Dihydrourydyna

Dihydrourydyna
Nazwy
	Preferowana nazwa IUPAC 1-[(2R , 3R , 4S , 5R ) -3,4-dihydroksy-5-(hydroksymetylo)oksolan-2-ylo]-1,3-diazynano-2,4-dion
	Inne nazwy ; 5,6-dihydrourydyna 1,3,5,6-tetrahydrourydyna
Identyfikatory
Numer CAS	5627-05-4 ;
Model 3D ( JSmol )	Interaktywny obraz; Interaktywny obraz;
ChemSpider	85115 ;
Karta informacyjna ECHA	100.257.727
Identyfikator klienta PubChem	94312;
UNII	0D5FR359JO ;
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )	DTXSID6021329 ;
	InChI InChI=1S/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8, 12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1 Klucz: ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESISA-N ; InChI=1/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8, 12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1 Klucz: ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESIBI ;
	UŚMIECH C1CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O; O=C1N(CCC(=O)N1)[C@@H]2O[C@@H]([C@@H](O)[C@H]2O)CO;
Nieruchomości
Wzór chemiczny	C9H14N2O6 _ _ _ _ _ _ _
Masa cząsteczkowa	246,217 g/mol
	O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa). ( co to jest ?) Referencje w infoboksie

Dihydrourydyna (w skrócie D , DHU , lub UH ₂ ) jest nukleozydem pirymidynowym powstałym w wyniku dodania dwóch atomów wodoru do urydyny , co czyni ją w pełni nasyconym pierścieniem pirymidynowym bez pozostałych wiązań podwójnych. D występuje w tRNA i rRNA jako nukleozyd ; odpowiednią zasadą nukleinową jest 5,6-dihydrouracyl .

Struktura pary zasad Dihydrouracyl adeniny (AD)

Ponieważ jest niepłaski , D zakłóca interakcje układania w helisy i destabilizuje strukturę RNA. D stabilizuje również konformację C2'- endo -cukru, która jest bardziej elastyczna niż konformacja C3'- endo ; efekt ten jest propagowany do sąsiedniej reszty 5'. Tak więc, podczas gdy pseudourydyna i 2'-O-metylacje stabilizują lokalną strukturę RNA , D działa odwrotnie.

tRNA organizmów rosnących w niskich temperaturach ( psychrofile ) mają wysoki poziom 5,6-dihydrourydyny (średnio 40-70% więcej), co zapewnia niezbędną lokalną elastyczność tRNA w temperaturze zamarzania lub poniżej.

^ Komisja IUPAC-IUB ds. Nomenklatury Biochemicznej (1970). „Skróty i symbole kwasów nukleinowych, polinukleotydów i ich składników”. Biochemia . 9 (20): 4022–4027. doi : 10.1021/bi00822a023 .
Bibliografia _ Hashizume T; Sopczyk AE; McCloskey JA; Davis DR. (15 marca 1996). „Elastyczność konformacyjna RNA: rola dihydrourydyny” . Kwasy nukleinowe Res . 24 (6): 1073–1079. doi : 10.1093/nar/24.6.1073 . PMC 145759 . PMID 8604341 .
Bibliografia _ Hamamoto T; Horikoshi K; Morita RY; Stetter KO; McCloskey JA (1 marca 1997). „Posttranskrypcyjna modyfikacja tRNA u bakterii psychrofilnych” . J Bakteriol . 179 (6): 1918–1923. doi : 10.1128/jb.179.6.1918-1923.1997 . PMC 178914 . PMID 9068636 .

[1] Komisja IUPAC-IUB ds. Nomenklatury Biochemicznej (1970). „Skróty i symbole kwasów nukleinowych, polinukleotydów i ich składników”. Biochemia . 9 (20): 4022–4027. doi : 10.1021/bi00822a023 .

[2] Bibliografia _ Hashizume T; Sopczyk AE; McCloskey JA; Davis DR. (15 marca 1996). „Elastyczność konformacyjna RNA: rola dihydrourydyny” . Kwasy nukleinowe Res . 24 (6): 1073–1079. doi : 10.1093/nar/24.6.1073 . PMC 145759 . PMID 8604341 .

[3] Bibliografia _ Hamamoto T; Horikoshi K; Morita RY; Stetter KO; McCloskey JA (1 marca 1997). „Posttranskrypcyjna modyfikacja tRNA u bakterii psychrofilnych” . J Bakteriol . 179 (6): 1918–1923. doi : 10.1128/jb.179.6.1918-1923.1997 . PMC 178914 . PMID 9068636 .

Nazwy

Preferowana nazwa IUPAC 1-[(2R , 3R , 4S , 5R ) -3,4-dihydroksy-5-(hydroksymetylo)oksolan-2-ylo]-1,3-diazynano-2,4-dion
Inne nazwy 5,6-dihydrourydyna 1,3,5,6-tetrahydrourydyna
Identyfikatory
Numer CAS	5627-05-4 ^Y
Model 3D ( JSmol )	Interaktywny obraz Interaktywny obraz
ChemSpider	85115 ^N
Karta informacyjna ECHA	100.257.727
Identyfikator klienta PubChem	94312
UNII	0D5FR359JO ^N
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )	DTXSID6021329
InChI InChI=1S/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8, 12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1 ^N Klucz: ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESISA-N ^N InChI=1/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8, 12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1 Klucz: ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESIBI
UŚMIECH C1CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O O=C1N(CCC(=O)N1)[C@@H]2O[C@@H]([C@@H](O)[C@H]2O)CO
Nieruchomości
Wzór chemiczny	C9H14N2O6 _{_} _ _{_} _ _{_} _ _{_}
Masa cząsteczkowa	246,217 g/mol
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa). N ( co to jest ^{T N} ?) Referencje w infoboksie