Wczesne białko
Klasyfikacja białek wirusowych na wczesne lub późne zależy od ich związku z replikacją genomu . Podczas gdy wiele wirusów (takich jak HIV ) jest opisywanych jako eksprymujące wczesne i późne białka , ta definicja tych terminów jest powszechnie zarezerwowana dla wirusów DNA klasy I. (HIV ma dwa etapy ekspresji białka , ale nie są one wynikiem dwóch etapów transkrypcji otaczającej replikację, ale produkcji białka Rev , które jest wymagane do eksportu transkryptów drugiego zestawu białek transkrybowanych z jądra komórkowego .)
Białka wczesne to te, które są wytwarzane po wejściu do komórki gospodarza, ale przed replikacją . Ekspresja genów wczesnych , zwykle kodujących białka niestrukturalne, inicjuje replikację genomu i ekspresję genów późnych.
W niektórych prostszych wirusach ten wzorzec ekspresji jest jasno określony, podczas gdy w tych o bardziej złożonych genomach, takich jak herpeswirusy , te okresy ekspresji nakładają się.
Przykład
Przykładem wczesnej ekspresji genów jest ekspresja małego, średniego i dużego antygenu T kodowanego przez poliomawirusa . Środkowy antygen T nie jest wymagany do replikacji i działa wzmacniająco transkrypcję poprzez wiązanie białek gospodarza, które oddziałują z późnym promotorem. Z drugiej strony wymagany jest duży antygen T, który bezpośrednio inicjuje replikację. Wiąże wirusowe miejsce startu replikacji i rekrutuje polimerazę DNA oraz białko wiążące s/s DNA w taki sposób, że gdy jego stężenie jest wystarczająco duże, blokuje transkrypcję wczesnych genów i inicjuje replikację genomu. Działa również powodując wejście komórki gospodarza w fazę S.