NSP6 (rotawirus)
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NSP6 (rotawirusa). | |||||||||
| Symbol | Rota_NS6 | ||||||||
| Pfam | PF04866 | ||||||||
| InterPro | IPR006950 | ||||||||
| |||||||||
Domniemana domena transbłonowa, bardziej znana jako niestrukturalne białko 6 (NSP6), jest jednym z dwóch niestrukturalnych białek, które koduje gen 11 rotawirusa obok NSP5 . NSP6 składa się z sześciu domen transbłonowych i C-końcowego ogona. Stwierdzono, że w przeciwieństwie do innych niestrukturalnych białek rotawirusa, NSP6 ma wysoki wskaźnik obrotu i ulega całkowitej degradacji w ciągu 2 godzin od syntezy. Stwierdzono, że NSP6 jest niezależnym od sekwencji kwasy nukleinowe , o podobnym powinowactwie do ssRNA i dsRNA
Ustalono, że NSP6 pełni trzy kluczowe funkcje. Ponieważ wiadomości przepływają między organellami replikacyjnymi a retikulum endoplazmatycznym (ER), NSP6 działa jak filtr. W tym przypadku NSP6 utrudnia dostęp białek światła ER do DMV, ale umożliwia przechodzenie lipidów . Następnie NSP6 organizuje klastry DMV, ponieważ klastry DMV są zorganizowane przez NSP6, może je zrekonstruować za pomocą lipidów pochodzących z LD. Wreszcie, poprzez kompleks wiążący LD, DFCP1-RAB18 interweniuje w kontakcie kropelek lipidów (LD).
Ponieważ NSP6 jest jednym z dwóch białek niestrukturalnych, które gen 11 koduje dla NSP6, występuje zarówno w koronawirusach α, jak i β i wytwarza autofagosomy . Chociaż stwierdzono, że NSP6 wytwarza znaczną ilość autofagosomów, dzięki analizie MAP1LC3B puncta zaobserwowano, że autofagosomy wytwarzane przez NSP6 mają znacznie mniejszy rozmiar. Jak wskazuje analiza statystyczna WIPI2 puncta, wielkość autofagosomów wytwarzanych przez NSP6 jest ograniczona podczas tworzenia omegasomu . Niewielki rozmiar tych autofagosomów hamuje transport składników wirusowych do lizosomów , co może pomóc w zakażeniu koronawirusem.