ORF7b
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| białek NS7B betakoronawirusa | |||||||||
| Symbol | bCoV_NS7B | ||||||||
| Pfam | PF11395 | ||||||||
| InterPro | IPR021532 | ||||||||
| |||||||||
ORF7b to gen występujący w koronawirusach z rodzaju Betacoronavirus , który wyraża białko pomocnicze Betacoronavirus NS7b . Jest to krótkie, wysoce hydrofobowe białko transbłonowe o nieznanej funkcji .
Struktura
Białko ORF7b jest białkiem transbłonowym z pojedynczą helisą przezbłonową , której topologia błony orientuje C-koniec w cytozolu . W SARS-CoV ma 44 reszty aminokwasowe , aw SARS-CoV-2 43 reszty, z około 85% identycznością sekwencji .
Ekspresja i lokalizacja
ORF7b jest nakładającym się genem , który nakłada się na ORF7a . Białko jest prawdopodobnie wyrażane z subgenomowego RNA poprzez nieszczelne skanowanie . W SARS-CoV jest zlokalizowany w aparacie Golgiego , który wymaga sekwencji helisy transbłonowej. W SARS-CoV-2 doniesiono, że wiąże się z retikulum endoplazmatycznym .
Funkcjonować
Funkcja białka ORF7b nie jest dobrze scharakteryzowana. Nie jest niezbędny do replikacji wirusa , chociaż istnieją niespójne dowody z badań SARS-CoV na temat tego, czy jego usunięcie wpływa na replikację. W SARS-CoV zidentyfikowano włączenie do wirionów , co sugeruje, że jest to pomniejsze wirusowe białko strukturalne . Zidentyfikowano wariant SARS-CoV-2 z mutacją delecyjną w regionie ORF7b, w wyniku której powstaje białko fuzyjne między ORF7b i ORF8 , o niejasnym znaczeniu.
| Wirusowe białko strukturalne |
|
 |
|---|---|---|
|
Wirusowe białko niestrukturalne (eksprymowane z ORF1ab ) |
|
|
| Wirusowe białko dodatkowe | ||
| RNA | ||