Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
NUP214
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologiczne:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, nukleoporyna 214kDa, nukleoporyna 214, IIAE9
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Nukleoporyna 214 ( Nup2014 ) jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen NUP214 .
Funkcjonować
Kompleks porów jądrowych to masywna struktura rozciągająca się w poprzek otoczki jądrowej, tworząc bramę regulującą przepływ makrocząsteczek między jądrem a cytoplazmą . Nukleoporyny są głównymi składnikami kompleksu porów jądrowych w komórkach eukariotycznych . Gen ten należy do nukleoporyn zawierających powtórzenia FG. Białko kodowane przez ten gen jest zlokalizowane na cytoplazmatycznej powierzchni kompleksu porów jądrowych, gdzie jest wymagane do prawidłowego cyklu komórkowego progresja i transport nukleocytoplazmatyczny. Część 3' tego genu tworzy gen fuzyjny z genem DEK na chromosomie 6 w translokacji at(6,9) związanej z ostrą białaczką szpikową i zespołem mielodysplastycznym .
Struktura
Struktura N-końcowej domeny Nup214 ujawnia siedmiostrzowe fałdowanie śmigła beta, po którym następuje 30-resztowy C-końcowy wydłużony segment peptydowy (CTE). CTE składa się z powrotem na śmigło beta i wiąże się z jego dolną powierzchnią. Struktura Nup214 NTD związanego z helikazą Ddx19 w stanie związanym z ADP ujawnia molekularne podstawy interakcji między dwoma białkami. Wykazano, że konserwatywna reszta Ddx19 ma kluczowe znaczenie dla tworzenia kompleksów in vitro i in vivo. Co uderzające, powierzchnie interakcji wykazują silnie przeciwstawne potencjały powierzchniowe, przy czym powierzchnia helikazy jest dodatnio, a powierzchnia Nup214 jest naładowana ujemnie. Wykazano, że Ddx19 wiąże RNA tylko w stanie związanym z ATP, a wiązanie RNA i Nup214 NTD wzajemnie się wykluczają.
Interakcje
Wykazano, że NUP214 wchodzi w interakcje z:
Dalsza lektura
Stoffler D, Fahrenkrog B, Aebi U (czerwiec 1999). „Kompleks porów jądrowych: od architektury molekularnej do dynamiki funkcjonalnej”. Aktualna opinia w biologii komórki . 11 (3): 391–401. doi : 10.1016/S0955-0674(99)80055-6 . PMID 10395558 .
von Lindern M, Fornerod M, van Baal S, Jaegle M, de Wit T, Buijs A, Grosveld G (kwiecień 1992). „Translokacja (6; 9), związana z określonym podtypem ostrej białaczki szpikowej, powoduje fuzję dwóch genów, dek i can, oraz ekspresję chimerycznego, specyficznego dla białaczki mRNA dek-can” . Biologia molekularna i komórkowa . 12 (4): 1687–97. doi : 10.1128/mcb.12.4.1687 . PMC 369612 . PMID 1549122 .
Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych ludzkich genów. I. Sekwencje kodujące 40 nowych genów (KIAA0001-KIAA0040) wydedukowane na podstawie analizy losowo pobranych klonów cDNA z ludzkiej niedojrzałej szpikowej linii komórkowej KG-1” . Badania DNA . 1 (1): 27–35. doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID 7584026 .
Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych ludzkich genów. I. Sekwencje kodujące 40 nowych genów (KIAA0001-KIAA0040) wydedukowane na podstawie analizy losowo pobranych klonów cDNA z ludzkiej niedojrzałej linii komórek szpikowych KG-1 (suplement)” . Badania DNA . 1 (1): 47–56. doi : 10.1093/dnares/1.1.47 . PMID 7584028 .
Pilz A, Woodward K, Povey S, Abbott C (styczeń 1995). „Porównawcze mapowanie 50 loci ludzkiego chromosomu 9 u myszy laboratoryjnej”. Genomika . 25 (1): 139–49. doi : 10.1016/0888-7543(95)80119-7 . PMID 7774911 .
Stutz F, Izaurralde E, Mattaj IW, Rosbash M (grudzień 1996). „Rola domen powtórzeń FG nukleoporyny w eksporcie białka i RNA wirusa ludzkiego niedoboru odporności typu 1 Rev z jądra” . Biologia molekularna i komórkowa . 16 (12): 7144–50. doi : 10.1128/mcb.16.12.7144 . PMC 231718 . PMID 8943370 .
Fornerod M, van Deursen J, van Baal S, Reynolds A, Davis D, Murti KG, Fransen J, Grosveld G (luty 1997). „Ludzki homolog CRM1 drożdży znajduje się w dynamicznym podkompleksie z CAN / Nup214 i nowym składnikiem porów jądrowych Nup88” . Dziennik EMBO . 16 (4): 807–16. doi : 10.1093/emboj/16.4.807 . PMC 1169681 . PMID 9049309 .
Yaseen NR, Blobel G (kwiecień 1997). „Klonowanie i charakterystyka ludzkiej karioferyny beta3” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (9): 4451-6. Bibcode : 1997PNAS...94.4451Y . doi : 10.1073/pnas.94.9.4451 . PMC20743 . _ PMID 9114010 .
Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (maj 1997). „Karyoferyna beta2 pośredniczy w imporcie jądrowym białka wiążącego mRNA” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (10): 5055–60. Bibcode : 1997PNAS...94.5055B . doi : 10.1073/pnas.94.10.5055 . PMC24630 . _ PMID 9144189 .
Bastos R, Ribas de Pouplana L, Enarson M, Bodoor K, Burke B (czerwiec 1997). „Nup84, nowa nukleoporyna, która jest związana z CAN / Nup214 na cytoplazmatycznej powierzchni kompleksu porów jądrowych” . Journal of Cell Biology . 137 (5): 989-1000. doi : 10.1083/jcb.137.5.989 . PMC 2136229 . PMID 9166401 .
Boer J, Bonten-Surtel J, Grosveld G (marzec 1998). „Nadekspresja nukleoporyny CAN / NUP214 indukuje zatrzymanie wzrostu, defekty transportu nukleocytoplazmatycznego i apoptozę” . Biologia molekularna i komórkowa . 18 (3): 1236–47. doi : 10.1128/mcb.18.3.1236 . PMC 108836 . PMID 9488438 .
Bogerd HP, Echarri A, Ross TM, Cullen BR (listopad 1998). „Hamowanie funkcji ludzkiego wirusa niedoboru odporności Rev i ludzkiego wirusa białaczki limfocytów T Rex, ale nie konstytutywnej aktywności elementu transportowego wirusa małpy Mason-Pfizer, przez zmutowaną ludzką nukleoporynę skierowaną na Crm1” . Dziennik wirusologii . 72 (11): 8627–35. doi : 10.1128/JVI.72.11.8627-8635.1998 . PMC 110274 . PMID 9765402 .
Zolotukhin AS, Felber BK (styczeń 1999). „Nukleoporyny nup98 i nup214 uczestniczą w eksporcie jądrowym ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 Rev” . Dziennik wirusologii . 73 (1): 120–7. doi : 10.1128/JVI.73.1.120-127.1999 . PMC 103815 . PMID 9847314 .
Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Panté N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Séraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (sierpień 1999). „Dbp5, białko DEAD-box wymagane do eksportu mRNA, jest rekrutowane do włókienek cytoplazmatycznych kompleksu porów jądrowych poprzez konserwatywną interakcję z CAN / Nup159p” . Dziennik EMBO . 18 (15): 4332–47. doi : 10.1093/emboj/18.15.4332 . PMC 1171509 . Identyfikator PMID 10428971 .
Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, Panté N, Ribbeck K, von Kobbe C, Kutay U, Wilm M, Görlich D, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (styczeń 2000). „Domena C-końcowa TAP oddziałuje z kompleksem porów jądrowych i promuje eksport określonych substratów RNA zawierających CTE” . RNA . 6 (1): 136–58. doi : 10.1017/S1355838200991994 . PMC 1369901 . PMID 10668806 .
Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, Braun IC, Kutay U, Carmo-Fonseca M, Bork P, Izaurralde E (grudzień 2000). „TAP (NXF1) należy do wielogenowej rodziny przypuszczalnych czynników eksportu RNA o konserwowanej architekturze modułowej” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (23): 8996–9008. doi : 10.1128/MCB.20.23.8996-9008.2000 . PMC86553 . _ PMID 11073998 .
Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (marzec 2001). „Wymagania dotyczące kofaktorów dla eksportu jądrowego elementu odpowiedzi Rev (RRE) i konstytutywnego elementu transportowego (CTE) zawierającego retrowirusowe RNA. Nieoczekiwana rola aktyny” . Journal of Cell Biology . 152 (5): 895–910. doi : 10.1083/jcb.152.5.895 . PMC 2198816 . PMID 11238447 .
Galeria WPB
2oit : Struktura krystaliczna N-końcowej domeny ludzkiego protoonkogenu Nup214/CAN