6-dehydrogenaza UDP-glukozy

UGDH
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, GDH, UDP-GlcDH, UDPGDH, UGD, UDP-6-dehydrogenaza glukozowa, EIEE84, DEE84
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

6-dehydrogenaza UDP-glukozy jest enzymem cytozolowym , który u ludzi jest kodowany przez gen UGDH .

Białko kodowane przez ten gen przekształca UDP-glukozę w UDP-glukuronian i tym samym bierze udział w biosyntezie glikozoaminoglikanów, takich jak hialuronian, siarczan chondroityny i siarczan heparanu. Te glikozylowane związki są powszechnymi składnikami macierzy pozakomórkowej i prawdopodobnie odgrywają rolę w transdukcji sygnału, migracji komórek oraz wzroście i przerzutach raka. Ekspresja tego genu jest zwiększona przez transformujący czynnik wzrostu beta i zmniejszona przez niedotlenienie.

Enzym ten bierze udział w 4 szlakach metabolicznych : interkonwersjach pentozy i glukuronianu , metabolizmie askorbinianu i aldaranu, metabolizmie skrobi i sacharozy oraz metabolizmie cukrów nukleotydowych .

Utrata UGDH została ostatnio powiązana z encefalopatią padaczkową u ludzi

Nomenklatura

Enzym ten należy do rodziny oksydoreduktaz , w szczególności tych działających na grupę CH-OH dawcy z NAD ⁺ lub NADP ⁺ jako akceptorem. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to UDP-glukoza:NAD ⁺ 6-oksydoreduktaza .

Inne powszechnie używane nazwy to:

• dehydrogenaza UDP-glukozy,
• dehydrogenaza difosfoglukozy urydyny,
• dehydrogenaza UDPG,
• UDPG: oksydoreduktaza NAD,
• UDP-alfa-D-glukoza: oksydoreduktaza NAD,
• UDP-glukoza:NAD ⁺ oksydoreduktaza,
• dehydrogenaza glukozowo-difosforanowa urydyny,
• dehydrogenaza UDP-D-glukozy i
• dehydrogenaza D-glukozy difosforanu urydyny.

Biochemia

Identyfikatory
6-dehydrogenazy UDP-glukozy
nr WE	1.1.1.22
nr CAS	9028-26-6
Bazy danych
IntEnz	Widok IntEnz
BRENDA	Wpis BRENDY
ExPASy	Widok NiceZyme
KEGG	Wpis KEGG
MetaCyc	szlak metaboliczny
PRYM	profil
Struktury PDB	RCSB PDB PDBe PDB suma
Ontologia genów	AmiGO / QuickGO
Szukaj PKW artykuły PubMed artykuły NCBI białka

W enzymologii 6-dehydrogenaza UDP-glukozy ( EC 1.1.1.22 ) jest enzymem , który katalizuje reakcję chemiczną

UDP-glukoza + 2 NAD ⁺ + H. ₂ O ${\ Displaystyle \ rightleftharpoons}$ UDP-glukuronian + 2 NADH + 2 H ⁺

Trzema substratami tego enzymu są UDP-glukoza , NAD + ⁱ H2O , _podczas są gdy jego trzema produktami UDP-glukuronian , NADH i H ⁺

Bibliografia:

Dalsza lektura

•   Peng HL, Lou MD, Chang ML, Chang HY (październik 1998). „Klonowanie cDNA i analiza ekspresji ludzkiej dehydrogenazy UDPglukozy”. Obrady Narodowej Rady Nauki Republiki Chińskiej. Część B, Nauki o życiu . 22 (4): 166–72. PMID 9850599 .
•   Bontemps Y, Maquart FX, Wegrowski Y (wrzesień 2000). „Ludzki gen dehydrogenazy UDP-glukozy: pełne klonowanie i mapowanie początku transkrypcji”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 275 (3): 981–5. doi : 10.1006/bbrc.2000.3389 . PMID 10973831 .
•   Bontemps Y, Vuillermoz B, Antonicelli F, Perreau C, Danan JL, Maquart FX, Wegrowski Y (czerwiec 2003). „Specyficzne białko-1 jest uniwersalnym regulatorem ekspresji dehydrogenazy UDP-glukozy: jego pozytywne zaangażowanie w transformację sygnalizacji i hamowania czynnika wzrostu beta w niedotlenieniu” . Journal of Biological Chemistry . 278 (24): 21566-75. doi : 10.1074/jbc.M209366200 . PMID 12682078 .
•   Sommer BJ, Barycki JJ, Simpson MA (maj 2004). „Charakterystyka ludzkiej dehydrogenazy UDP-glukozy. CYS-276 jest wymagany do drugiego z dwóch kolejnych utleniań” . Journal of Biological Chemistry . 279 (22): 23590–6. doi : 10.1074/jbc.M401928200 . PMID 15044486 .
•    Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (czerwiec 2004). „Charakterystyka transkryptomu wyjaśnia sieci sygnalizacyjne, które kontrolują wzrost i różnicowanie ludzkich komórek ES”. Biotechnologia przyrody . 22 (6): 707–16. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
•   Huh JW, Yoon HY, Lee HJ, Choi WB, Yang SJ, Cho SW (wrzesień 2004). „Znaczenie Gly-13 dla wiązania koenzymu ludzkiej dehydrogenazy UDP-glukozy” . Journal of Biological Chemistry . 279 (36): 37491–8. doi : 10.1074/jbc.M404234200 . PMID 15247292 .
•   Huh JW, Lee HJ, Choi MM, Yang SJ, Yoon SY, Kim DW, Kim SY, Choi SY, Cho SW (2005). „Identyfikacja miejsca wiązania UDP-glukozy ludzkiej dehydrogenazy UDP-glukozy przez znakowanie fotopowinowactwem i mutagenezę kasetową”. Chemia biokoniugatów . 16 (3): 710–6. doi : 10.1021/bc0500387 . PMID 15898741 .
•   Vatsyayan J, Peng HL, Chang HY (czerwiec 2005). „Analiza ludzkiego promotora genu dehydrogenazy UDP-glukozy: identyfikacja miejsca wiązania Sp1 kluczowego dla ekspresji dużego transkryptu”. Dziennik Biochemii . 137 (6): 703–9. doi : 10.1093/jb/mvi082 . PMID 16002992 .
•    Wang L, Zhu YF, Guo XJ, Huo R, Ma X, Lin M, Zhou ZM, Sha JH (październik 2005). „Dwuwymiarowa mapa referencyjna elektroforezy ludzkiego jajnika”. Dziennik medycyny molekularnej . 83 (10): 812–21. doi : 10.1007/s00109-005-0676-y . PMID 16021519 . S2CID 6644433 .
•    Vatsyayan J, Lin CT, Peng HL, Chang HY (luty 2006). „Identyfikacja elementu działającego w układzie cis, odpowiedzialnego za negatywną regulację ekspresji genu ludzkiej dehydrogenazy glukozowej UDP”. Bionauka, biotechnologia i biochemia . 70 (2): 401–10. doi : 10.1271/bbb.70.401 . PMID 16495656 . S2CID 25853385 .
•    Huh JW, Robinson RC, Lee HS, Lee JI, Heo YS, Kim HT, Lee HJ, Cho SW, Choe H (2006). „Ekspresja, oczyszczanie, krystalizacja i wstępna analiza rentgenowska ludzkiej dehydrogenazy UDP-glukozy” . Litery białkowe i peptydowe . 13 (8): 859–62. doi : 10.2174/092986606777841253 . PMID 17073734 . S2CID 28298102 .
•   Easley KE, Sommer BJ, Boanca G, Barycki JJ, Simpson MA (styczeń 2007). „Charakterystyka ludzkiej dehydrogenazy UDP-glukozy ujawnia krytyczne role katalityczne dla lizyny 220 i asparaginianu 280”. Biochemia . 46 (2): 369–78. doi : 10.1021/bi061537d . PMID 17209547 .