unikalną syntetazę aminoacylo-tRNA, która specyficznie ładuje ten tRNA pirolizyną. Ta wyjątkowa adaptacja jest nadal przedmiotem znaczących badań.

Zobacz też

• Lista rodzajów Archaea

Dalsza lektura

Czasopisma naukowe

•   Cavalier-Smith, T (2002). „Neomurańskie pochodzenie archebakterii, negibakteryjny korzeń drzewa uniwersalnego i megaklasyfikacja bakterii” . Int. J. Syst. ewolucja Mikrobiol . 52 (część 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
•   Springera E; Sachs MS; Biada CR; Boone DR (1995). „Częściowe sekwencje genów dla podjednostki A reduktazy metylokoenzymu M (mcrI) jako narzędzie filogenetyczne dla rodziny Methanosarcinaceae” . Int. J. Syst. Bakteriol . 45 (3): 554–559. doi : 10.1099/00207713-45-3-554 . PMID 8590683 .
•    Cavalier-Smith, T (1986). „Królestwa organizmów”. Natura . 324 (6096): 416–417. Bibcode : 1986Natur.324..416C . doi : 10.1038/324416a0 . PMID 2431320 . S2CID 5242667 .
• Siewniki KR; Johnson JL; Prom JG (1984). „Związki filogenetyczne między metylotroficznymi bakteriami wytwarzającymi metan i poprawka rodziny Methanosarcinaceae” . Int. J. Syst. Bakteriol . 34 (4): 444–450. doi : 10.1099/00207713-34-4-444 .
•    Balch WE; Fox GE; Magrum LJ; Woses CR; i in. (1979). „Metanogeny: ponowna ocena unikalnej grupy biologicznej” . Mikrobiol. ks . 43 (2): 260–296. doi : 10.1128/MMBR.43.2.260-296.1979 . PMC 281474 . PMID 390357 .

Książki naukowe

•   Boone DR; Whitman WB; Koga Y (2001). „Zamówienie III. Methanosarcinales ord. Nov.” . W DR Boone; RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, tom 1: Archaea i głęboko rozgałęzione i fototroficzne bakterie (wyd. 2). Nowy Jork: Springer Verlag . s. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .
•   Grant WD; Kamekura M; McGenity TJ; Ventosa A (2001). „Klasa III. Klasa halobakterii. lis.” . W DR Boone; RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, tom 1: Archaea i głęboko rozgałęziające się i fototroficzne bakterie (wyd. 2). Nowy Jork: Springer Verlag. s. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .