Hemozależne peroksydazy zwierzęce
| Zwierzęca hemozależna peroksydaza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura krystaliczna ludzkiego kompleksu mieloperoksydaza -tiocyjanian.
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | An_peroksydaza | ||||||||
| Pfam | PF03098 | ||||||||
| InterPro | IPR019791 | ||||||||
| PROZYTA | PDOC00394 | ||||||||
| SCOP2 | 1mhl / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| Nadrodzina OPM | 36 | ||||||||
| Białko OPM | 1q4g | ||||||||
| CDD | cd05396 | ||||||||
| |||||||||
Hemozależne peroksydazy zwierzęce to rodzina peroksydaz .
Peroksydazy występują w bakteriach, grzybach, roślinach i zwierzętach. Na podstawie podobieństwa sekwencji wiele zwierzęcych peroksydaz hemowych można sklasyfikować jako członków nadrodziny: mieloperoksydazy (MPO); peroksydaza eozynofilowa (EPO); laktoperoksydaza (LPO); peroksydaza tarczycowa (TPO); syntaza prostaglandyny H (PGHS); i peroksydazyna.
Funkcjonować
Mieloperoksydaza (MPO) odgrywa główną rolę w zależnym od tlenu układzie mikrobójczym neutrofili . EPO z granulocytów eozynofilowych bierze udział w reakcjach immunologicznych, nasila wytwarzanie czynnika martwicy nowotworów (TNF) i uwalnianie nadtlenku wodoru przez makrofagi pochodzące z ludzkich monocytów. MPO (i prawdopodobnie EPO) wykorzystują przede wszystkim jony Cl- i H 2 O 2 do tworzenia kwasu podchlorawego (HOCl), który może skutecznie zabijać bakterie lub pasożyty. W wydzielanych płynach LPO katalizuje utlenianie jonów tiocyjanianowych (SCN − ) przez H 2 O 2 , tworząc słaby środek utleniający podtiocyjanian (OSCN − ), który ma działanie bakteriostatyczne. TPO wykorzystuje jony I- i H 2 O 2 do generowania jodu i odgrywa centralną rolę w biosyntezie hormonów tarczycy T 3 i T 4 . Na przykład mieloperoksydaza () znajduje się w ludzkim jądrze komórkowym i lizosomie i działa jako odpowiedź obronna na stres oksydacyjny, zapobiegając apoptozie komórki.
Struktura
Zgłoszono struktury 3D MPO i PGHS. MPO jest homodimerem: każdy monomer składa się z lekkiego (A lub B) i ciężkiego (C lub D) łańcucha powstałego w wyniku potranslacyjnego wycięcia 6 reszt ze wspólnego prekursora. Monomery są połączone pojedynczym międzyłańcuchowym dwusiarczkiem. Każdy monomer zawiera związany jon wapnia. PGHS istnieje jako symetryczny homodimer, z którego każdy monomer składa się z 3 domen: N-końcowy moduł podobny do naskórkowego czynnika wzrostu (EGF); domena wiążąca błonę; oraz duża C-końcowa domena katalityczna zawierająca miejsca aktywne cyklooksygenazy i peroksydazy. Domena katalityczna wykazuje uderzające podobieństwo strukturalne do MPO. Obraz na górze tej strony jest przykładem mieloperoksydazy 1dnu pochodzącej z dyfrakcji rentgenowskiej z rozdzielczością 1,85 angstremów.
Aktywna strona
Centrum aktywne cyklooksygenazy, które katalizuje tworzenie prostaglandyny G2 (PGG2) z kwasu arachidonowego , znajduje się na wierzchołku długiego kanału hydrofobowego, rozciągającego się od domeny wiążącej błonę do środka cząsteczki. Miejsce aktywne peroksydazy, które katalizuje redukcję PGG2 do PGH2, znajduje się po drugiej stronie cząsteczki, w miejscu wiązania hemu. Zarówno MPO, jak i domena katalityczna PGHS są głównie alfa-helikalne, 19 helis zidentyfikowano jako równoważne topologicznie i przestrzennie; PGHS zawiera 5 dodatkowych N-końcowych helis, które nie mają odpowiednika w MPO. W obu białkach trzy reszty Asn w każdym monomerze są glikozylowane.
Białka ludzkie zawierające tę domenę
Poniżej znajduje się lista ludzkich białek zawierających tę domenę:
DUOX1 ; DUOX2 ; EPX ; LPO ; MPO ; PTGS1 ; PTGS2 ; PXDNL; TPO
Linki zewnętrzne
- Dunand C. „PeroxiBase - baza danych peroksydazy” . Szwajcarski Instytut Bioinformatyki . Zarchiwizowane od oryginału w dniu 13 października 2008 r . . Źródło 2008-11-21 .
- C Frank. „Analiza MolProbity Ramachandrana, 1dnu” . WPB. Zarchiwizowane od oryginału w dniu 2012-10-12 . Źródło 2008-11-21 .
