Pitowirus

Klasyfikacja wirusa
pithowirusa
Grupa:	Grupa I ( dsDNA )
Zamówienie:	Megawirusy
Rodzina:	Pithoviridae
Rodzaj:	Pitowirus
Gatunek
P. masiliensis P. sibericum

Pithovirus , opisany po raz pierwszy w artykule z 2014 roku, to rodzaj gigantycznego wirusa znanego z dwóch gatunków: Pithovirus sibericum , który infekuje ameby i Pithovirus Massiliensis . Jest to o dwuniciowym DNA i należy do kladu dużych wirusów nukleocytoplazmatycznych DNA . Odkrycia dokonano w 2014 roku, kiedy w rdzeniu lodowym sprzed 30 000 lat wydobytym z wiecznej zmarzliny na Syberii w Rosji znaleziono żywy okaz .

Opis

Do opisu nowego gatunku wybrano nazwę rodzaju Pithovirus , nawiązującą do dużych pojemników do przechowywania znanych w starożytnej Grecji, znanych jako pithoi . Okaz Pithowirusa ma około 1,5 μm (1500 nm ) długości i 0,5 μm (500 nm), co czyni go największym wirusem, jaki kiedykolwiek znaleziono. Jest o 50% większy niż Pandoraviridae , poprzedni największy znany wirus, i jest większy niż Ostreococcus , najmniejsza komórka eukariotyczna, chociaż Pandorawirus ma największy genom wirusa, zawierający od 1,9 do 2,5 megazasad DNA .

Pithowirus ma grubą, owalną ścianę z otworem na jednym końcu. Wewnętrznie swoją strukturą przypomina plaster miodu .

Genom Pithowirusa zawiera 467 odrębnych genów , więcej niż typowy wirus, ale znacznie mniej niż 2556 domniemanych sekwencji kodujących białka występujących u Pandorawirusa . Zatem jego genom jest znacznie mniej gęsty niż w przypadku jakiegokolwiek innego znanego wirusa. Dwie trzecie jego białek różni się od białek innych wirusów. Pomimo fizycznego podobieństwa do Pandorawirusa , sekwencja genomu Pithowirusa ujawnia, że ​​jest on ledwo spokrewniony z tym wirusem, ale bardziej przypomina przedstawicieli Marseilleviridae , Megaviridae i Iridoviridae . Wszystkie te rodziny zawierają duże ikozaedryczne wirusy z genomami DNA. Genom Pithowirusa zawiera 36% GC , podobnie jak w przypadku Megaviridae , w przeciwieństwie do ponad 61% w przypadku pandorawirusów .

Replikacja

Genom pithowirusa to jeden kolisty, dwuniciowy chromosom DNA ( dsDNA ) o długości około 610 000 par zasad (bp), kodujący około 467 otwartych ramek odczytu (ORF), które przekładają się na 467 różnych białek. Genom koduje wszystkie białka potrzebne do wytworzenia mRNA ; białka te są obecne w oczyszczonych wirionach. pitowirus przechodzi cały cykl replikacji w cytoplazmie gospodarza , zamiast bardziej typowej metody przejęcia jądra żywiciela.

Odkrycie

Pithovirus sibericum został odkryty w liczącej 30 000 lat próbce syberyjskiej wiecznej zmarzliny przez Chantal Abergel i Jean-Michel Claverie z Uniwersytetu w Aix-Marseille . Wirusa odkryto zakopanego 30 m (100 stóp) pod powierzchnią osadu późnego plejstocenu . Stwierdzono, gdy próbki z brzegu rzeki pobrane w 2000 roku zostały wystawione na działanie ameby . Ameby zaczęły umierać, a po zbadaniu okazało się, że zawierają okazy gigantycznego wirusa. dwa lata wcześniej ożywił nasiona Silene stenophylla w podobnym wieku. Odkrycia Pithovirusa opublikowano w Proceedings of the National Academy of Sciences w marcu 2014 r.

Chociaż wirus jest nieszkodliwy dla ludzi, jego żywotność po zamrożeniu przez tysiąclecia wzbudziła obawy, że globalna zmiana klimatu i odwierty w tundrze mogą doprowadzić do odkrycia wcześniej nieodkrytych i potencjalnie chorobotwórczych wirusów. Jednak inni naukowcy kwestionują, że taki scenariusz stwarza realne zagrożenie.

nowoczesny gatunek z rodzaju, Pithovirus Massiliensis . Podstawowe cechy, takie jak kolejność ORF i genów sierocych (ORFans), są dobrze zachowane w przypadku obu znanych gatunków.

Ewolucja

Oszacowano, że tempo mutacji w genomie wynosi 2,23 × 10-6 podstawień / ^miejsce /rok. Autorzy sugerują, że wirusy te wyewoluowały co najmniej setki tysięcy lat temu.

Zobacz też

• Wirus DNA
• Lista najdłużej żyjących organizmów
• Lista wirusów
• Mikrobiologia
• Wirusologia
• Klasyfikacja wirusów

Linki zewnętrzne

• Strefa wirusowa : pithowirus
• „ Pithovirus sibericum ” . Przeglądarka taksonomii NCBI . 1450746.