Potexwirus

Wirus Potex
Objawy zaburzenia wybarwienia spowodowane przez wirusa mozaiki narcyza (NMV) u żonkili (A, B) i kwiatów normalnych (C)
Klasyfikacja wirusa
(nierankingowe):	Wirus
Królestwo :	Rybowiria
Królestwo:	Orthornavirae
Gromada:	Kitrinowiricota
Klasa:	Alsuviricetes
Zamówienie:	Tymovirales
Rodzina:	Alphaflexiviridae
Rodzaj:	Potexwirus

Potexvirus to rodzaj patogennych wirusów z rzędu Tymovirales , z rodziny Alphaflexiviridae . Rośliny pełnią rolę naturalnych żywicieli. Rodzaj ten obejmuje 48 gatunków, z czego trzy należą do podrodzaju. Choroby związane z tym rodzajem obejmują: objawy mozaiki i plamistości pierścieniowej. Nazwa rodzaju pochodzi od POT ato X ).

Taksonomia

Potexvirus zawiera jeden podrodzaj, który składa się z trzech gatunków i 45 dodatkowych gatunków nieprzypisanych do podrodzaju. Do rodzaju przypisano 48 gatunków:

• Podrodzaj: Mandariwirus
  • Wirus związany z żółtą plamistością cytrusową
  • Wirus oczyszczający żyły cytrusowo-żółte
  • Indyjski wirus pierścieniowej plamistości cytrusów

Następujące gatunki nie są przypisane do podrodzaju:

• Wirus Allium X
• Wirus Alstremerii X
• Wirus mozaiki Alternanthera
• Wirus bezobjawowy ambrozji 1
• Wirus szparagów 3
• Wirus mozaiki Babaco
• Wirus mozaiki bambusowej
• Wirus kaktusa X
• Bezobjawowy wirus kolumbijski manioku
• Wirus mozaiki zwyczajnej manioku
• Wirus manioku X
• Wirus żółtej mozaiki koniczyny
• Wirus Cnidium X
• Wirus mozaiki cymbidium
• Wirus związany z żółtą plamistością Euonymus
• Wirus żółtych żył Euonymus
• Wirus mozaiki wyczyńca
• Wirus Hosta X
• Wirus pierścieniowej plamistości hortensji
• Łagodny wirus mozaiki Lagenaria
• Wirus sałaty X
• Wirus lilii X
• Wirus mozaiki Malwy
• Wirus mięty X
• Wirus mozaiki narcyza
• Wirus Neryny X
• Wirus Opuntii X
• Wirus mozaiki papai
• Wirus mozaiki pepino
• Wirus Phaius X
• Wirus Pitaya X
• Wirus mozaiki Plantago Asiatica
• Wirus babki X
• Wirus mozaiki ziemniaka aucuba
• Wirus ziemniaka X
• Wirus Schlumbergera X
• Wirus mozaiki Senny
• Wirus łagodnej żółtej krawędzi truskawki
• Wirus czerwonej mozaiki Tamus
• Wirus tulipana X
• Wirus trawy żółwiowej X
• Wirus waniliowy X
• Wirus mozaiki koniczyny białej
• Wirus Yam X
• Wirus Zygocactus X

Wirusologia

wirionu może się znacznie różnić (między 470-1000 nanometrów lub więcej) , a średnica wynosi 12-13 nm. Skok helisy odpowiada helisie podstawowej 3,3-3,7 nm (8-9 kopii białka płaszcza na obrót). Jest bezotoczkowy, giętki i nitkowaty. Sama sierść składa się z 1000-1500 kopii białka płaszcza.

Genom jest liniowy, ma długość 5,9-7 kilozasad, z zamkniętym końcem 5' i poliadenylowanym końcem 3'. Genom koduje 5 białek. Od lewej do prawej te białka to: białko replikacji wirusa, które składa się z domeny enzymu czapeczkującego, domeny podobnej do helikazy, polimerazy RNA zależnej od RNA , trzech białek – potrójnego bloku genowego (TGB) 1, 2 i 3 – oraz białko płaszcza.

Rodzaj	Struktura	Symetria	Kapsyd	Układ genomowy	Segmentacja genomu
Potexwirus	Nitkowaty		Bez koperty	Liniowy	Jednostronny

RNA ulega translacji, dając początek wirusowej polimerazie RNA. To z kolei wytwarza matrycę o ujemnej nici, z której generowana jest seria subgenomowych RNA. Te subgenomowe RNA ulegają następnie translacji do białek wirusowych.

Koniec 5' ma długość około 80 nukleotydów i zazwyczaj zaczyna się od sekwencji GAAAA.

Oprócz aktywności polimerazy RNA, wirusowa polimeraza RNA (masa cząsteczkowa ~150 kilodaltonów ) wykazuje także aktywność metylotransferazy i helikazy RNA .

Białka TGB są konserwatywne z rodzajów Allexivirus , Carlavirus , Foveavirus , Furovirus , Hordeivirus , Pecluvirus , Pomovirus i Potexvirus. Ich funkcje są przedmiotem aktywnych badań.

TGB 1 (masa cząsteczkowa 23 kDa) jest białkiem wielofunkcyjnym. Ma aktywność helikazy RNA i wydaje się, że bierze udział w przemieszczaniu się między komórkami.

Białka TGB 2 (masa cząsteczkowa 11 kDa) i TGB 3 (masa cząsteczkowa 10 kDa) łączą się z retikulum endoplazmatycznym .

Białko płaszcza ma masę cząsteczkową ~25 kDa.

Nieulegający translacji region 3' ma długość ~100 nukleotydów.

Koło życia

Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza następuje poprzez penetrację komórki gospodarza. Replikacja przebiega zgodnie z modelem replikacji wirusa o dodatniej nici RNA. Metodą transkrypcji jest transkrypcja wirusa dodatniej nici RNA. Tłumaczenie odbywa się poprzez nieszczelne skanowanie. Wirus opuszcza komórkę gospodarza poprzez trójstronny ruch wirusa nieprowadzony przez kanaliki. Wirus przenoszony jest za pośrednictwem wektora (owadów). Drogi transmisji są wektorowe i mechaniczne.

Rodzaj	Dane gospodarza	Tropizm tkankowy	Szczegóły wpisu	Szczegóły wydania	Miejsce replikacji	Miejsce montażu	Przenoszenie
Potexwirus	Rośliny	Nic	Ruch wirusowy; inokulacja mechaniczna	Ruch wirusowy	Cytoplazma	Cytoplazma	Owady

Zastępy niebieskie

Znanymi żywicielami są różne rośliny kwitnące .

Dystrybucja

Wydaje się, że wirusy te występują na całym świecie.

Linki zewnętrzne

• „Rodzaj: Potexvirus - Alphaflexiviridae - wirusy RNA o dodatniej sensie” . Międzynarodowy Komitet Taksonomii Wirusów (ICTV) . Źródło 13 listopada 2020 r .
• Strefa wirusowa: wirus Potex