Peduowirus
| Peduovirus | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Duplodnaviria |
| Królestwo: | Heunggongvirae |
| Gromada: | Urowiricota |
| Klasa: | Caudoviricetes |
| Zamówienie: | Caudovirales |
| Rodzina: | Myoviridae |
| Podrodzina: | Peduovirinae |
| Rodzaj: | Peduowirus |
Peduowirus (znany również jako fagi podobne do P2 i wirusy podobne do P2) to rodzaj wirusów z rzędu Caudovirales , w rodzinie Myoviridae , w podrodzinie Peduovirinae . Bakterie służą jako naturalni gospodarze, a przenoszenie odbywa się poprzez bierną dyfuzję. Istnieje 15 gatunków w tym rodzaju.
Taksonomia
Rozpoznawane są następujące gatunki:
- Wirus Citrobacter R18C
- Wirus Escherichia 12474III
- Wirus Escherichia fiAA91ss
- Wirus Escherichia magyaro
- Wirus Escherichia P2
- Wirus Escherichia P2-2H1
- Wirus Escherichia P2-2H4
- Wirus Escherichia P2-4A7b
- Wirus Escherichia P2-4B2
- Wirus Escherichia P2-4C9
- Wirus Escherichia P2-4E6b
- Wirus Escherichia pro147
- Wirus Escherichia pro483
- Wirus Escherichia Wphi
- Wirus Yersinia L413C
Struktura
Peduowirusy są bezotoczkowe , z głową i ogonem. Głowa dwudziestościanu ma średnicę około 60 nm i prawoskrętną (T = 7), złożoną z 72 kapsomerów. Ogon ma około 135 nm długości, 18 nm szerokości, ma 6 krótkich, zagiętych włókien ogona. Ogon jest zamknięty w pochwie, która po skurczeniu rozluźnia się i ślizga wokół rdzenia ogona.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Peduowirus | Orzeł reszka | T=7 dekstro | Bez koperty | Liniowy | jednoczęściowy |
Genom
Dziewięć genomów wirusów zostało w pełni zsekwencjonowanych i jest dostępnych na stronie internetowej NCBI (chociaż fag Salmonella Fels-2 jest obecnie wymieniony jako niesklasyfikowany). Mają od 30 000 do 39 000 nukleotydów i zawierają od 40 do 51 białek. Kompletne genomy, jak również kilka dodatkowych „niesklasyfikowanych” genomów wirusów, są dostępne w [1]
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wirus przyczepia się do komórki gospodarza za pomocą włókien ogona i wyrzuca wirusowe DNA do cytoplazmy gospodarza poprzez skurcz osłonki ogona. Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Po zreplikowaniu genów wirusowych prokapsyd jest składany i pakowany. Ogon jest następnie składany, a dojrzałe wiriony są uwalniane poprzez lizę i białka holin/endolizyna/spanin.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Peduowirus | Bakteria | Nic | Zastrzyk | Liza | Cytoplazma | Cytoplazma | Bierna dyfuzja |
Historia
Według raportu ICTV z 1996 roku, rodzaj P2likevirus został po raz pierwszy zaakceptowany pod nazwą P2-podobne fagi w rodzinie Myoviridae , nieprzypisany do podrodziny. Nazwa rodzaju została zmieniona na wirusy podobne do P2 w 7. raporcie ICTV w 1999 r. Została przeniesiona do podrodziny Peduovirinae po jej powstaniu w latach 2010-11. W następnym roku (2012) nazwa rodzaju została zmieniona na P2likevirus . Raporty te są dostępne za pośrednictwem ICTV tutaj: 1996 , 1999 , 2010 , 2012 . Rodzaj został później przemianowany na Peduovirus” .
Linki zewnętrzne