Phikzwirus
|
|
| Phikzvirus | |
|---|---|
| Mikrografia elektronowa wirusa Pseudomonas phiKZ wirion | |
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Duplodnaviria |
| Królestwo: | Heunggongvirae |
| Gromada: | Urowiricota |
| Klasa: | Caudoviricetes |
| Zamówienie: | Caudovirales |
| Rodzina: | Myoviridae |
| Rodzaj: | Phikzwirus |
Phikzvirus (synonim: wirusy podobne do PhiKZ , przed 2015 Phikzlikevirus ) to rodzaj wirusów z rzędu Caudovirales , z rodziny Myoviridae . Bakterie służą jako naturalni gospodarze. W tym rodzaju występują trzy gatunki.
Fagi z tego rodzaju są uważane za fagi duże lub „jumbo”. Wiadomo, że trzy fagi z tego rodzaju (φKZ, φPA3 i 201φ2-1) składają strukturę „jądra faga” podobną w funkcji do jądra komórki eukariotycznej, która zawiera DNA, a także maszynerię replikacji i transkrypcji. Struktury te zbudowane są z tubulinopodobnego białka PhuZ i białka otoczki gp105 . Zapewnia odporność na mechanizmy obronne gospodarza, takie jak enzymy restrykcyjne i systemy CRISPR -Cas.
Taksonomia
Następujące trzy gatunki są przypisane do rodzaju:
- Wirus Pseudomonas PA7
- Wirus Pseudomonas phiKZ
- Wirus Pseudomonas SL2
Struktura
Phikzwirusy są bezotoczkowe , z głową i ogonem. Główka ma symetrię dwudziestościenną (T=27), o stosunkowo dużej średnicy około 140 nm. Ogon ma około 160 nm długości i 35 nm szerokości.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Phikzwirus | Orzeł reszka | T=27 | Bez koperty | Okólnik | jednoczęściowy |
Genom
Genomy są okrągłe, mają około 280 kb długości. Dwa z trzech gatunków zostały w pełni zsekwencjonowane i są dostępne w ICTV. Wynoszą one od 211k do 280k nukleotydów, z 201 do 306 białek. Pełne genomy, wraz z jednym innym podobnym, ale niesklasyfikowanym genomem, są dostępne tutaj .
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wirus przyczepia się do komórki gospodarza za pomocą włókien końcowych i wyrzuca wirusowe DNA do cytoplazmy gospodarza poprzez skurcz osłonki ogona. Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Po zreplikowaniu genów wirusowych prokapsyd jest składany i pakowany. Ogon jest następnie składany, a dojrzałe wiriony są uwalniane poprzez lizę. Bakterie służą jako naturalny gospodarz. Drogi transmisji to dyfuzja pasywna.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Phikzwirus | Bakteria | Nic | Zastrzyk | Liza | Cytoplazma | Cytoplazma | Bierna dyfuzja |
Historia
Według raportu ICTV z 2009 r., rodzaj wirusów podobnych do PhiKZ został po raz pierwszy zaakceptowany jako nowy rodzaj, w tym samym czasie, co wszystkie trzy zawarte w nim gatunki. Ta propozycja jest dostępna tutaj . W 2012 roku nazwa została zmieniona na Phikzlikevirus . Ta propozycja jest dostępna tutaj . Rodzaj został później przemianowany na Phikzvirus .
Linki zewnętrzne