Tunawirus

Klasyfikacja wirusów
tunawirusa
(nierankingowe): Wirus
królestwo : Duplodnaviria
Królestwo: Heunggongvirae
Gromada: Urowiricota
Klasa: Caudoviricetes
Zamówienie: Caudovirales
Rodzina: Drexlerviridae
Podrodzina: Tunavirinae
Rodzaj: Tunawirus

Tunavirus (synonimy T1-podobne fagi , T1-podobne wirusy , Tunalikevirus ) to rodzaj wirusów z rzędu Caudovirales , w rodzinie Drexlerviridae . Bakterie służą jako naturalni gospodarze. Obecnie w tym rodzaju występuje 14 gatunków, w tym gatunek typowy Escherichia virus T1 .

Taksonomia

Rozpoznawane są następujące gatunki:

  • Wirus Escherichia ADB2
  • Wirus Escherichia BIFF
  • Wirus Escherichia IME18
  • Wirus Escherichia JMPW1
  • Wirus Escherichia JMPW2
  • Wirus Escherichia SH2
  • Wirus Escherichia T1
  • Wirus Shigella 008
  • Wirus Shigella ISF001
  • Wirus Shigella PSf2
  • Wirus Shigella Sfin1
  • Wirus Shigella SH6
  • Wirus Shigella Shfl1
  • Wirus Shigella ISF002

Struktura

Tunawirusy są bezotoczkowe , z głową i ogonem. Głowa ma około 60 nm średnicy. Ogon ma około 151 nm długości i 8 nm szerokości. Jest niekurczliwy, elastyczny i ma cztery krótkie, zagięte włókna końcowe.

Rodzaj Struktura Symetria Kapsyd Układ genomowy Segmentacja genomu
Tunawirus Orzeł reszka T=7 Bez koperty Liniowy jednoczęściowy

Genom

Genomy są okrągłe, mają około 50 kb długości. Gatunek typowy, wirus Escherichia T1 i pięć innych gatunków zostało w pełni zsekwencjonowanych. Wahają się między 45-51k nukleotydów, z 45-87 białek. Pełne genomy, a także dwa inne podobne, niesklasyfikowane genomy są dostępne tutaj .

Koło życia

Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wirus przyczepia się do receptora adhezyjnego FhuA komórki gospodarza za pomocą swoich włókien końcowych i wyrzuca wirusowe DNA do cytoplazmy gospodarza za pomocą systemu wyrzucania długiego, elastycznego ogona . Replikacja jest zgodna z replikacyjnym modelem transpozycji. Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Po zreplikowaniu genów wirusowych prokapsyd jest składany i pakowany. Ogon jest następnie składany, a dojrzałe wiriony są uwalniane poprzez lizę, a białka holina / endolizyna / spanina. Bakterie służą jako naturalny gospodarz. Drogi transmisji to dyfuzja pasywna.

Rodzaj Dane gospodarza Tropizm tkankowy Szczegóły wpisu Szczegóły wydania Miejsce replikacji Miejsce montażu Przenoszenie
Tunawirus Bakteria Nic Zastrzyk Liza Cytoplazma Cytoplazma Bierna dyfuzja

Historia

Według raportu ICTV z 1996 r. , rodzaj Tunalikevirus został po raz pierwszy zaakceptowany pod nazwą fagi T1-podobne , przypisane tylko do rodziny Siphoviridae . Cała rodzina została przeniesiona do zamówienia Caudovirales w 1998 r., A nazwa rodzaju została zmieniona na wirusy podobne do T1 w 7. raporcie ICTV w 1999 r. W 2012 r . Ponownie zmieniono nazwę na Tunalikevirus . Rodzaj został później przemianowany na Tunavirus i umieszczony w nowo powstałej rodzinie Drexlerviridae . [ potrzebne źródło ]

Linki zewnętrzne