Fitoreowirus
|
|
| Fitoreowirus | |
|---|---|
| Cryo-EM struktury kapsydu białkowego wirusa karłowatości ryżu (RDV) | |
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Duplornaviricota |
| Klasa: | Resentoviricetes |
| Zamówienie: | Reovirales |
| Rodzina: | Reoviridae |
| Podrodzina: | Sedoreovirinae |
| Rodzaj: | Fitoreowirus |
Phytoreovirus to rodzaj wirusów z rodziny Reoviridae , w podrodzinie Sedoreovirinae . Są to reowirusy bez wieżyczek , które są głównymi patogenami rolniczymi, szczególnie w Azji . Naturalnymi żywicielami są Oryza sativa dla RDV i RGDV, rośliny dwuliścienne dla WTV i skoczki liściaste . W tym rodzaju występują trzy gatunki. Choroby związane z tym rodzajem obejmują: WTV: galasy (guz). RDV: karłowata (lub karłowata) choroba ryżu. RGDV: karłowatość, zahamowanie wzrostu i galasy.
Klasyfikacja
Jeden członek tej rodziny, wirus karłowatości ryżu (RDV), był szeroko badany za pomocą kriomikroskopii elektronowej i krystalografii rentgenowskiej . Na podstawie tych analiz wyprowadzono modele atomowe białek kapsydu i wiarygodny model składania kapsydu. Chociaż białka strukturalne RDV nie mają podobieństwa sekwencji do innych białek, ich fałdy i ogólna struktura kapsydu są podobne do innych reowirusów.
Fitoreowirusy są wyjątkowe wśród reowirusów, ponieważ w każdym wirusie jest 12 segmentów dsRNA. Podobnie jak wszystkie inne reowirusy, zawierają one własną polimerazę RNA zależną od RNA , co pozwala na endogenną syntezę wirusowego mRNA w wirusie. Chociaż mniej dobrze zbadane niż ortoreowirusy i orbiwirusy , przeprowadzono znaczne badania strukturalne i biochemiczne w celu scharakteryzowania fitoreowirusów, które na ogół infekują rośliny. Istnieją trzy uznane fitoreowirusy: wirus guza rany (WTV), wirus karłowatości ryżu (RDV) i wirus karłowatości żółci ryżowej (RGDW). Możliwi dodatkowi członkowie rodziny obejmują wirus enacji liści tytoniu (TLEF), wirus karłowatości pęczków ryżu i wirus słodkich ziemniaków (ICTV, VIDE). Istnieje również kilka izolatów RDV, z których wszystkie mają ponad 90% identyczności sekwencji. Spośród tych fitoreowirusów, RDV był szeroko badany i jest najlepiej scharakteryzowanym członkiem. Większość naszej wiedzy na temat składania i struktury fitoreowirusa opiera się na danych strukturalnych zgromadzonych w badaniach RDV.
Taksonomia
Następujące trzy gatunki są przypisane do rodzaju:
- Wirus karłowatości ryżowej
- Wirus karłowatości żółci ryżowej
- Wirus nowotworu rany
Struktura
Wirusy w Phytoreovirus nie mają otoczki, mają dwudziestościenną geometrię i symetrię T=13, T=2. Średnica wynosi około 70 nm. Genomy są liniowe i podzielone na segmenty. Segmenty mają wielkość od 1066 do 4423 par zasad, co daje całkowitą długość genomu około 26 kb. Genom koduje 15 białek i ma 4 otwarte ramki odczytu.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Fitoreowirus | dwudziestościenny | T=13, T=2 | Bez koperty | Liniowy | Segmentowane |
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez penetrację do komórki gospodarza. Replikacja jest zgodna z modelem replikacji wirusa dwuniciowego RNA. Metodą transkrypcji jest transkrypcja dwuniciowego wirusa RNA. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez jednoczęściowy, niekierowany przez kanaliki ruch wirusowy. Oryza sativa dla rdv i rgdv oraz rośliny dwuliścienne dla wtv służą jako naturalny żywiciel. Wirus jest przenoszony przez wektor (mechaniczna inokulacja owadów w roślinie przez skoczki). Drogi transmisji są wektorowe i mechaniczne.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Fitoreowirus | Oryza sativa; koniki liściaste | Łyko | ruch wirusowy; inokulacja mechaniczna | Śmierć komórki | Cytoplazma | Cytoplazma | koniki liściaste |