Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
PTPRF
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, LAR, BNAH2, białkowa fosfataza tyrozynowa, receptor typu F, białkowy receptor fosfatazy tyrozynowej typu F
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Białkowa fosfataza tyrozynowa F typu receptorowego jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen PTPRF .
Białko kodowane przez ten gen należy do rodziny białkowej fosfatazy tyrozynowej (PTP). Wiadomo, że PTP są cząsteczkami sygnałowymi, które regulują różne procesy komórkowe, w tym wzrost komórek , różnicowanie, cykl mitotyczny i transformację onkogenną. Ten PTP posiada region zewnątrzkomórkowy, pojedynczy region transbłonowy i dwie tandemowe wewnątrzcytoplazmatyczne domeny katalityczne, a zatem reprezentuje PTP typu receptora. Region zewnątrzkomórkowy zawiera trzy domeny podobne do Ig i dziewięć domen innych niż Ig, podobnych do cząsteczek adhezyjnych komórek nerwowych . Wykazano, że ten PTP działa w regulacji kontaktów komórka nabłonkowa-komórka na połączeniach przylegających , jak również w kontroli sygnalizacji beta-kateniny . Zwiększony poziom ekspresji tego białka stwierdzono w insulinę u osób otyłych i insulinoopornych, co może przyczyniać się do patogenezy insulinooporności . Zgłoszono dwa alternatywne warianty transkryptu tego genu, które kodują różne białka.
Interakcje
Wykazano, że PTPRF oddziałuje z beta-kateniną i lipryną-alfa-1 .
Dalsza lektura
Chernoff J (1999). „Białkowe fosfatazy tyrozynowe jako negatywne regulatory sygnalizacji mitogennej”. J. Komórka. Fizyol . 180 (2): 173–81. doi : 10.1002/(SICI)1097-4652(199908)180:2<173::AID-JCP5>3.0.CO;2-Y . PMID 10395287 . S2CID 24952421 .
Hashimoto N, Feener EP, Zhang WR, Goldstein BJ (1992). „Fosfatazy białkowo-tyrozynowe receptora insuliny. Fosfataza związana z antygenem wspólnym leukocytów szybko dezaktywuje kinazę receptora insuliny przez preferencyjną defosforylację domeny regulatorowej receptora” . J. Biol. chemia . 267 (20): 13811-4. doi : 10.1016/S0021-9258(19)49639-7 . PMID 1321126 .
Jirik FR, Harder KW, Melhado IG, Anderson LL, Duncan AM (1993). „Gen fosfatazy tyrozynowej związanej z antygenem leukocytów (LAR) jest zlokalizowany na ludzkim chromosomie 1p32, regionie często usuwanym w guzach pochodzenia neuroektodermalnego”. Cytogenet. Genet komórkowy . 61 (4): 266-8. doi : 10.1159/000133418 . PMID 1486801 .
Streuli M, Krueger NX, tajski T, Tang M, Saito H (1990). „Wyraźne role funkcjonalne dwóch wewnątrzkomórkowych fosfatazy, takich jak domeny białkowej fosfatazy tyrozynowej związanej z receptorem LCA i LAR” . EMBO J. 9 (8): 2399–407. doi : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07415.x . PMC 552264 . PMID 1695146 .
Streuli M, Krueger NX, Tsai AY, Saito H (1989). „Rodzina białkowych fosfataz tyrozynowych związanych z receptorami u ludzi i Drosophila” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 86 (22): 8698–702. Bibcode : 1989PNAS...86.8698S . doi : 10.1073/pnas.86.22.8698 . PMC 298355 . PMID 2554325 .
Streuli M, Krueger NX, Hall LR, Schlossman SF, Saito H (1988). „Nowy członek nadrodziny immunoglobulin, który ma region cytoplazmatyczny homologiczny do wspólnego antygenu leukocytów” . J. Exp. Med . 168 (5): 1523–30. doi : 10.1084/jem.168.5.1523 . PMC 2189122 . PMID 2972792 .
Schaapveld RQ, van den Maagdenberg AM, Schepens JT, Weghuis DO, Geurts van Kessel A, Wieringa B, Hendriks WJ (1995). „Mysi gen Ptprf kodujący leukocytową cząsteczkę związaną z antygenem wspólnym LAR: klonowanie, charakteryzacja i lokalizacja chromosomalna”. Genomika . 27 (1): 124–30. doi : 10.1006/geno.1995.1014 . hdl : 2066/21329 . PMID 7665159 .
Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (1995). „Przezbłonowa fosfataza tyrozynowa białka LAR i białko oddziałujące z LAR ze zwiniętą cewką współlokalizują się w zrostach ogniskowych” . EMBO J. 14 (12): 2827–38. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . PMC 398401 . PMID 7796809 .
O'Grady P, Krueger NX, Streuli M, Saito H (1994). „Organizacja genomowa ludzkiego genu fosfatazy tyrozynowej białka LAR i alternatywny splicing w zewnątrzkomórkowych domenach fibronektyny typu III” . J. Biol. chemia . 269 (40): 25193–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31516-8 . PMID 7929208 .
Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (1996). „Podrodzina LAR / PTP delta / PTP sigma transbłonowych białkowych fosfataz tyrozynowych: wiele ludzkich izoform LAR, PTP delta i PTP sigma ulega ekspresji w sposób specyficzny dla tkanki i wiąże się z białkiem LIP.1 oddziałującym z LAR” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 92 (25): 11686–90. Bibcode : 1995PNAS...9211686P . doi : 10.1073/pnas.92.25.11686 . PMC40467 . _ PMID 8524829 .
Liu X, Vega QC, Decker RA, Pandey A, Worby CA, Dixon JE (1996). „Onkogenne receptory RET wykazują różne miejsca autofosforylacji i specyficzności wiązania substratu” . J. Biol. chemia . 271 (10): 5309–12. doi : 10.1074/jbc.271.10.5309 . PMID 8621380 .
Debant A, Serra-Pagès C, Seipel K, O'Brien S, Tang M, Park SH, Streuli M (1996). „Wielodomenowe białko Trio wiąże przezbłonową fosfatazę tyrozynową LAR, zawiera domenę kinazy białkowej i ma oddzielne domeny czynnika wymiany nukleotydów guaninowych specyficzne dla rac i rho” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 93 (11): 5466–71. Bibcode : 1996PNAS...93.5466D . doi : 10.1073/pnas.93.11.5466 . PMC 39269 . PMID 8643598 .
Zhang WR, Li PM, Oswald MA, Goldstein BJ (1996). „Modulacja transdukcji sygnału insuliny przez eutopową nadekspresję białka fosfatazy tyrozynowej typu receptora LAR” . Mol. Endokrynol . 10 (5): 575–84. doi : 10.1210/mend.10.5.8732688 . PMID 8732688 . S2CID 42128485 .
Tabiti K, Cui L, Chhatwal VJ, Moochhala S, Ngoi SS, Pallen CJ (1996). „Nowy alternatywny splicing przewiduje wydzielaną pozakomórkową izoformę białka fosfatazy tyrozynowej podobnej do ludzkiego receptora LAR” . gen . 175 (1–2): 7–13. doi : 10.1016/0378-1119(96)00113-8 . PMID 8917069 .
Ahmad F, Goldstein BJ (1997). „Funkcjonalne powiązanie między receptorem insuliny a przezbłonową fosfatazą tyrozynową LAR w nienaruszonych komórkach” . J. Biol. chemia . 272 (1): 448–57. doi : 10.1074/jbc.272.1.448 . PMID 8995282 .
Aicher B, Lerch MM, Müller T, Schilling J, Ullrich A (1997). „Komórkowa redystrybucja białkowych fosfataz tyrozynowych LAR i PTPσ przez indukowalne przetwarzanie proteolityczne” . J. Cell Biol . 138 (3): 681–96. doi : 10.1083/jcb.138.3.681 . PMC 2141638 . PMID 9245795 .
Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (1998). „Lipriny, rodzina białek transbłonowych LAR oddziałujących z fosfatazą tyrozynową” . J. Biol. chemia . 273 (25): 15611-20. doi : 10.1074/jbc.273.25.15611 . PMID 9624153 .
O'Grady P, tajski TC, Saito H (1998). „Kompleks Laminina – Nidogen jest ligandem dla określonej izoformy splicingowej transbłonowej fosfatazy tyrozynowej LAR” . J. Cell Biol . 141 (7): 1675–84. doi : 10.1083/jcb.141.7.1675 . PMC 2133008 . PMID 9647658 .
Chiplunkar S, Chamblis K, Chwa M, Rosenberg S, Kenney MC, Brown DJ (1999). „Zwiększona ekspresja transbłonowej fosfatazy fosfotyrozynowej (LAR) w kulturach stożka rogówki i rogówkach”. Do potęgi. Rez . 68 (3): 283–93. doi : 10.1006/exer.1998.0604 . PMID 10079136 .
Galeria WPB
1lar : STRUKTURA KRYSZTAŁOWA DOMEN TANDEMOWYCH FOSFOTAZY RPTP LAR
2dju : Struktury roztworów domeny fn3 fosfatazy tyrozynowo-białkowej F typu ludzkiego receptora
2dn7 : Struktury roztworu 6. domeny fn3 fosfatazy tyrozynowo-białkowej F typu ludzkiego receptora