Ipomowirus
|
|
| Ipomovirus | |
|---|---|
| Ipomovirus wirion | |
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Pisuviricota |
| Klasa: | Stelpaviricetes |
| Zamówienie: | Patatawirusy |
| Rodzina: | Potyviridae |
| Rodzaj: | Ipomowirus |
Ipomovirus to rodzaj dodatnioniciowych wirusów RNA z rodziny Potyviridae . Wirusy członkowskie infekują rośliny i są przenoszone przez mączliki ( Bemisia tabaci ). Nazwa rodzaju pochodzi od Ipomoea – rodzajowej nazwy słodkiego ziemniaka . Istnieje siedem gatunków w tym rodzaju.
Struktura
Wirusy z rodzaju Ipomovirus są bezotoczkowe, o geometrii giętkiej i nitkowatej. Średnica wynosi około 12–15 nm i może mieć różne długości w zależności od gatunku (dla gatunków o pojedynczych segmentach o długości około 650–900 nm lub dla gatunków o podwójnych segmentach 200–300 nm i 500–600 nm). Kapsyd ma symetrię helikalną o skoku 3,4 nm. Indukują charakterystyczne ciałka inkluzyjne (wiatraczki) w zainfekowanych komórkach roślinnych.
Genom
W zależności od gatunku genom jest jednoczęściowy lub dwudzielny. Wirusy członkowskie mają liniowy, jednoniciowy genom RNA o dodatniej polarności o długości około 10-11 kilozasad. Koniec 3' ma przewód poli(A), a koniec 5' ma białko związane z genomem (VPg).
Wirusy członkowskie kodują pojedynczy polipeptyd o przewidywanej masie cząsteczkowej 390 kilodaltonów ( kDa), który jest rozszczepiany na około 10 białek . W kolejności 5'-3' te białka są
- P1 ( proteaza serynowa ): 83 kDa
- HC (proteaza): 51 kDa
- P3: 34 kDa
- 6K1: 5 kDa
- Cl ( helikaza ): 71 kDa
- 6K2: 6 kDa
- VPg (białko wiążące 5'): 20 kDa
- NIa-Pro (proteaza): 27 kDa
- NIb ( polimeraza RNA zależna od RNA ): 57 kDa
- Białko kapsydu: 34 kDa
Mogą występować pewne różnice w liczbie białek w zależności od gatunku, na przykład niektóre ipomowirusy nie mają HC i mają tandem P1. Pirofosfataza trifosforanu inozyny (znana jako ITPaza lub HAM1) jest nietypową domeną białkową zidentyfikowaną w niektórych ipomowirusach.
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez penetrację do komórki gospodarza. Replikacja jest zgodna z modelem replikacji wirusa z dodatnią nicią RNA. Transkrypcja wirusowa z dodatnią nicią RNA jest metodą transkrypcji. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez ruch wirusowy kierowany przez kanaliki. Rośliny służą jako naturalny żywiciel. Wirus jest przenoszony przez wektor (białą muchę). Drogi transmisji są wektorowe i mechaniczne.
Taksonomia
Rodzaj obejmuje następujące gatunki:
- Wirus brunatnej smugi manioku
- Wirus pstrości Coccinia
- Wirus żółknięcia nerwów ogórka
- Wirus żółknięcia żył dyni
- Wirus łagodnej pstrości słodkich ziemniaków
- Wirus łagodnej pstrości pomidora
- Ugandyjski wirus brunatnej smugi manioku
Ugandyjski wirus brunatnej smugi manioku był pierwszym ipomowirusem, który został sklonowany i uratowany przy użyciu plazmidowego systemu wektorów cDNA.