tobamowirus
Tobamovirus Schemat | |
---|---|
wirusa mozaiki tytoniu (TMV) i mikrografia elektronowa wirionów | |
Klasyfikacja wirusów | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Rybowiria |
Królestwo: | Orthornawirusy |
Gromada: | Kitrinoviricota |
Klasa: | Alsuviricetes |
Zamówienie: | Martelliwirusy |
Rodzina: | Virgaviridae |
Rodzaj: | tobamowirus |
Tobamowirus to rodzaj wirusów RNA o dodatniej nici z rodziny Virgaviridae . Wiele roślin, w tym tytoń , ziemniak , pomidor i kabaczek , służy jako naturalni gospodarze. Do chorób związanych z tym rodzajem należą: nekrotyczne zmiany na liściach. Nazwa Tobamovirus pochodzi od gospodarza i objawów pierwszego odkrytego wirusa ( wirus mozaiki tytoniu ).
Istnieją cztery nieformalne podgrupy w obrębie tego rodzaju: są to tobamowirusy, które infekują rośliny kapustne , dyniowate , ślazowe i psiankowate . Główne różnice między tymi grupami to sekwencje genomu i odpowiedni zakres roślin żywicielskich. [ potrzebne źródło ] Istnieje 37 gatunków w tym rodzaju.
Struktura
Tobamowirusy nie mają otoczki, mają spiralną geometrię pręta i spiralną symetrię. Średnica wynosi około 18 nm, a długość 300–310 nm. Genomy są liniowe i niesegmentowane, o długości około 6,3–6,5 kb.
Genom
Genom RNA koduje co najmniej cztery polipeptydy : są to białka niestrukturalne i produkt odczytu, które biorą udział w replikacji wirusa (polimeraza RNA zależna od RNA, RdRp); białko ruchu (MP), które jest niezbędne do przemieszczania się wirusa między komórkami oraz białko otoczki (CP). Odczytywana część RdRp może być wyrażana jako oddzielne białko w TMV. Wirus jest w stanie replikować się bez ruchu lub białek płaszcza, ale pozostałe dwa są niezbędne. Białko niestrukturalne ma domeny sugerujące, że jest zaangażowane w tworzenie czapeczek RNA, a odczytany produkt ma motyw polimerazy RNA. Białka ruchowe są wytwarzane na bardzo wczesnym etapie cyklu infekcji i zlokalizowane w plazmodesmata , prawdopodobnie biorą udział w specyficzności gospodarza, ponieważ uważa się, że wchodzą w interakcje z niektórymi czynnikami komórki gospodarza. [ potrzebne źródło ]
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez penetrację do komórki gospodarza. Replikacja jest zgodna z modelem replikacji wirusa z dodatnią nicią RNA. Transkrypcja wirusowa z dodatnią nicią RNA jest metodą transkrypcji. Tłumaczenie odbywa się poprzez tłumienie terminacji. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez jednoczęściowy, niekierowany przez kanaliki ruch wirusowy. Rośliny służą jako naturalny żywiciel. Trasy transmisji są mechaniczne.
Enzymy
Zależne od RNA polimerazy RNA tobamowirusa są homologiczne z bromowirusami , ilarwirusami , tobrawirusami i wirusem pstrości goździka .
Drogi zakażenia
Na początku infekcja jest zlokalizowana, ale jeśli wirus pozostanie niekwestionowany, rozprzestrzeni się poprzez układ naczyniowy do infekcji ogólnoustrojowej. Dokładny mechanizm, za pomocą którego wirus porusza się po roślinie, jest nieznany, ale sugeruje się interakcję metyloesterazy pektynowej , enzymu komórkowego ważnego dla metabolizmu ściany komórkowej i rozwoju rośliny, z białkiem ruchu.
Ewolucja
Uważa się, że wirusy te oddzieliły się od swoich gospodarzy od wspólnego przodka. Istnieją co najmniej 3 odrębne klady tobamowirusów, które do pewnego stopnia odpowiadają zakresom swoich żywicieli: to znaczy, że istnieje jeden zakażający gatunek psiankowatych ; druga infekująca dyniowate i rośliny strączkowe , a trzecia infekująca rośliny krzyżowe.
Klasyfikacja
Gatunek
Rodzaj obejmuje następujące gatunki:
- Wirus pstrości papryki (BPeMV)
- Brugmansia łagodny wirus pstrości
- Wirus łagodnej pstrości kaktusa (CMMoV)
- Wirus żółtej plamistości klitorii
- Wirus mozaiki pstrości owoców ogórka
- Wirus zielonej mozaiki ogórka (CGMMV)
- Wirus plamistości ogórka
- Wirus mozaiki Frangipani (FrMV)
- Utajony wirus hibiskusa Fort Pierce (HLFPV)
- Utajony wirus singapurski hibiskusa (HLSV)
- Wirus mozaiki zielonej plamki Kyuri
- Wirus mozaiki marakuja (MarMV)
- Wirus pieprzu Obuda (ObPV)
- Wirus pierścieniowej plamistości Odontoglossum (ORSV)
- Wirus chlorotycznej pierścieniowej plamistości opuncji
- Wirus łagodnej pstrości papryki
- Wirus mozaiki marakui
- Wirus łagodnej pstrości pieprzu (PMMoV)
- Wirus mozaiki Plumeria
- Wirus związany z martwicą kaktusa rattaila (RCNaV)
- Wirus mozaiki Rehmannia
- Wirus mozaiki trawy żebrowej (HRV)
- Wirus opuncji Sammonsa (SOV)
- Wirus pękania kwiatów Streptocarpus
- Wirus mozaiki Sunna i konopi (SHMV)
- Utajony wirus tytoniu
- Wirus łagodnej zielonej mozaiki tytoniu
- Wirus mozaiki tytoniu (TMV)
- Wirus brunatnej wyboistości owoców pomidora (ToBRFV)
- Wirus mozaiki pomidora (ToMV)
- Wirus mozaiki plamistości pomidora
- Wirus tropikalnej mozaiki jabłek sodowych
- Wirus oczyszczenia żył rzepy (TVCV)
- Ullucus łagodny wirus pstrości
- Wirus pstrości wasabi (WMoV)
- Wirus łagodnej pstrości żółtego ogonka
- Wirus mozaiki Youcai (YoMV) inaczej wirus mozaiki rzepaku (ORMV)
- Wirus mozaiki zielonej plamki cukinii
Proponowani członkowie
Proponowani, ale obecnie nierozpoznani członkowie rodzaju obejmują:
- Wirus Chara corallina (CCV)
- Wirus mozaiki Nicotiana velutina (NVMV)
Dalsza lektura
- Hagiwara, Yuka; Komoda, Keisuke; Yamanaka, Takuya; Tamai, Atsushi; Meshi, Tetsuo; Funada, Ryo; Tsuchiya, Tomohiro; Naito, Satoshi; Ishikawa, Masayuki (styczeń 2003). „Subkomórkowa lokalizacja białek gospodarza i wirusów związanych z replikacją RNA tobamowirusa” . Dziennik EMBO . 22 (2): 344–53. doi : 10.1093/emboj/cdg033 . PMC 140108 . PMID 12514140 . S2CID 39785019 .