Kynureninaza

kinureninaza
Struktura krystaliczna kynureninazy Homo sapiens .
Identyfikatory
nr WE	3.7.1.3
nr CAS	9024-78-6
Bazy danych
IntEnz	Widok IntEnz
BRENDA	Wpis BRENDY
ExPASy	Widok NiceZyme
KEGG	Wpis KEGG
MetaCyc	szlak metaboliczny
PRYM	profil
Struktury PDB	RCSB PDB PDBe PDB suma
Ontologia genów	AmiGO / QuickGO
Szukaj PKW artykuły PubMed artykuły NCBI białka

KYNU
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, KYNUU, kynureninaza,
identyfikatory zewnętrzne VCRL2
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Kynureninaza lub hydrolaza L -kinureniny (KYNU) ( EC 3.7.1.3 ) jest enzymem zależnym od PLP , który katalizuje rozszczepienie kinureniny (Kyn) do kwasu antranilowego (Ant). Może również oddziaływać na 3-hydroksykynureninę (w celu wytworzenia 3-hydroksyantranilanu ) i niektóre inne (3-arylokarbonylo) -alaniny . Ludzie wykazują ekspresję jednego enzymu kynureninazy, który jest kodowany przez gen KYNU znajdujący się na chromosomie 2.

KYNU jest częścią szlaku katabolizmu Trp i biosyntezy kofaktorów NAD z tryptofanu (Trp) .

Kynureninaza katalizuje następującą reakcję:

L - kinurenina + H ₂ O ↔ antranilan + L - alanina

Struktura

Kynureninaza należy do klasy V grupy nadrodziny aminotransferazy asparaginianowej strukturalnie homologicznych enzymów zależnych od 5'-fosforanu pirydoksalu ( PLP ). Do tej pory dwie struktury ludzkiej kynureninazy określono metodą dyfrakcji rentgenowskiej z rozdzielczością 2,0 i 1,7 Å. Czterdzieści procent aminokwasów jest ułożonych w spiralę alfa, a dwanaście procent w arkusze beta. Dokowanie substratu kinureniny do miejsca aktywnego sugeruje, że Asn-333 i His-102 biorą udział w wiązaniu substratu.

Funkcjonować

W reakcji KYNU PLP ułatwia rozszczepianie wiązań _Cβ - _Cγ . Reakcja przebiega według tych samych etapów, co transaminacji , ale nie hydrolizuje tautomeryzowanej zasady Schiffa . Proponowany mechanizm reakcji obejmuje atak enzymu nukleofilowego na węgiel karbonylowy (C _γ ) tautomeryzowanej zasady 3hKyn-PLP Schiffa. Po tym następuje _Cβ - _Cγ rozszczepienie wiązania w celu wytworzenia pośredniego enzymu acylowego wraz z tautomeryzowanym adduktem Ala-PLP. Hydroliza enzymu acylowego daje następnie 3hAnt.

Mechanizm reakcji KYNU . Kolorystyka jest następująca: KYNU , PLP , nazwy substratów , cząsteczki nieorganiczne , ugrupowanie 3hAn , ugrupowanie Ala

Dalsza lektura

•    Lima S, Khristoforov R, Momany C, Phillips RS (2007). „Struktura krystaliczna kynereninazy Homo sapiens” . Biochemia . 46 (10): 2735–2744. doi : 10.1021/bi0616697 . PMC 2531291 . PMID 17300176 .
•    Heyes poseł, Chen CY, major EO, ​​Saito K (1997). „Różne enzymy szlaku kynureniny ograniczają tworzenie kwasu chinolinowego przez różne typy komórek ludzkich” . Biochem. J. _ 326 (2): 351–6. doi : 10.1042/bj3260351 . PMC 1218677 . PMID 9291104 .
•    Rose JE, Behm FM, Drgon T i in. (2010). „Spersonalizowane rzucanie palenia: interakcje między dawką nikotyny, uzależnieniem a wynikiem genotypu sukcesu w rzuceniu palenia” . Mol. Med . 16 (7-8): 247-53. doi : 10.2119/molmed.2009.00159 . PMC 2896464 . PMID 20379614 .
•   Zhang Y, Zhang KX, He X i in. (2005). „[Polimorfizm genu kynureninazy w nadciśnieniowym kandydującym regionie chromosomalnym jest związany z nadciśnieniem pierwotnym]”. Zhonghua Xin Xue Guan Bing Za Zhi . 33 (7): 588–91. PMID 16080802 .
•   Inada J, Okuno E, Kimura M, Kido R (1984). „Wewnątrzkomórkowa lokalizacja i charakterystyka 3-hydroksykynureninazy w ludzkiej wątrobie”. Int. J. Biochem . 16 (6): 623–8. doi : 10.1016/0020-711x(84)90031-4 . PMID 6468727 .
•   Ubbink JB, Vermaak WJ, Bissbort SH (1991). „Wysokosprawny test chromatografii cieczowej poziomów aktywności kynereninazy ludzkich limfocytów”. J. Chromatograf . 566 (2): 369–75. doi : 10.1016/0378-4347(91)80253-9 . PMID 1939450 .
•   Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•    Magni G, Amici A, Emanuelli M i in. (2004). „Enzymologia homeostazy NAD + u człowieka”. Komórka. Mol. Nauka o życiu . 61 (1): 19–34. doi : 10.1007/s00018-003-3161-1 . PMID 14704851 . S2CID 22041610 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2002). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Christensen M, Duno M, Lund AM i in. (2007). „Acyduria ksanturenowa z powodu mutacji w KYNU kodującej kynureninazę”. J. dziedziczyć. Metab. Dis . 30 (2): 248–55. doi : 10.1007/s10545-007-0396-2 . PMID 17334708 . S2CID 13295336 .
•   Walsh HA, Botting NP (2002). „Oczyszczanie i charakterystyka biochemiczna niektórych właściwości rekombinowanej ludzkiej kynureninazy” . Eur. J. Biochem . 269 ​​(8): 2069–74. doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.02854.x . PMID 11985583 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K i in. (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .

Linki zewnętrzne

• PDBe-KB zawiera przegląd wszystkich informacji o strukturze dostępnych w PDB dla ludzkiej Kynureninazy