Protoparwowirus

Protoparwowirus
	Mikrofotografia elektronowa psiego parwowirusa
Klasyfikacja wirusa
(nierankingowe):	Wirus
Królestwo :	Monodnawiria
Królestwo:	Shotokuviry
Gromada:	Cossaviricota
Klasa:	Quintoviricetes
Zamówienie:	Piccovirales
Rodzina:	Parwowirusy
Podrodzina:	Parwowirusy
Rodzaj:	Protoparwowirus
Gatunki
	zobacz tekst

Protoparwowirus to rodzaj wirusów z podrodziny Parvovirinae rodziny wirusów Parvoviridae . Kręgowce są naturalnymi żywicielami. Rodzaj obejmuje 15 gatunków, w tym protoparwowirus gryzoni 1 , dla którego przykładowym wirusem jest malutki wirus myszy (MVM). Do tego rodzaju zalicza się także parwowirus psów (CPV), który powoduje uszkodzenie przewodu pokarmowego u szczeniąt, które w około 80% kończy się śmiercią, oraz parwowirus świń (PPV), która jest główną przyczyną śmierci płodów i niepłodności u świń. Rodzaj dzieli się filogenetycznie na dwie gałęzie, jedną obejmującą wielu członków założycieli rodziny, takich jak MVM, CPV i PPV, które zostały zbadane dość szczegółowo, oraz drugą gałąź zajętą wyłącznie przez przewidywane wirusy, których sekwencje kodujące zostały niedawno zidentyfikowane w na wolności, stosując metody odkrywania wirusów, których biologia pozostaje jednak w minimalnym stopniu zbadana. Ta druga gałąź obejmuje obecnie dwa gatunki, których członkowie zarażają ludzi, zwane protoparwowirusem naczelnych 1 i protoparwowirusem naczelnych 3 . Do 2014 roku rodzaj nazywał się Parvovirus , ale jego nazwę zmieniono, aby wyeliminować pomylenie przedstawicieli tego rodzaju z członkami całej rodziny Parvoviridae .

Taksonomia

Obecnie rozpoznaje się 15 gatunków, wiele z nich zawiera kilka nazwanych wirusów, szczepów wirusów, genotypów lub serotypów. W odniesieniu do wirusów definicja gatunku jest nieco nietypowa. Jest to po prostu abstrakcyjna koncepcja taksonomiczna, która skupia wybrany zakres wariantów genetycznych, pomagając rozróżnić gałęzie w linii filogenetycznej, ale nie jest to jednostka fizyczna, taka jak wirus, która może zarazić zwierzę lub zostać wyizolowana. Jeżeli poziom różnorodności używany do zdefiniowania gatunku zostanie ustalony na bardzo niskim poziomie, wiele z nich będzie w rzeczywistości zawierać jednego wirusa, a wirusowi i gatunkowi można nawet nadać tę samą nazwę, co spowoduje zamieszanie między tymi dwoma pojęciami w literaturze i marginalizację filogenetyki Rola taksonu gatunkowego. Aby przeciwdziałać temu problemowi, uznawany obecnie poziom różnorodności gatunków w Parvoviridae jest stosunkowo szerokie: gatunki definiuje się jako skupisko podobnych wirusów, które kodują określone białko replikacyjne, zwykle zwane NS1, które jest co najmniej w 85% identyczne z białkiem kodowanym przez innych przedstawicieli gatunku.

Uznane gatunki z rodzaju Protoparvovirus obejmują:

Protoparwowirus mięsożerców 1 (który obejmuje wirusy parwowirus psów i parwowirus kotów );
Protoparwowirus mięsożerców 2
Protoparwowirus mięsożerców 3
Protoparwowirus mięsożerców 4
Chiropteran protoparwowirus 1 (megabat bufawirus 1);
Protoparwowirus Eulipotyphla 1 (bufawirus Mpulungu);
Protoparwowirus naczelnych 1 (ludzkie bufawirusy);
protoparwowirus naczelnych 2 (wirus małpy Wuharv parwowirus 1);
Protoparwowirus naczelnych 3 (cutawirus);
Protoparwowirus naczelnych 4
Protoparwowirus gryzoni 1 (który obejmuje parwowirus H-1, wirus szczurów Kilham, wirus LuIII, wirus minutowy myszy , parwowirus myszy, wirus nowotworowy X i wirus minut szczurów);
Protoparwowirus gryzoni 2 (parwowirus szczurów 1)
Protoparwowirus gryzoni 3 (bufawirus szczurów SY-2015);
Protoparwowirus kopytnych 1 ( parwowirus świń )
Protoparwowirus kopytnych 2 (protoparwowirus Zsana/2013/HUN);

Protoparwowirusy zakażające ludzi po raz pierwszy odkryto w 2012 roku w kale dzieci z Burkina Faso i nazwano je na podstawie siglum bufawirusa. Do tej pory wykryto trzy genotypy bufawirusów krążących w Tunezji, Finlandii i Bhutanie

Drugi wirus z tego rodzaju, który zakaża ludzi – cutawirus – został początkowo wyizolowany z kału dzieci chorych na biegunkę.

Doniesiono o trzecim potencjalnym ludzkim protoparwowirusie — tusawirusie 1 — w kale pojedynczego człowieka, ale nie zostało wyjaśnione, czy jest on w stanie zarazić ludzi, czy też został po prostu połknięty.

Struktura

Wirusy z rodzaju Protoparvovirus mają bezotoczkowe kapsydy białkowe o średnicy około 18–26 nm, które wykazują symetrię dwudziestościenną T = 1. Genomy to jednoniciowy liniowy DNA o długości od 4 do 6 kb, z małymi (100–500 b) niedoskonałymi sekwencjami palindromowymi na każdym końcu, które fałdują się, tworząc charakterystyczne podwójne telomery typu spinka do włosów.

Rodzaj	Struktura	Symetria	Kapsyd	Układ genomowy	Segmentacja genomu
Protoparwowirus	Ikozaedryczny	T=1	Bez koperty	Liniowy ssDNA	NIE

Uważa się, że kapsyd składa się z 60 białek VP (), zarówno VP1, jak i VP2.

Organizacja genomowa

protoparwowirusa ma dwie ORF . Niestrukturalna ORF (NS) jest „pierwszą” po stronie 5', a strukturalna (VP) jest po stronie 3'. Genom ulega ekspresji poprzez rozległy alternatywny splicing . Pozwala to nie tylko na ekspresję VP, ale także tworzy wiele alternatywnie splicowanych wersji każdej ORF, zwykle nazywanych NS1, NS2(P,Y,L), VP1 i VP2. Oto kilka przykładów białek z adnotacjami firmy UniProt:

Wirus myszy NS1 Minute (MVM),
NS2 MVM,
VP1 psiego parwowirusa (CPV),
VP2 CPV,

Koło życia

Replikacja wirusa ma charakter jądrowy. Wejście do komórki gospodarza następuje poprzez przyłączenie się do receptorów gospodarza, co pośredniczy w endocytozie za pośrednictwem klatryny. Replikacja przebiega według modelu toczącej się spinki do włosów. W niektórych kombinacjach wirus/komórka gospodarza wiriony potomne mogą być przemieszczane przez cytoplazmę w pęcherzykach i uwalniane z macierzystej komórki gospodarza przed śmiercią komórki, podczas gdy pozostałe wiriony są uwalniane po lizie komórki. Obecnie wiadomo, że kręgowce z 6 rzędów służą jako naturalni żywiciele. Drogi przenoszenia to zazwyczaj kał, jama ustna i/lub drogi oddechowe.

Rodzaj	Dane gospodarza	Tropizm tkankowy	Szczegóły wpisu	Szczegóły wydania	Miejsce replikacji	Miejsce montażu	Przenoszenie
Protoparwowirus	Kręgowce	Zmienny	endocytoza	wczesny eksport pęcherzykowy/liza komórek	Jądro	Jądro	kałowo-ustne lub oddechowe

Historia

Wirus szczurów Kilham, wyizolowany w 1959 r., był pierwszym zidentyfikowanym członkiem tej rodziny małych, liniowych, jednoniciowych wirusów DNA.

W kolejnych latach z komórek lub tkanek rutynowo stosowanych w laboratoriach badawczych wyekstrahowano serię fizycznie podobnych wirusów, w tym H1, LuIII, wirus minutowy myszy i wirus nowotworowy X, oraz parwowirus świń, PPV, jedną z głównych przyczyn niepowodzeń rozrodu u świń został wyizolowany od zakażonych świń. W 1971 roku wszystkie te wirusy zostały uznane za część rodzaju taksonomicznego zwanego Parvovirus w Pierwszym Raporcie nowo utworzonego Międzynarodowego Komitetu Taksonomii Wirusów (ICTV)

Drugi raport ICTV, opublikowany w 1976 r., ustalił rodzinę Parvoviridae , która w tamtym czasie obejmowała trzy rodzaje, z których jeden zachował nazwę Parvovirus i zawierał wszystkie wyżej wymienione wirusy oraz wirus panleukopenii kotów (obecnie nazywany parwowirusem kotów , w skrócie FPV). , który, jak wykazano, powoduje epidemie zapalenia jelit, panleukopenii i wrodzonej ataksji móżdżkowej u kotów domowych. W 1978 roku pojawił się wirus z tego samego gatunku co FPV, który był w stanie zakażać psy (zwany parwowirusem psów lub CPV), które szybko rozprzestrzeniły się po całym świecie, powodując pandemie ciężkiej choroby jelit i choroby wieńcowej.

Rodzaj Parvovirus nadal gromadził nowe wirusy aż do 2014 roku, kiedy to zmieniono jego nazwę na Protoparvovirus .

Linki zewnętrzne