Białko S100-A1
S100A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, S100, S100-alfa, S100A, S100 białko wiążące wapń A1, S100 białko wiążące wapń A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Białko S100-A1 , znane również jako białko A1 wiążące wapń S100, jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen S100A1 . S100A1 ulega silnej ekspresji w mięśniu sercowym i szkieletowym i lokalizuje się w krążkach Z i siateczce sarkoplazmatycznej . S100A1 okazał się obiecujący jako skuteczny kandydat do terapii genowej w leczeniu tkanki serca po zawale mięśnia sercowego .
Struktura
S100A1 należy do rodziny białek S100 ulegających ekspresji w mięśniu sercowym , mięśniu szkieletowym i mózgu, o największej gęstości w liniach Z i siateczce sarkoplazmatycznej . S100A1 zawiera 4 motywy wiążące wapń z ręką EF w swojej dimeryzowanej formie i może występować jako hetero lub homo dimer . Hodimer S100A1 ma wysokie powinowactwo (zakres nanomolowy lub mniejsze) i powstaje poprzez hydrofobowość upakowanie wiązki 4-helisy typu X utworzonej pomiędzy helisami 1, 1', 4 i 4'. Informacje strukturalne dotyczące spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego białka dotyczące homodimerycznej postaci tego białka pokazują, że każdy monomer jest helikalny i zawiera dwie pętle wiążące wapń z ręką EF ; jedna na N-końcu i kanoniczna ręka EF na C-końcu, posiadająca wyższe powinowactwo do wapnia ( stała dysocjacji około 20 mikromoli). Dwie ręce EF domeny sąsiadują ze sobą w przestrzeni trójwymiarowej i są ze sobą połączone poprzez krótki region arkusza beta (reszty 27–29 i 68–70).
Po związaniu wapnia, helisa 3 S100A1 zmienia orientację z względnie antyrównoległej do helisy 4 na mniej więcej prostopadłą. Ta zmiana konformacyjna różni się od większości wskazówek EF tym, że porusza się helisa wchodząca, a nie helisa wychodząca. Ta zmiana konformacyjna odsłania dużą hydrofobową kieszeń pomiędzy helisą 3, 4 i regionem zawiasowym S100A1, która bierze udział praktycznie we wszystkich zależnych od wapnia interakcjach z docelowym białkiem. Wydaje się, że te właściwości biofizyczne są dobrze zachowane w całej rodzinie białek S100. Helix 3, 4 i region zawiasowy to obszary najbardziej rozbieżne pomiędzy poszczególnymi białkami S100, dlatego jest prawdopodobne, że sekwencja tych regionów ma kluczowe znaczenie w precyzyjnym dostrajaniu zależnego od wapnia wiązania docelowego przez białka S100. S-nitrozylacja S100A1 w Cys 85 reorganizuje konformację S100A1 na C-końcowej helisie i łączniku łączącym dwie domeny dłoni EF .
Najdokładniejszą strukturę roztworu ludzkiego białka apo-S100A1 o wysokiej rozdzielczości (kod dostępu PDB: 2L0P) określono za pomocą spektroskopii NMR w 2011 roku.
Geny S100 obejmują co najmniej 19 członków, którzy są zlokalizowani jako klaster na chromosomie 1q21.
Funkcjonować
Białka S100 są zlokalizowane w cytoplazmie i/lub jądrze szerokiego zakresu komórek i biorą udział w regulacji szeregu procesów komórkowych, takich jak progresja cyklu komórkowego i różnicowanie . Białko to może działać w stymulacji indukowanego Ca2 + uwalniania Ca2 + , hamowaniu tworzenia mikrotubul i hamowaniu fosforylacji za pośrednictwem kinazy białkowej C.
S100A1 ulega ekspresji podczas rozwoju w prymitywnym sercu w 8. dniu embrionalnym na poziomach podobnych dla przedsionków i komór . W miarę postępu rozwoju do 17,5 dnia embrionalnego ekspresja S100A1 przesuwa się do niższego poziomu w przedsionkach i wyższego poziomu w mięśniu sercowym .
Wykazano, że S100A1 jest regulatorem kurczliwości mięśnia sercowego. Nadekspresja S100A1 poprzez adenowirusa w kardiomiocytach dorosłego królika lub transgeniczna mysia S100A1 o ograniczonym działaniu serca, zwiększona kurczliwość serca poprzez zwiększenie sarkoplazmatycznych stanów przejściowych i wychwytu wapnia w siateczce, zmianę wrażliwości na wapń i współdziałanie miofibryli , zwiększenie aktywności SERCA2A i zwiększenie uwalniania wapnia indukowanego wapniem . W szczególności S100A1 zwiększa wzmocnienie sprzężenia wzbudzenia-skurczu i zmniejsza częstotliwość iskry wapniowej w kardiomiocytach . Wykazano , że zwiększenie wapnia przez sarkolemę przez kanał wapniowy typu L przez S100A zależy od kinazy białkowej A. Wpływ S100A1 na białka miofilamentu może zachodzić poprzez Titin ; Wykazano, że S100A1 oddziałuje z regionem PEVK Titin w wapniu sposób zależny, a jego wiązanie zmniejsza siłę w teście motoryki in vitro, co sugeruje, że S100A może modulować napięcie bierne oparte na titynie przed skurczem . U myszy z ablacją genu S100A1 (S100A1-/-) rezerwa serca po stymulacji beta-adrenergicznej była upośledzona, wykazując zmniejszoną szybkość skurczu i relaksacji, a także zmniejszoną wrażliwość na wapń . Jednakże S100A1-/- nie wykazał ostatecznego przerostu serca ani poszerzenia komór serca u starszych myszy.
W zwierzęcych modelach choroby wykazano zmianę poziomu białka S100A1 w przerośniętej tkance prawej komory w modelu nadciśnienia płucnego ; kilka typów tkanek ( mózg , mięśnie szkieletowe i mięsień sercowy ) w modelu cukrzycy typu I ; Wykazano, że S100A1 jest regulatorem programu genetycznego leżącego u podstaw przerostu serca , ponieważ S100A1 hamuje stymulację alfa1-adrenergiczną komórek przerostowych geny, w tym MYH7 , ACTA1 i S100B . W szczurzym modelu zawału mięśnia sercowego dowieńcowy transfer genu adenowirusa S100A1 przywrócił stany przejściowe i obciążenie sarkoplazmatycznego siateczkowego wapnia , znormalizował wewnątrzkomórkowe stężenie sodu , odwrócił patologiczną ekspresję programu genowego płodu, przywrócił dopływ energii, znormalizował funkcję skurczową, zachował rezerwę inotropową i obniżył przerost serca 1 tydzień po zawale mięśnia sercowego . Na poparcie z adenowirusami , myszy transgeniczne z nadekspresją S100A1 poddane zawałowi mięśnia sercowego wykazywały zachowaną funkcję skurczową, zniesienie apoptozy , zachowany cykl wapniowy siateczki sarkoplazmatycznej i sygnalizację beta adrenergiczną , zapobieganie przerostowi i niewydolności serca , jak również przedłużone przeżycie w porównaniu z nie- kontrole transgeniczne.
S100A1 zidentyfikowano także jako nowy regulator angiogenezy komórek śródbłonka po niedokrwieniu , ponieważ pacjenci z niedokrwieniem kończyn wykazywali obniżoną ekspresję S100A1 w niedotlenionej tkance.
W komórkach melanocytowych ekspresja genu S100A1 może być regulowana przez MITF .
Znaczenie kliniczne
S100A1 wykazał skuteczność w leczeniu objawów niewydolności serca w dużych, przedklinicznych modelach i ludzkich kardiomiocytach, a zatem jest bardzo obiecujący w badaniach klinicznych.
Zmniejszoną ekspresję tego białka powiązano z kardiomiopatią , a terapia oparta na urządzeniach wspomagających lewą komorę nie przywraca poziomów S100A1 u pacjentów. S100A1 okazał się obiecujący jako wczesny biomarker diagnostyczny ostrego niedokrwienia mięśnia sercowego , wykazując wyraźny przebieg czasowy w ludzkim osoczu po zdarzeniu niedokrwiennym w porównaniu z tradycyjnymi markerami kinazy kreatynowej , CKMB i troponiny I. Tę uwolnioną z urazu zewnątrzkomórkową pulę S100A1 badano w noworodkowych kardiomiocytach mysich i wykazano, że zapobiega apoptozie poprzez szlak zależny od ERK1/2, co sugeruje, że uwalnianie S100A1 z uszkodzonych komórek jest wewnętrznym mechanizmem przeżycia żywotnego mięśnia sercowego. S100 okazał się również obiecujący jako biomarker niekontrolowanej reoksygenacji hiperoksycznej podczas bajpasu krążeniowo-oddechowego u niemowląt z siniczą chorobą serca i u dorosłych. Wykazano, że transfer genu S100A1 do zmodyfikowanej tkanki serca zwiększa wydajność skurczową implantów tkankowych, co sugeruje, że S100A1 może skutecznie ułatwiać terapię zastępczą tkanką serca w niewydolności serca pacjenci. Jednakże skuteczność kliniczna tej strategii pozostaje do ustalenia. Ponadto wiadomo, że wiele leków, w tym Pentamidyna , Amlexanox , Olopatadyna , Cromolyn i Propanolol , wiąże się z S100A1, chociaż ich powinowactwo często mieści się w średnim zakresie mikromolowym.
Interakcje
S100 współpracuje z
Dalsza lektura
- Zimmer DB, Cornwall EH, Landar A, Song W (1995). „Rodzina białek S100: historia, funkcja i ekspresja”. Biuletyn badań mózgu . 37 (4): 417–29. doi : 10.1016/0361-9230(95)00040-2 . PMID 7620916 . S2CID 34720854 .
- Schäfer BW, Heizmann CW (kwiecień 1996). „Rodzina S100 białek wiążących wapń EF-hand: funkcje i patologia”. Trendy w naukach biochemicznych . 21 (4): 134–40. doi : 10.1016/S0968-0004(96)80167-8 . PMID 8701470 .
- Garbuglia M, Verzini M, Sorci G, Bianchi R, Giambanco I, Agneletti AL, Donato R (październik 1999). „Białka modulowane wapniem, S100A1 i S100B, jako potencjalne regulatory dynamiki włókien pośrednich typu III” . Brazylijski dziennik badań medycznych i biologicznych . 32 (10): 1177–85. doi : 10.1590/s0100-879x1999001000001 . PMID 10510252 .
- Engelkamp D, Schäfer BW, Erne P, Heizmann CW (październik 1992). „S100 alfa, CAPL i CACY: klonowanie molekularne i analiza ekspresji trzech białek wiążących wapń z ludzkiego serca”. Biochemia . 31 (42): 10258–64. doi : 10.1021/bi00157a012 . PMID 1384693 .
- Morii K, Tanaka R, Takahashi Y, Minoshima S, Fukuyama R, Shimizu N, Kuwano R (luty 1991). „Struktura i przypisanie chromosomów ludzkich genów podjednostek alfa i beta S100”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 175 (1): 185–91. doi : 10.1016/S0006-291X(05)81218-5 . PMID 1998503 .
- Baudier J, Glasser N, Gerard D (czerwiec 1986). „Jony wiążące się z białkami S100. I. Właściwości wiązania wapnia i cynku białek S100 alfa alfa, S100a (alfa beta) i S100b (beta beta) mózgu bydła: Zn2+ reguluje wiązanie Ca2+ z białkiem S100b” . Journal of Biological Chemistry . 261 (18): 8192–203. doi : 10.1016/S0021-9258(19)83895-4 . PMID 3722149 .
- Kato K, Kimura S (październik 1985). „Białko S100ao (alfa alfa) znajduje się głównie w sercu i mięśniach prążkowanych”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Przedmioty ogólne . 842 (2–3): 146–50. doi : 10.1016/0304-4165(85)90196-5 . PMID 4052452 .
- Schäfer BW, Wicki R, Engelkamp D, Mattei MG, Heizmann CW (luty 1995). „Izolacja klonu YAC obejmującego klaster dziewięciu genów S100 na ludzkim chromosomie 1q21: uzasadnienie nowej nomenklatury rodziny białek wiążących wapń S100”. Genomika . 25 (3): 638–43. doi : 10.1016/0888-7543(95)80005-7 . PMID 7759097 .
- Engelkamp D, Schäfer BW, Mattei MG, Erne P, Heizmann CW (lipiec 1993). „Sześć genów S100 jest skupionych na ludzkim chromosomie 1q21: identyfikacja dwóch genów kodujących dwa wcześniej niezgłaszane białka wiążące wapń S100D i S100E” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 90 (14): 6547–51. Kod Bib : 1993PNAS...90.6547E . doi : 10.1073/pnas.90.14.6547 . PMC 46969 . PMID 8341667 .
- Garbuglia M, Verzini M, Giambanco I, Spreca A, Donato R (luty 1996). „Wpływ białek wiążących wapń (S-100a (o), S-100a, S-100b) na składanie desminy in vitro”. Dziennik FASEB . 10 (2): 317–24. doi : 10.1096/fasebj.10.2.8641565 . PMID 8641565 . S2CID 9718288 .
- Landar A, Caddell G, Chessher J, Zimmer DB (wrzesień 1996). „Identyfikacja białka docelowego S100A1 / S100B: fosfoglukomutaza”. Wapń komórkowy . 20 (3): 279–85. doi : 10.1016/S0143-4160(96)90033-0 . PMID 8894274 .
- Remppis A, Greten T, Schäfer BW, Hunziker P, Erne P, Katus HA, Heizmann CW (październik 1996). „Zmieniona ekspresja białka wiążącego Ca (2+) S100A1 w ludzkiej kardiomiopatii” . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – badania komórek molekularnych . 1313 (3): 253–7. doi : 10.1016/0167-4889(96)00097-3 . PMID 8898862 .
- Treves S, Scutari E, Robert M, Groh S, Ottolia M, Prestipino G, Ronjat M, Zorzato F (wrzesień 1997). „Interakcja S100A1 z kanałem uwalniania Ca2+ (receptor ryanodyny) mięśni szkieletowych”. Biochemia . 36 (38): 11496–503. doi : 10.1021/bi970160w . PMID 9298970 .
- Groves P, Finn BE, Kuźnicki J, Forsén S (styczeń 1998). „Model docelowego wiązania białka z aktywowanymi wapniem dimerami S100” . Listy FEBS . 421 (3): 175–9. doi : 10.1016/S0014-5793(97)01535-4 . PMID 9468301 . S2CID 7749285 .
- Mandinova A, Atar D, Schäfer BW, Spiess M, Aebi U, Heizmann CW (lipiec 1998). „Wyraźna lokalizacja subkomórkowa białek S100 wiążących wapń w ludzkich komórkach mięśni gładkich i ich przeniesienie w odpowiedzi na wzrost wewnątrzkomórkowego wapnia”. Journal of Cell Science . 111 (14): 2043–54. doi : 10.1242/jcs.111.14.2043 . PMID 9645951 .
- Osterloh D, Ivanenkov VV, Gerke V (sierpień 1998). „Reszty hydrofobowe w regionie C-końcowym S100A1 są niezbędne do wiązania białka docelowego, ale nie do dimeryzacji”. Wapń komórkowy . 24 (2): 137–51. doi : 10.1016/S0143-4160(98)90081-1 . PMID 9803314 .
- Garbuglia M, Verzini M, Donato R (wrzesień 1998). „Aneksyna VI wiąże S100A1 i S100B i blokuje zdolność S100A1 i S100B do hamowania zespołów desminy i GFAP w włóknach pośrednich”. Wapń komórkowy . 24 (3): 177–91. doi : 10.1016/S0143-4160(98)90127-0 . PMID 9883272 .
- Ridinger K, Ilg EC, Niggli FK, Heizmann CW, Schäfer BW (grudzień 1998). „Skupiona organizacja genów S100 u ludzi i myszy” . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – badania komórek molekularnych . 1448 (2): 254–63. doi : 10.1016/S0167-4889(98)00137-2 . PMID 9920416 .
Linki zewnętrzne
- Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P23297 (Protein S100-A1) w PDBe-KB .