HLA-DP
| MHC klasa II , DP | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (heterodimer) | ||||||||||
| Rodzaj białka | receptor na powierzchni komórki | |||||||||
| Funkcjonować |
Rozpoznawanie immunologiczne i prezentacja antygenu |
|||||||||
| ||||||||||
HLA-DP jest białkowym/peptydowym receptorem antygenowym i antygenem choroby przeszczep przeciwko gospodarzowi , który składa się z 2 podjednostek, DPα i DPβ. DPα i DPβ są kodowane przez dwa loci, HLA-DPA1 i HLA-DPB1 , które znajdują się w regionie MHC klasy II (lub HLA-D) w kompleksie antygenu ludzkich leukocytów na ludzkim chromosomie 6 (patrz ramki z białkami po prawej stronie, aby uzyskać linki ). Mniej wiadomo na temat HLA-DP w porównaniu z HLA-DQ i HLA-DR , ale sekwencjonowanie typów DP i określenie częstszych haplotypów poczyniła znaczne postępy w ciągu ostatnich kilku lat.
Struktura, funkcje, genetyka
Struktura
HLA-DP jest αβ- heterodimerowym receptorem powierzchniowym komórki . Każda podjednostka DP (podjednostka α, podjednostka β) składa się z α-helikalnej domeny N-końcowej, IgG-podobnej β-kartki, domeny obejmującej błonę i domeny cytoplazmatycznej. Domena α-helikalna tworzy boki rowka wiążącego peptyd. Regiony arkusza β tworzą podstawę rowka wiążącego i większość cząsteczki, jak również region wiążący między podjednostkami (niekowalencyjny).
Funkcjonować
Nazwa „HLA-DP” pierwotnie opisuje antygen transplantacyjny kategorii MHC klasy II głównego kompleksu zgodności tkankowej człowieka, jednak antygen ten jest artefaktem epoki przeszczepiania narządów. HLA DP działa jako receptor na powierzchni komórki dla obcych lub własnych antygenów. Układ odpornościowy bada antygeny obcych patogenów, gdy są prezentowane przez receptory MHC (takie jak HLA-DP). Antygeny MHC klasy II znajdują się na komórkach prezentujących antygen (APC) (makrofagi, komórki dendrytyczne i limfocyty B). Zwykle te APC „prezentują” receptor/antygeny klasy II bardzo wielu komórkom T, z których każda ma unikalne warianty receptora komórek T (TCR). Kilka wariantów TCR, które rozpoznają te kompleksy DQ/antygen, znajduje się na limfocytach T CD4-dodatnich. Te komórki T, zwane komórkami pomocniczymi T (Th ) , mogą promować amplifikację komórek B, które rozpoznają różne części tego samego antygenu. Alternatywnie makrofagi i inne limfocyty cytotoksyczne zużywają lub niszczą komórki poprzez sygnalizację apoptotyczną i prezentują własne antygeny. Własne antygeny, we właściwym kontekście, tworzą regulacyjną populację komórek T, która chroni własne tkanki przed atakiem immunologicznym lub autoimmunizacją.
Genetyka
Łańcuch α i β- DP jest kodowany odpowiednio przez locus HLA-DPA1 i loci HLA-DPB1. Klaster ten znajduje się na bliższym (centromerowym) końcu superlocus HLA w ludzkim chromosomie 6p21.31. Jest oddalony od loci kodujących HLA-DR i HLA-DQ i dlatego jest znacznie bardziej zrównoważony w stosunku do innych loci HLA. W kompleksie Super B8 locus DP jest częściej zastępowane, albo w wyniku jego odległości od innych loci, albo dlatego, że nie było tak aktywnie wybierane w ewolucji Super B8 .
Zrozumienie heterodimerycznych izoform DP
| HLA | DPB1 | ||
|---|---|---|---|
| allel | (M) | (P) | |
| DPA1 | (M) | α m β m (Cis m ) | α m β p ( Trans ) |
| (P) | α p β m (trans) | α p β p (Cis p ) | |
| Wynik i αpβp : 2 _ izoformy αpβm Cis αmβp , αmβm . i i 2 _ trans , _ _ | |||
Każda kombinacja produktu genu allelu DPA1 z każdą kombinacją produktu „genu” DPB1 może potencjalnie rekombinować, tworząc jedną izoformę. Geny DP są wysoce zmienne w populacji ludzkiej. W typowej populacji występuje wiele DP alfa i beta. Większość izoform nie jest powszechna.
Te izoformy „cis” będą stanowić co najmniej 50% izoform DP. Inne izoformy trans są zazwyczaj rzadsze, izoformy powstają z losowych kombinacji „trans” haplotypów u osobników w wyniku „trans” izoform produktów genów ojcowskich / matczynych.
Allele
Allele HLA-DPA1
| HLA-DPA1 | |||
|---|---|---|---|
| *01 | *02 | *03 | *04 |
|
*01:03 *01:04 *01:05 *01:06 *01:07 *01:08 *01:09 *01:10 |
*02:01 *02 :02 *02:03 *02:04 |
*03:01 *03:02 *03:03 |
*04:01 |
Allele HLA-DPB1
| HLA-DPB1 | |
|---|---|
| *01 | *01:01 |
| *02 | *02:01 |
| *02:02 | |
| *03 | *03:01 |
| *04 | *04:01 |
| *04:02 | |
| *05 | *05:01 |
| *06 | *06:01 |
| *07 | *07:01 |
| *08 | *08:01 |
| *09 | *09:01 |
| *10 | *10:01 |
| DPB1*11:01 - DPB1*129:01 |
|
Zmiana nazewnictwa alleli HLA-DPB1
Przed aktualizacją nomenklatury HLA z kwietnia 2010 r. nowe nazwy alleli HLA-DPB1 zostały przypisane w ramach istniejącego systemu nomenklatury. Na przykład allel wykryty po oznaczeniu HLA-DPB1*9901 jako DPB1*0102, kolejny allel otrzymał nazwę DPB1*0202, następnie *0302 i tak dalej. To przypisanie nazwy zdecydowano ze względu na złożoną charakterystykę genetyczną alleli DPB1 w porównaniu z allelami innych loci HLA. Większości alleli HLA-DPB1 nie można po prostu pogrupować według ich sekwencji nukleotydowych. To przypisanie nazwy było najbardziej mylącym systemem w nomenklaturze HLA. W aktualizacji nomenklatury HLA z 2010 r. Wszystkim allelom DPB1, z wyjątkiem DPB1*0202 i *0402, odkrytym po DPB1*9901, nadano nowe numery. Na przykład DPB1*0102 staje się DPB1*100:01, a DPB1*0203 staje się DPB1*101:01.
Wszystkie allele o zmienionych nazwach są wymienione w tabeli konwersji nomenklatury HLA-DPB1 poniżej.
| Poprzednie imiona | Aktualne nazwy |
|---|---|
| DPB1*0102 | DPB1*100:01 |
| DPB1*0203 | DPB1*101:01 |
| DPB1*0302 | DPB1*102:01 |
| DPB1*0403 | DPB1*103:01 |
| DPB1*0502 | DPB1*104:01 |
| DPB1*0602 | DPB1*105:01 |
| DPB1*0802 | DPB1*106:01 |
| DPB1*0902 | DPB1*107:01 |
| DPB1*1002 | DPB1*108:01 |
| DPB1*1102 | DPB1*109:01 |
| DPB1*1302 | DPB1*110:01 |
| DPB1*1402 | DPB1*111:01 |
| DPB1*1502 | DPB1*112:01 |
| DPB1*1602 | DPB1*113:01 |
| DPB1*1702 | DPB1*114:01 |
| DPB1*1802 | DPB1*115:01 |
| DPB1*1902 | DPB1*116:01 |
| DPB1*2002 | DPB1*117:01 |
| DPB1*2102 | DPB1*118:01 |
| DPB1*2202 | DPB1*119:01 |
| DPB1*2302N | DPB1*120:01N |
| DPB1*2402 | DPB1*121:01 |
| DPB1*2502 | DPB1*122:01 |
| DPB1*2602 | DPB1*123:01 |
| DPB1*2702 | DPB1*124:01 |
| DPB1*2802 | DPB1*125:01 |
Aby pomóc w migracji danych do nowej nomenklatury, Komitet Nomenklatury WHO ds. Czynników Systemu HLA udostępnił narzędzie IMGT/HLA Nomenclature Conversion Tool Archived 2012-08-04 at the Wayback Machine . To narzędzie umożliwia wprowadzenie nazwy allelu HLA i zapewnia zarówno aktualną, jak i nową wersję nazwy allelu. Nowe allele, którym nigdy nie nadano nazwy przed aktualizacją z kwietnia 2010 r., to:
|
DPB1*126:01 DPB1*127:01 DPB1*128:01 DPB1*129:01 |
Wspólne haplotypy DP
| HLA-DPA1*01:03/DPB1*04:01 (DP401) |
| HLA-DPA1*01:03/DPB1*04:02 (DP402) |