Patellamid A
|
|
| Identyfikatory | |
|---|---|
|
Model 3D ( JSmol )
|
|
| ChemSpider | |
|
Identyfikator klienta PubChem
|
|
|
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )
|
|
|
|
|
|
| Nieruchomości | |
| C 35 H 50 N 8 O 6 S 2 | |
| Masa cząsteczkowa | 742,96 g·mol -1 |
|
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).
|
|
Patellamid A jest naturalnym produktem peptydowym wytwarzanym przez Prochloron didemni , sinicowego symbionta Lissoclinum patella i został po raz pierwszy wyizolowany w 1981 roku. Patellamid A jest jednym z wielu peptydów didemnidowych. Inne blisko spokrewnione peptydy obejmują rzepki B, C i D oraz trunkamid. Patellamid i trunkamid wykazują umiarkowaną cytotoksyczność i aktywność wobec wielolekoopornych linii komórkowych raka .
Historia
Patellamid A został po raz pierwszy wyizolowany w 1981 roku z osłonicy L. patella zebranej z raf wyspy Korror na Wyspach Palau . L. patella jest bogatym źródłem naturalnych produktów peptydowych. Poza patellamidami, z L. patella wyizolowano lissoklinamidy, streetclamid, ulitiacyklamid i ascidiacyklamid . Absolutną stereochemię określono później za pomocą krystalografii rentgenowskiej .
Biosynteza
Patellamid A pochodzi z peptydu rybosomalnego , co czyni go członkiem nadrodziny produktów naturalnych RiPP . Ustalono to po tym, jak sekwencjonowanie genomu P. didemi wykazało brak nierybosomalnych syntetaz peptydowych. Biosyntetyczny klaster genów rzepki A zawiera geny patA , patB , patC , patD , patE , patF i patG . Te geny po wprowadzeniu do E. coli , powodują produkcję rzepki A, ostatecznie potwierdzając ich odpowiedzialność za biosyntezę rzepki A. Gen patE koduje peptyd prekursorowy, który zawiera pierwszorzędowe sekwencje rzepki A i C. Został zaproponowany przez Schmidta i in. że ten prepatellamid jest heterocyklizowany, tworząc pierścienie oksazolinowe i tiazolinowe przez PatD2. Proponuje się, aby PatG1 był następnie zaangażowany w utlenianie pierścieni tiazolinowych do tiazolu pierścienie znajdujące się w rzepce A. Peptyd jest następnie rozszczepiany, prawdopodobnie przez PatA lub PatG2, i cyklizowany, cyklizacja jest prawdopodobnie wspomagana przez adenylację przez PatD1, tworząc dwa cykliczne peptydy, rzepki A i C. Chociaż wszystkie aminokwasy stosowane w produkcji rzepki A to L-aminokwasy, niektóre z aminokwasów występujących w naturalnym rzepce A to D-epimery. Sugeruje się, że epimeryzacja tych aminokwasów zachodzi spontanicznie. Zostało to określone przez porównanie z podobnym systemem, lissoklinamidem 7.
- ^ a b Irlandia, C .; Durso, A.; Newman, R.; Haker, D. (1982). „Cykliczne peptydy przeciwnowotworowe z osłonicy morskiej rzepki Lissoclinum”. J.Org. chemia . 47 (10): 1807–1811. doi : 10.1021/jo00349a002 .
- _ ^ abcde Schmidt , E .; Nelson, J.; Rasko, D.; Sudek S.; Eisen, J.; Haygood, M.; Ravel, J. (2005). „Biosynteza rzepki a i C na szlaku podobnym do mikrocyny w Prochloron didemni, sinicowym symbioncie Lissoclinum patella” . proc. Natl. Acad. nauka . 102 (20): 7315–7320. Bibcode : 2005PNAS..102.7315S . doi : 10.1073/pnas.0501424102 . PMC 1091749 . PMID 15883371 .
- Bibliografia _ Hawkins, C.; Lavin, M.; Mccaffrey, E.; Parry, D.; Vandenbrenk, A.; Wattersa D. (1989). „Nowe cykliczne peptydy o działaniu cytotoksycznym z rzepki ascidian Lissoclinum”. J. Med. chemia . 32 (6): 1349-1354. doi : 10.1021/jm00126a034 . PMID 2724305 .
- ^ W, Y .; Doi, M.; Inoue, M.; Ishida, T. (1994). „Patellamid A, cytotoksyczny cykliczny peptyd z ascidian rzepki Lissoclinum” . Acta Crystallogr . 50 (3): 432–434. doi : 10.1107/s010827019300811x . PMID 8018309 .
- Bibliografia _ Długi, P.; Starcevic, A.; Hranueli, D.; Jaspars, M. (2006). „Spontaniczność w szlaku biosyntezy rzepki”. Org. Biomol. chemia . 4 (4): 631–638. CiteSeerX 10.1.1.1027.4259 . doi : 10.1039/b515938e . PMID 16467937 .