Wirus teseptima

Phage t7.png
teseptima
Escherichia wirus T7
Klasyfikacja wirusów
(nierankingowe): Wirus
królestwo : Duplodnaviria
Królestwo: Heunggongvirae
Gromada: Urowiricota
Klasa: Caudoviricetes
Zamówienie: Caudovirales
Rodzina: Autographiviridae
Podrodzina: Studiervirinae
Rodzaj: Wirus teseptima

Teseptimavirus (synonimy grupa fagów T7 , fagi podobne do T7 , wirusy podobne do T7 , wirus podobny do T7 ) to rodzaj wirusów z rzędu Caudovirales , w rodzinie Autographiviridae , w podrodzinie Studiervirinae . Bakterie służą jako naturalny gospodarz, a przenoszenie odbywa się poprzez bierną dyfuzję. Obecnie w tym rodzaju występuje 17 gatunków, w tym gatunek typowy Escherichia virus T7 .

Taksonomia

Rozpoznawane są następujące gatunki:

  • Wirus Enterobacteria IME390
  • Wirus Escherichia 13a
  • Wirus Escherichia 64795ec1
  • Wirus Escherichia C5
  • Wirus Escherichia CICC80001
  • Wirus Escherichia Ebrios
  • Wirus Escherichia EG1
  • Wirus Escherichia HZ2R8
  • Wirus Escherichia HZP2
  • Wirus Escherichia N30
  • Wirus Escherichia NCA
  • Wirus Escherichia T7
  • Wirus Salmonelli 3A8767
  • Wirus Salmonelli Vi06
  • Wirus Stenotrophomonas IME15
  • Yersinia wirus YpPY
  • Wirus Yersinia YpsPG

Struktura

Wirusy podobne do Sp6 są bezotoczkowe , z głową i ogonem. Głowa ma symetrię dwudziestościenną (T=7) o średnicy około 60 nm. Ogon jest niekurczliwy i ma sześć krótkich włókien podkońcowych.

Rodzaj Struktura Symetria Kapsyd Układ genomowy Segmentacja genomu
Wirus teseptima Orzeł reszka T=7 Bez koperty Liniowy jednoczęściowy

Genom

Genomy są liniowe, mają około 40-42 kb długości. Genomy wszystkich trzech wirusów zostały w pełni zsekwencjonowane i są dostępne na stronie internetowej NCBI. Wynoszą one od 37k do 40k nukleotydów, z 42 do 60 białek. Wszystkie trzy kompletne genomy, jak również kilka dodatkowych „niesklasyfikowanych” genomów wirusów, są dostępne tutaj

Koło życia

Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wirus przyłącza się do receptorów adhezyjnych komórki gospodarza za pomocą włókien ogona i wyrzuca wirusowe DNA do peryplazmy gospodarza przez system krótkiego ogona . Geny klasy I są transkrybowane przez polimerazę RNA komórki gospodarza, zanim genom wirusa całkowicie opuści kapsyd. Geny klasy II są następnie transkrybowane przez polimerazę RNA T7, a genom gospodarza ulega degradacji. Genomowe DNA jest replikowane przez polimerazę DNA T7, a konkatamery powstają przed transkrypcją genów klasy III. Na koniec prokapsyd jest składany i pakowany, składany jest ogon, a dojrzałe wiriony są uwalniane poprzez lizę. Bakterie służą jako naturalny gospodarz. Drogi transmisji to dyfuzja pasywna.

Rodzaj Dane gospodarza Tropizm tkankowy Szczegóły wpisu Szczegóły wydania Miejsce replikacji Miejsce montażu Przenoszenie
Wirus teseptima Bakteria Nic Zastrzyk Liza Cytoplazma Cytoplazma Bierna dyfuzja

Historia

Według drugiego raportu ICTV z 1976 r. rodzaj T7likevirus został po raz pierwszy zaakceptowany pod nazwą grupa fagów T7 , nieprzypisany do rzędu, rodziny lub podrodziny. W trzecim raporcie ICTV z 1981 roku rodzaj został zaklasyfikowany do rodziny Poloviridae . Grupa fagów T7 została przemianowana na fagi podobne do T7 w szóstym raporcie z 1995 r. W 1998 r. cała rodzina została przeniesiona do nowo utworzonego rzędu Caudovirales , a nazwa rodzaju została ponownie zmieniona w siódmy raport z 1999 r. dotyczący wirusów podobnych do T7 . W 2009 r. rodzaj przeniósł się do nowo utworzonej podrodziny Autographivirinae , aw 2012 r. ponownie przemianowano go na T7likevirus . Rodzaj został później przemianowany na Teseptimavirus w ramach nowo utworzonej rodziny Autographiviridae i podrodziny Studiervirinae .

Linki zewnętrzne