Aminotransferaza ornityny
| aminotransferaza ornityny | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 OAT + PLP, ludzkie
| |||||||||
| identyfikatory | |||||||||
| nr WE | 2.6.1.13 | ||||||||
| nr CAS | 9030-42-6 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| aminotransferazy ornityny | |||||||
| Symbol | OWIES | ||||||
| gen NCBI | 4942 | ||||||
| HGNC | 8091 | ||||||
| OMIM | 258870 | ||||||
| RefSeq | NM_000274 | ||||||
| UniProt | P04181 | ||||||
| Inne dane | |||||||
| numer WE | 2.6.1.13 | ||||||
| Umiejscowienie | Chr. 10 q26 | ||||||
| |||||||
Aminotransferaza ornityny (OAT) jest enzymem kodowanym u człowieka przez gen OAT znajdujący się na chromosomie 10 .
OAT zaangażowany w ostateczne tworzenie nieistotnego aminokwasu proliny z aminokwasu ornityny . Aminotransferaza ornityny tworzy początkowy związek pośredni w tym procesie. Katalizuje również reakcję odwrotną i dlatego jest niezbędny do tworzenia ornityny z wyjściowego substratu proliny.
Struktura
Gen OAT koduje białko o wielkości około 46 kDa. Białko OAT ulega ekspresji głównie w wątrobie i nerkach, ale także w mózgu i siatkówce. Białko OAT jest zlokalizowane w mitochondrium w komórkach, w których ulega ekspresji.
Struktura białka OAT została rozwiązana za pomocą krystalografii rentgenowskiej i wykazuje podobieństwo do innych aminotransferaz podgrupy 2, takich jak dekarboksylatse dialkiglucyny. Białko OAT działa jako dimer , a każdy monomer składa się z dużej domeny, która w największym stopniu przyczynia się do interfejsu podjednostki, oraz małej domeny C-końcowej i regionu N-końcowego zawierającego helisę, pętlę i trójniciowy beta-meander . W centralnej dużej domenie znajduje się siedmioniciowy arkusz beta pokryty ośmioma helisami. Kofaktor białka OAT ( 5'-fosforan pirydoksalu ) wiąże się z OAT poprzez zasadę Schiffa w pozycji 292 lizyny znajdującej się pomiędzy dwoma z siedmioniciowych arkuszy beta. Uważa się, że trzy aminokwasy (R180, E235 i R413) biorą udział w substratu w miejscu aktywnym .
Funkcjonować
Aminotransferaza ornityny katalizuje przeniesienie grupy delta-aminowej z L- ornityny
- L-ornityna + 2-oksokwas = L-glutaminian 5-semialdehyd + L-aminokwas
Reakcja wymaga 5'-fosforanu pirydoksalu jako kofaktora i stanowi część szlaku, który syntetyzuje 5-semialdehyd L-glutaminianu z L- ornityny .
Znaczenie kliniczne
Mutacje w genie OAT mogą prowadzić do nieprawidłowego działania białek, w tym zarówno mutacji punktowych, które znoszą aktywność katalityczną, dużych mutacji z przesunięciem ramki odczytu, jak i zmutowanych białek, które nie są odpowiednio ukierunkowane do mitochondrium, gdzie występuje jego normalna funkcjonalność. W tym ostatnim nieprawidłowość importu mitochondrialnego powoduje ektopową akumulację białka OAT w cytosolu, po której następuje szybka degradacja przez proteolizę . Niedobór aktywności OAT powoduje niedobór aminotransferazy ornityny , znany również jako zanik bezkręgowy naczyniówki i siatkówki.
Uważa się, że mechanizm atrofii wirowej naczyniówki i siatkówki wiąże się z toksycznością glioksylanu .
Zobacz też
Linki zewnętrzne
- Ornityna + aminotransferaza w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- Seiler N (wrzesień 2000). „Aminotransferaza ornityny, potencjalny cel w leczeniu hiperamonemii” . Cele związane z narkotykami . 1 (2): 119–53. doi : 10.2174/1389450003349254 . PMID 11465067 .
