Nepowirus

Nepovirus
	Struktura krystaliczna wirusa winorośli Fanleaf
Klasyfikacja wirusów
(nierankingowe):	Wirus
królestwo :	Rybowiria
Królestwo:	Orthornawirusy
Gromada:	Pisuviricota
Klasa:	Pisoniviricetes
Zamówienie:	pikornawirusy
Rodzina:	Secoviridae
Podrodzina:	Comovirinae
Rodzaj:	Nepowirus
Gatunki
	patrz tekst

Nepovirus to rodzaj wirusów z rzędu Picornavirales , w rodzinie Secoviridae , w podrodzinie Comovirinae . Rośliny służą jako naturalni gospodarze. Istnieje 40 gatunków w tym rodzaju. Nepowirusy, w przeciwieństwie do pozostałych dwóch rodzajów ( Comovirus i Fabavirus ) z podrodziny Comovirinae , są przenoszone przez nicienie .

Taksonomia

Rodzaj obejmuje następujące gatunki:

Wirus pierścieniowej plamistości Aeonium
Utajony wirus pierścieniowej plamistości moreli
Wirus mozaiki arabskiej
Wirus Arracacha A
Wirus pierścieniowej plamistości karczocha Morza Egejskiego
Włoski utajony wirus karczocha
Wirus żółtej pierścieniowej plamistości karczocha
Wirus pierścieniowej plamistości buraka
Wirus rewersji czarnej porzeczki
Utajony kulisty wirus borówki amerykańskiej
Wirus pstrości liści borówki amerykańskiej
Amerykański utajony wirus manioku
Wirus zielonej plamistości manioku
Wirus liściozwoju wiśni
Wirus żółtej pstrości cykorii
Wirus martwicy kakaowca
Utajony wirus karmazynowej koniczyny
Cycas necrotic stunt virus
Anatolijski wirus pierścieniowej plamistości winorośli
Bułgarski utajony wirus winorośli
Wirus chromowej mozaiki winorośli
Wirus deformacji winorośli
Wirus wachlarzowatości winorośli
Wirus tunezyjskiej pierścieniowej plamistości winorośli
Utajony wirus pierścieniowej plamistości hibiskusa
Utajony wirus Lucerne Australian
Wirus łagodnej pstrości melona
Wirus związany z mozaiką liści morwy
Wirus pierścieniowej plamistości morwy
Myrobalan utajony wirus pierścieniowej plamistości
Utajony wirus pierścieniowej plamistości oliwek
Wirus mozaiki rozety brzoskwini
Wirus czarnej pierścieniowej plamistości ziemniaka
Wirus ziemniaka B
Wirus ziemniaka U
Wirus pierścieniowej plamistości maliny
Utajony kulisty wirus soi
Wirus pierścieniowej plamistości tytoniu
Wirus czarnej pierścieniowości pomidora
Wirus pierścieniowej plamistości pomidora

Struktura

Wirusy w Nepovirusie nie mają otoczki, mają dwudziestościenną geometrię i symetrię T=pseudo3. Średnica wynosi około 28-30 nm. Genomy są liniowe i podzielone na segmenty, dwudzielne, o długości około 23,9 kb.

Rodzaj	Struktura	Symetria	Kapsyd	Układ genomowy	Segmentacja genomu
Nepowirus	dwudziestościenny	Pseudo T=3	Bez koperty	Liniowy	Segmentowane

Koło życia

Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez penetrację do komórki gospodarza. Replikacja jest zgodna z modelem replikacji wirusa z dodatnią nicią RNA. Transkrypcja wirusowa z dodatnią nicią RNA jest metodą transkrypcji. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez ruch wirusowy kierowany przez kanaliki. Rośliny służą jako naturalny żywiciel. Wirus jest przenoszony przez wektor (nicienie, roztocza i wciornastki). Trasy transmisji są wektorowe.

Rodzaj	Dane gospodarza	Tropizm tkankowy	Szczegóły wpisu	Szczegóły wydania	Miejsce replikacji	Miejsce montażu	Przenoszenie
Nepowirus	Rośliny	Nic	ruch wirusowy; inokulacja mechaniczna	Ruch wirusowy	Cytoplazma	Cytoplazma	nicienie; roztocza; wciornastki

Genom

wirusy typu IV w systemie klasyfikacji Baltimore iw konsekwencji zawierają dwudzielne, liniowe, jednoniciowe genomy RNA o pozytywnym sensie . Dwa segmenty genomu są oddzielnie zamknięte w dwóch różnych dwudziestościennych cząsteczkach. Każdy z segmentów genomu wytwarza inny polipeptyd, który przechodzi szereg etapów (tj. proteolizę i inne modyfikacje potranslacyjne ) w celu wytworzenia funkcjonalnego białka.

RNA1

Pierwszy segment (RNA1) ma długość około 8000 nukleotydów i pojawia się jako pojedyncza kopia w każdym wirionie typu B. Koduje białka , które są ważne w replikacji i jest pierwszym aktywowanym genem.

RNA2

Drugi segment (RNA2) ma długość około 4 000–7 000 nukleotydów i zwykle pojawia się jako pojedyncza kopia w każdym wirionie typu M. Koduje białka, które są ważne w transmisji komórka-komórka i unikaniu obrony komórkowej.

Linki zewnętrzne