PTPN13

PTPN13
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, FAP-1, PNP1, PTP-BAS, PTP-BL, PTP1E, PTPL1, PTPLE, hPTP1E, białkowa fosfataza tyrozynowa, niereceptorowa typu 13, białkowa fosfataza tyrozynowa niereceptorowa typu 13 Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Niereceptorowa fosfataza tyrozynowo-białkowa typu 13 jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen PTPN13 .

Białko kodowane przez ten gen należy do rodziny białkowej fosfatazy tyrozynowej (PTP). Wiadomo, że PTP są cząsteczkami sygnałowymi , które regulują różne procesy komórkowe, w tym wzrost komórek , różnicowanie , cykl mitotyczny i transformację onkogenną . To PTP jest dużym białkiem, które posiada domenę PTP na C-końcu i wiele domen niekatalitycznych, które obejmują domenę o podobieństwie do nadrodziny prążków 4.1 cytoszkieletu -białka związane, region składający się z pięciu domen PDZ i motyw zamka leucynowego . Stwierdzono, że ten PTP oddziałuje i defosforyluje receptor Fas , jak również IkappaBalpha poprzez domeny PDZ, co sugeruje jego rolę w zaprogramowanej śmierci komórki za pośrednictwem Fas. Wykazano również, że ten PTP oddziałuje z białkiem aktywującym GTPazę, a zatem może działać jako regulator sygnałowego Rho . Zgłoszono cztery alternatywne składanie wariantów transkryptu, które kodują różne białka.

Interakcje

Wykazano, że PTPN13 oddziałuje z PKN2 .

Dalsza lektura

•   Sato T, Irie S, Kitada S, Reed JC (1995). „FAP-1: białkowa fosfataza tyrozynowa, która wiąże się z Fas”. nauka . 268 (5209): 411–415. Bibcode : 1995Sci...268..411S . doi : 10.1126/science.7536343 . PMID 7536343 .
•   Saras J, Claesson-Welsh L, Heldin CH, Gonez LJ (1994). „Klonowanie i charakteryzacja PTPL1, białkowej fosfatazy tyrozynowej o podobieństwach do białek związanych z cytoszkieletem” . J. Biol. chemia . 269 ​​(39): 24082–9. doi : 10.1016/S0021-9258(19)51050-X . PMID 7929060 .
•   Banville D, Ahmad S, Stocco R, Shen SH (1994). „Nowa fosfataza białkowo-tyrozynowa z homologią zarówno do białek cytoszkieletu z rodziny prążków 4.1, jak i kinaz guanylanowych związanych z połączeniami” . J. Biol. chemia . 269 ​​(35): 22320–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31792-1 . PMID 8071359 .
•   Inazawa J, Ariyama T, Abe T i in. (1997). „PTPN13, białkowa fosfataza tyrozynowa związana z fas, znajduje się na długim ramieniu chromosomu 4 w paśmie q21.3”. Genomika . 31 (2): 240–242. doi : 10.1006/geno.1996.0039 . PMID 8824809 .
•   Yanagisawa J, Takahashi M, Kanki H i in. (1997). „Interakcja molekularna Fas i FAP-1. Tripeptydowy bloker interakcji ludzkiego Fas z FAP-1 promuje apoptozę indukowaną przez Fas” . J. Biol. chemia . 272 (13): 8539–8545. doi : 10.1074/jbc.272.13.8539 . PMID 9079683 .
•   Saras J, Engström U, Góñez LJ, Heldin CH (1997). „Charakterystyka oddziaływań między domenami PDZ białka fosfatazy tyrozynowej PTPL1 i ogonem na końcu karboksylowym Fas” . J. Biol. chemia . 272 (34): 20979–20981. doi : 10.1074/jbc.272.34.20979 . PMID 9261095 .
•   Saras J, Franzén P, Aspenström P i in. (1997). „Nowe białko aktywujące GTPazę dla Rho oddziałuje z domeną PDZ białka fosfatazy tyrozynowej PTPL1” . J. Biol. chemia . 272 (39): 24333–24338. doi : 10.1074/jbc.272.39.24333 . PMID 9305890 .
•    Ekiel I, Banville D, Shen SH i in. (1999). „Przypisanie sygnału łańcucha głównego dla domeny PDZ2 z ludzkiej białkowej fosfatazy tyrozynowej hPTP1E i jej kompleksu z C-końcowym peptydem z receptora Fas”. J. Biomol. NMR . 12 (3): 455–456. doi : 10.1023/A:1008267807859 . PMID 9835052 . S2CID 19976473 .
•    Maekawa K, Imagawa N, Naito A i in. (1999). „Powiązanie fosfatazy białkowo-tyrozynowej PTP-BAS z białkiem hamującym czynnik transkrypcyjny IkappaBalpha poprzez interakcję między domeną PDZ1 a powtórzeniami ankiryny” . Biochem. J. _ 337 (2): 179–84. doi : 10.1042/0264-6021:3370179 . PMC 1219950 . PMID 9882613 .
•   Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (1999). „Koniec karboksylowy efryn klasy B stanowi motyw wiążący domenę PDZ” . J. Biol. chemia . 274 (6): 3726–3733. doi : 10.1074/jbc.274.6.3726 . PMID 9920925 .
•   Murthy KK, Clark K, Fortin Y i in. (1999). „ZRP-1, białko związane z zyksyną, oddziałuje z drugą domeną PDZ białka cytozolowego fosfatazy tyrozynowej hPTP1E” . J. Biol. chemia . 274 (29): 20679–20687. doi : 10.1074/jbc.274.29.20679 . PMID 10400701 .
•    Cuppen E, van Ham M, Pepers B i in. (1999). „Identyfikacja i charakterystyka molekularna BP75, nowego białka zawierającego bromodomenę” . FEBS Lett . 459 (3): 291–298. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01191-6 . PMID 10526152 . S2CID 41216030 .
•    Irie S, Hachiya T, Rabizadeh S i in. (1999). „Funkcjonalna interakcja fosfatazy-1 związanej z Fas (FAP-1) z p75 (NTR) i ich wpływ na aktywację NF-kappaB” . FEBS Lett . 460 (2): 191–198. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01324-1 . PMID 10544233 . S2CID 25143664 .
•    Lee SH, Shin MS, Park WS i in. (2000). „Immunohistochemiczna lokalizacja FAP-1, inhibitora apoptozy za pośrednictwem Fas, w normalnych i nowotworowych tkankach ludzkich”. APMIS . 107 (12): 1101–1108. doi : 10.1111/j.1699-0463.1999.tb01515.x . PMID 10660140 . S2CID 24672576 .
•   Kozlov G, Gehring K, Ekiel I (2000). „Struktura roztworu domeny PDZ2 z ludzkiej fosfatazy hPTP1E i jej interakcje z C-końcowymi peptydami z receptora Fas”. Biochemia . 39 (10): 2572–2580. doi : 10.1021/bi991913c . PMID 10704206 .
•   Cuppen E, van Ham M, Wansink DG i in. (2000). „Białko TRIP6 związane z zyksyną oddziałuje z motywami PDZ w białku adaptorowym RIL i białkowej fosfatazie tyrozynowej PTP-BL”. Eur. J. Cell Biol . 79 (4): 283–293. doi : 10.1078/S0171-9335(04)70031-X . PMID 10826496 .
•   Erdmann KS, Kuhlmann J, Lessmann V i in. (2000). „Białko Coli z polipowatością gruczolakowatą (APC) oddziałuje z białkową fosfatazą tyrozynową PTP-BL poprzez domenę PDZ składaną alternatywnie” . Onkogen . 19 (34): 3894–3901. doi : 10.1038/sj.onc.1203725 . PMID 10951583 .
•   Nakai Y, Irie S, Sato TA (2001). „Identyfikacja IkappaBalpha jako substratu fosfatazy-1 związanej z Fas”. Eur. J. Biochem . 267 (24): 7170–7175. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01818.x . PMID 11106428 .
•    Gross C, Heumann R, Erdmann KS (2001). „Kinaza białkowa związana z kinazą C PRK2 oddziałuje z białkową fosfatazą tyrozynową PTP-BL poprzez nowy motyw wiążący domenę PDZ” . FEBS Lett . 496 (2–3): 101–104. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02401-2 . PMID 11356191 . S2CID 205880882 .