polowanie

HTT
PDB 3io4 EBI.png
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Identyfikatory
, HD, IT15, huntingtyna, LOMARS
Identyfikatory zewnętrzne
ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (białko)

Lokalizacja (UCSC)
PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Huntingtyna (Htt) jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen HTT , znany również jako gen IT15 („interesujący transkrypt 15”). Zmutowany HTT jest przyczyną choroby Huntingtona (HD) i był badany pod kątem tej roli, a także jego udziału w przechowywaniu pamięci długotrwałej.

Jest zmienna w swojej strukturze, ponieważ wiele polimorfizmów genu może prowadzić do zmiennej liczby reszt glutaminy obecnych w białku. W swojej typu dzikiego (normalnej), locus polimorficzny zawiera 6-35 reszt glutaminy. Jednak u osób dotkniętych chorobą Huntingtona (dziedziczoną autosomalnie dominująco chorobą genetyczną ) locus polimorficzny zawiera ponad 36 reszt glutaminy (najwyższa zgłoszona długość powtórzeń to około 250). Jego powszechnie używana nazwa pochodzi od tej choroby; wcześniej powszechnie stosowano etykietę IT15 .

Masa białka huntingtyny zależy w dużej mierze od liczby posiadanych reszt glutaminy; przewidywana masa wynosi około 350 kDa . Ogólnie przyjmuje się, że normalna huntingtyna ma rozmiar 3144 aminokwasów. Dokładna funkcja tego białka nie jest znana, ale odgrywa ważną rolę w komórkach nerwowych . W komórkach huntingtyna może, ale nie musi, być zaangażowana w sygnalizację, transport materiałów, wiązanie białek i innych struktur oraz ochronę przed apoptozą , formą zaprogramowanej śmierci komórki . Białko huntingtyny jest wymagane do prawidłowego rozwoju przed urodzeniem . Ulega ekspresji w wielu tkankach organizmu, przy czym najwyższy poziom ekspresji obserwuje się w mózgu.

Gen

Koniec 5' (pięć głównych końców) genu HTT ma sekwencję trzech zasad DNA, cytozyna-adenina-guanina (CAG), kodującą aminokwas glutaminę , która jest wielokrotnie powtarzana. Region ten nazywany jest powtórzeniem trinukleotydu . Zwykła liczba powtórzeń CAG wynosi od siedmiu do 35 powtórzeń.

Gen HTT znajduje się na krótkim ramieniu (p) chromosomu 4 w pozycji 16.3, od pary zasad 3 074 510 do pary zasad 3 243 960.

Białko

Funkcjonować

Funkcja huntingtyny (Htt) nie jest dobrze poznana, ale bierze udział w transporcie aksonalnym . Huntingtyna jest niezbędna do rozwoju, a jej brak jest śmiertelny dla myszy. Białko to nie wykazuje homologii sekwencji z innymi białkami i ulega silnej ekspresji w neuronach i jądrach ludzi i gryzoni. Huntingtyna zwiększa ekspresję czynnika neurotroficznego pochodzenia mózgowego (BDNF) na poziomie transkrypcji, ale mechanizm, za pomocą którego huntingtyna reguluje ekspresję genów, nie został określony. Z immunohistochemii , mikroskopii elektronowej i subkomórkowego frakcjonowania cząsteczki wykazały, że huntingtyna jest związana głównie z pęcherzykami i mikrotubulami . Wydaje się, że wskazują one na funkcjonalną rolę w kotwiczeniu cytoszkieletu lub transporcie mitochondriów . Białko Htt bierze udział w przemieszczaniu pęcherzyków, ponieważ oddziałuje z HIP1, klatrynę , pośrednicząc w endocytozie , przemieszczaniu materiałów do komórki. Wykazano również, że huntingtyna odgrywa rolę w ustalaniu polarności nabłonka poprzez jej interakcję z RAB11A .

Interakcje

Stwierdzono, że huntingtyna oddziałuje bezpośrednio z co najmniej 19 innymi białkami , z których sześć jest używanych do transkrypcji, cztery do transportu, trzy do sygnalizacji komórkowej i sześć innych o nieznanej funkcji (HIP5, HIP11, HIP13, HIP15, HIP16 i CGI -125). Znaleziono ponad 100 białek oddziałujących, takich jak białko 1 związane z huntingtyną (HAP1) i białko 1 oddziałujące z huntingtyną (HIP1), które zazwyczaj znajdowano za pomocą badań przesiewowych z dwiema hybrydami i potwierdzano za pomocą immunoprecypitacji .

Białko oddziałujące Zależność długości PolyQ Funkcjonować
α-adaptyna C/ HYPJ Tak Endocytoza
Akt /PKB NIE Kinaza
CBP Tak Koaktywator transkrypcji o aktywności acetylotransferazy
CA150 NIE Aktywator transkrypcji
CIP4 Tak transdukcja sygnału zależna od cdc42
CtBP Tak Czynnik transkrypcyjny
FIP2 Nieznany Morfogeneza komórki
Grb2 Nieznany Białko wiążące receptor czynnika wzrostu
HAP1 Tak Handel membranami
HAP40 ( F8A1 , F8A2 , F8A3 ) Nieznany Nieznany
HIP1 Tak Endocytoza, proapoptoza
HIP14 /HYP-H Tak Handel ludźmi, endocytoza
N-Kor Tak Korepresor receptora jądrowego
NF-κB Nieznany Czynnik transkrypcyjny
s53 NIE Czynnik transkrypcyjny
PACSIN1 Tak Endocytoza, cytoszkielet aktynowy
DLG4 (PSD-95) Tak Gęstość postsynaptyczna 95
RASA1 (RasGAP) Nieznany Białko aktywujące GTPazę Ras
SH3GL3 Tak Endocytoza
SIN3A Tak Represor transkrypcji
Sp1 Tak Czynnik transkrypcyjny

Wykazano również, że huntingtyna wchodzi w interakcje z:

Dysfunkcja mitochondriów

Huntingtyna jest białkiem rusztowania w oksydacyjnym kompleksie odpowiedzi na uszkodzenia DNA ATM . Zmutowana huntingtyna (mHtt) odgrywa kluczową rolę w dysfunkcji mitochondriów polegającej na hamowaniu mitochondrialnego transportu elektronów , wyższych poziomów reaktywnych form tlenu i zwiększonego stresu oksydacyjnego . Promowanie uszkodzeń oksydacyjnych DNA może przyczyniać się do patologii choroby Huntingtona .

Znaczenie kliniczne

Klasyfikacja powtórzeń trinukleotydów i wynikający z nich stan chorobowy zależy od liczby powtórzeń CAG
Liczba powtórzeń Klasyfikacja Stan chorobowy
<26 Normalna Nieporuszony
27–35 Mediator Nieporuszony
36–40 Zmniejszona penetracja +/- dotyczy
>40 Pełna penetracja Dotknięty

Choroba Huntingtona (HD) jest spowodowana zmutowaną postacią genu huntingtyny, w której nadmierna (ponad 36) powtórzeń CAG powoduje powstanie niestabilnego białka. Te rozszerzone powtórzenia prowadzą do produkcji białka huntingtyny, które zawiera nienormalnie długi szlak poliglutaminowy na N-końcu. To czyni ją częścią klasy zaburzeń neurodegeneracyjnych znanych jako zaburzenia powtórzeń trinukleotydów lub zaburzenia poliglutaminowe. Kluczową sekwencją występującą w chorobie Huntingtona jest ekspansja powtórzeń trinukleotydowych glutaminy reszty zaczynające się od 18 aminokwasu. U osób zdrowych zawiera od 9 do 35 reszt glutaminy bez żadnych skutków ubocznych. Jednak 36 lub więcej reszt tworzy błędną zmutowaną postać Htt, (mHtt). Zmniejszona penetracja występuje w zliczeniach 36–39.

Enzymy w komórce często tną to wydłużone białko na fragmenty. Fragmenty białek tworzą nieprawidłowe grudki, znane jako neuronalne inkluzje wewnątrzjądrowe (NII), wewnątrz komórek nerwowych i mogą przyciągać inne, normalne białka do grudek. Uważano, że charakterystyczna obecność tych grudek u pacjentów przyczynia się do rozwoju choroby Huntingtona. Jednak późniejsze badania postawiły pytania dotyczące roli inkluzji (grudek), wykazując obecność widocznych NII, które przedłużały życie neuronów i działały w celu zmniejszenia wewnątrzkomórkowej zmutowanej huntingtyny w sąsiednich neuronach. Jednym z czynników zakłócających jest to, że obecnie uznaje się, że zmutowane białko tworzy różne typy agregatów, w tym osady białkowe, które są zbyt małe, aby można je było rozpoznać jako widoczne osady w wyżej wymienionych badaniach. Prawdopodobieństwo śmierci neuronów pozostaje trudne do przewidzenia. Prawdopodobnie ważnych jest wiele czynników, w tym: (1) długość powtórzeń CAG w genie huntingtyny i (2) ekspozycja neuronu na rozproszone wewnątrzkomórkowe zmutowane białko huntingtyny. NII (zlepianie się białek) może być pomocne jako mechanizm radzenia sobie – a nie tylko mechanizm patogenny – w powstrzymywaniu śmierci neuronów poprzez zmniejszenie ilości rozproszonej huntingtyny. Proces ten jest szczególnie prawdopodobny w tzw prążkowie (część mózgu, która koordynuje ruch) oraz kora czołowa (część mózgu, która kontroluje myślenie i emocje).

Osoby z 36 do 40 powtórzeniami CAG mogą, ale nie muszą, rozwinąć oznaki i objawy choroby Huntingtona, podczas gdy u osób z więcej niż 40 powtórzeniami choroba rozwinie się podczas normalnego życia. Kiedy jest więcej niż 60 powtórzeń CAG, osoba rozwija ciężką postać HD znaną jako młodzieńcza HD . Dlatego liczba powtórzeń CAG (sekwencja kodująca aminokwas glutaminę) wpływa na wiek zachorowania. Żaden przypadek HD nie został zdiagnozowany z liczbą mniejszą niż 36.

Gdy zmieniony gen jest przekazywany z pokolenia na pokolenie, wielkość ekspansji powtórzeń CAG może się zmieniać; często powiększa się, zwłaszcza gdy jest dziedziczona po ojcu. Nie zgłaszano, aby osoby z 28 do 35 powtórzeniami CAG rozwinęły to zaburzenie, ale ich dzieci są narażone na ryzyko zachorowania na tę chorobę, jeśli liczba powtórzeń wzrośnie.

Dalsza lektura

Linki zewnętrzne