Pirowęglan dietylu
|
|
|
|
| Nazwy | |
|---|---|
|
Preferowana nazwa IUPAC
Diwęglan dietylu |
|
Inne nazwy
|
|
| Identyfikatory | |
|
Model 3D ( JSmol )
|
|
| CHEBI | |
| CHEMBL | |
| ChemSpider | |
| Karta informacyjna ECHA | 100.015.039 |
| Numer WE |
|
| KEGG | |
| Siatka | pirowęglan dietylu |
|
Identyfikator klienta PubChem
|
|
| UNII | |
|
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )
|
|
|
|
|
|
| Nieruchomości | |
| C6H10O5 _ _ _ _ _ | |
| Masa cząsteczkowa | 162,141 g·mol -1 |
| Wygląd | Klarowna, bezbarwna ciecz |
| Gęstość |
1,101 g/ml przy 25°C 1,121 g/ml przy 20°C |
| Temperatura wrzenia | 93 do 94 ° C (199 do 201 ° F; 366 do 367 K) przy 24 hPa |
| Zagrożenia | |
| Bezpieczeństwo i higiena pracy (BHP): | |
|
Główne zagrożenia
|
Szkodliwy |
| Oznakowanie GHS : | |
|
|
| Ostrzeżenie | |
| H302 , H315 , H319 , H332 , H335 | |
| P261 , P264 , P270 , P271 , P280 , P301+P312 , P302+P352 , P304+P312 , P304 + P340 , P305+P351+P338 , P312 , P321 , P330 , P332 + P313 , P33 7 + P313 , P362 , P403 + P233 , P405 , P501 | |
| Punkt zapłonu | 69 ° C (156 ° F; 342 K) zamknięty kubek |
| Śmiertelna dawka lub stężenie (LD, LC): | |
|
LD 50 ( mediana dawki )
|
Doustnie - szczur - 850 mg/kg |
| Związki pokrewne | |
|
Związki pokrewne
|
di - tert -butylu Diwęglan dimetylu |
|
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).
|
|
Pirowęglan dietylu ( DEPC ), zwany także diwęglanem dietylu ( nazwa IUPAC ), jest używany w laboratorium do inaktywacji enzymów RNazy w wodzie i na naczyniach laboratoryjnych. Czyni to poprzez kowalencyjną modyfikację reszt histydyny (najsilniej), lizyny , cysteiny i tyrozyny .
Woda traktowana DEPC (a zatem wolna od RNaz) jest używana do obchodzenia się z RNA w laboratorium, aby zmniejszyć ryzyko degradacji RNA przez RNazy.
Woda jest zwykle traktowana 0,1% obj./obj. DEPC przez co najmniej 2 godziny w temperaturze 37°C, a następnie autoklawowana (co najmniej 15 min) w celu inaktywacji śladów DEPC. Inaktywacja DEPC w ten sposób daje CO2 i etanol . Wyższe stężenia DEPC są w stanie dezaktywować większe ilości RNazy, ale pozostałe ślady lub produkty uboczne mogą hamować dalsze reakcje biochemiczne, takie jak transkrypcja in vitro. Ponadto chemiczna modyfikacja RNA, taka jak karboksymetylacja, jest możliwa, gdy obecne są śladowe ilości DEPC lub jego produktów ubocznych, co skutkuje upośledzonym odzyskiwaniem nienaruszonego RNA nawet po wymianie buforu (po wytrąceniu).
DEPC jest niestabilny w wodzie i podatny na hydrolizę do dwutlenku węgla i etanolu, zwłaszcza w obecności nukleofila . Z tego powodu DEPC nie może być używany z buforami Tris lub HEPES . W przeciwieństwie do tego, można go stosować z solą fizjologiczną buforowaną fosforanami lub MOPS . Przydatną zasadą jest to, że enzymy lub substancje chemiczne, które mają aktywne -O:, -N: lub -S: nie mogą być traktowane DEPC, aby stały się wolne od RNazy, ponieważ DEPC reaguje z tymi gatunkami. Ponadto produkty degradacji DEPC mogą hamować transkrypcję in vitro.
Derywatyzacja DEPC histydyn jest również wykorzystywana do badania znaczenia reszt histydylowych w enzymach. Modyfikacja histydyny przez DEPC prowadzi do karbetoksylowanych pochodnych przy atomie azotu N-omega-2 pierścienia imidazolu . Modyfikację DEPC histydyn można odwrócić przez traktowanie 0,5 M hydroksyloaminą w obojętnym pH.
DEPC można również wykorzystać do badania struktury dwuniciowego DNA. [ potrzebne źródło ]