Lagowirus
|
|
| Rekonstrukcja CryoEM kapsydu wirusa krwotocznej choroby królików (RHDV) . Wpis EMDB | |
| Lagovirus | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Pisuviricota |
| Klasa: | Pisoniviricetes |
| Zamówienie: | pikornawirusy |
| Rodzina: | Caliciviridae |
| Rodzaj: | Lagowirus |
| Gatunek | |
|
|
Lagovirus to rodzaj wirusów z rodziny Caliciviridae . Zajęczaki służą jako naturalni gospodarze. Istnieją dwa gatunki w tym rodzaju. Choroby związane z tym rodzajem obejmują: martwicze zapalenie wątroby prowadzące do śmiertelnych krwotoków.
Taksonomia
Rodzaj obejmuje następujące gatunki:
- Wirus zespołu europejskiego zająca brunatnego
- Wirus choroby krwotocznej królików
Właściwości wirionów
Morfologia
Wiriony składają się z kapsydu . Kapsyd nie jest otoczony, okrągły o symetrii dwudziestościennej T=3 . Kapsyd izometryczny ma średnicę 35–39 nm. Obserwuje się również cząstki o symetrii T=1, złożone z 60 białek kapsydu, o średnicy około 15 nm. Kapsydy pojawiają się w zarysie od okrągłego do sześciokątnego . Struktura powierzchni kapsydu ujawnia regularny wzór z charakterystycznymi cechami. Układ kapsomerów jest wyraźnie widoczny. Kapsyd z 32 kielichowymi zagłębieniami.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Lagowirus | dwudziestościenny | T=1, T=3 | Bez koperty | Liniowy | jednoczęściowy |
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza odbywa się poprzez przyłączenie do receptorów gospodarza, co pośredniczy w endocytozie. Replikacja jest zgodna z modelem replikacji wirusa z dodatnią nicią RNA. Transkrypcja wirusowa z dodatnią nicią RNA jest metodą transkrypcji. Translacja odbywa się poprzez terminację-reinicjację RNA. Zajęczaki służą jako naturalny żywiciel.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Lagowirus | zajęczaki | Wątroba | Endocytoza receptora komórkowego | Liza | Cytoplazma | Cytoplazma | Kontakt |
Fizyczne i chemiczne właściwości
Masa cząsteczkowa (Mr) wirionów wynosi 15 × 10 6 . Wiriony mają gęstość wyporu w chlorku cezu (CsCl) 1,33–1,36 g/cm 3 . Gradient gęstości wirionów w winianie potasu-glicerolu wynosi 1,29 g/ cm3 . Współczynnik sedymentacji wynosi 170–187 svedberg (s 20,w ); z pozostałych to pik 160–170 svedberg (s 20,w ) (uważa się, że składa się z wadliwych cząstek zakłócających). Pod in vitro wiriony ulegają inaktywacji w środowisku kwaśnym o pH 4,5–7; stabilny w alkalicznym o pH 7–10,5. Wiriony nie są stabilne w podwyższonej temperaturze w obecności wysokiego stężenia Mg ++ . Wiriony są wrażliwe na działanie trypsyny (u niektórych szczepów niewrażliwe na działanie łagodnych detergentów, eteru lub chloroformu . Zakaźność jest zwiększona po potraktowaniu trypsyną (u niektórych szczepów).
Genom
Genom nie jest podzielony na segmenty i zawiera pojedynczą cząsteczkę liniowego dodatnio sensownego RNA ss . Czasami w wirionach znajdowane są także mniejsze gatunki niegenomowych kwasów nukleinowych. Kapsydowany kwas nukleinowy jest głównie pochodzenia genomowego, ale wiriony mogą również zawierać subgenomowy RNA. Cały genom ma długość 7450 nukleotydów . Genom ma guaniny + cytozyny na poziomie 49,3–50,1%. Koniec 5' genomu zawiera zwykle białko związane z genomem ( VPg ) lub metylowany fragment nukleotydu (w przypadku wirusa zapalenia wątroby typu E ). Koniec 3' ma poli(A) . Każdy wirion zawiera kopię pełnej długości lub wadliwe kopie zakłócające .
Białka
Genom wirusa koduje wirusowe białko strukturalne . Wiriony składają się z 1 białka strukturalnego (główne gatunki zlokalizowane w kapsydzie).
Wirusowe białko strukturalne: białko kapsydu ma masę molową 59000–71000 Da ; jest białkiem płaszcza . Białko kapsydu ma masę cząsteczkową mniejszej „rozpuszczalności” 28–30 k Da .
Antygenowość
Stwierdzono reaktywność krzyżową . Reaktywność krzyżowa między gatunkami tego samego serotypu , ale nie z gatunkami innego serotypu i niektórymi gatunkami tego samego serotypu, ale nie ze wszystkimi. Chociaż stopień specyficzności antygenowej różni się w zależności od stopnia pokrewieństwa, antygenowość różni się od serogrup tego samego rodzaju. Większość gatunków z rodzaju jest spokrewniona antygenowo. Dzielą niektóre epitopy w białkach strukturalnych.
- Zarządzanie ICTVdB (2006). 00.012.0.02. Lagowirus. W: ICTVdB — The Universal Virus Database, wersja 4. Büchen-Osmond, C. (red.), Columbia University, Nowy Jork, USA
Linki zewnętrzne