rodzina prekursorów mikroRNA mir-398

mir-398
Identyfikatory
Symbol	mir-398
Rfam	RF00695
rodzina miRBase	MIPF0000107
Inne dane
typ RNA	mikroRNA
Domeny	eukariota ;
Struktury PDB	PDBe

W biologii molekularnej mikroRNA mir-398 jest krótką cząsteczką RNA . MikroRNA działają w celu regulacji poziomów ekspresji innych genów za pomocą kilku mechanizmów.

Zobacz też

• mikroRNA

Dalsza lektura

•    Mendoza-Soto AB, Sánchez F, Hernández G (2012). „MikroRNA jako regulatory w odpowiedzi na toksyczność metali roślinnych” . Granice w nauce o roślinach . 3 : 105. doi : 10.3389/fpls.2012.00105 . PMC 3356851 . PMID 22661980 .
•    Burklew CE, Ashlock J, Winfrey WB, Zhang B (2012). Wu K (red.). „Wpływ nanocząstek tlenku glinu na wzrost, rozwój i ekspresję mikroRNA tytoniu (Nicotiana tabacum)” . PLOS JEDEN . 7 (5): e34783. Bibcode : 2012PLoSO...734783B . doi : 10.1371/journal.pone.0034783 . PMC 3350507 . PMID 22606225 .
•    Zhang J, Zhang S, Han S, Wu T, Li X, Li W, Qi L (sierpień 2012). „Identyfikacja mikroRNA w całym genomie modrzewia i specyficzna dla etapu modulacja 11 konserwatywnych mikroRNA i ich celów podczas embriogenezy somatycznej”. Planta . 236 (2): 647–57. doi : 10.1007/s00425-012-1643-9 . PMID 22526500 . S2CID 6776890 .
•    Jung JH, Seo PJ, Ahn JH, Park CM (maj 2012). „Arabidopsis białko wiążące RNA FCA reguluje przetwarzanie mikroRNA172 podczas kwitnienia termosensorycznego” . Journal of Biological Chemistry . 287 (19): 16007-16. doi : 10.1074/jbc.M111.337485 . PMC 3346135 . PMID 22431732 .
•   Ren L, Tang G (maj 2012). „Identyfikacja mikroRNA reagujących na sacharozę ujawnia nagromadzenia miedzi regulowane przez sacharozę w sposób zależny i niezależny od SPL7 u Arabidopsis thaliana” . Nauka o roślinach . 187 : 59–68. doi : 10.1016/j.plantsci.2012.01.014 . PMID 22404833 .
•   Sunkar R, Li YF, Jagadeeswaran G (kwiecień 2012). „Funkcje mikroRNA w reakcjach roślin na stres”. Trendy w nauce o roślinach . 17 (4): 196–203. doi : 10.1016/j.tplants.2012.01.010 . PMID 22365280 .
•    Guleria P, Yadav SK (grudzień 2011). „Identyfikacja miR414 i analiza ekspresji konserwatywnych miRNA ze Stevia rebaudiana” . Genomika, proteomika i bioinformatyka . 9 (6): 211–7. doi : 10.1016/S1672-0229(11)60024-7 . PMC 5054151 . PMID 22289477 .
•    Zhao M, Tai H, Sun S, Zhang F, Xu Y, Li WX (2012). Pfeffer S (red.). „Klonowanie i charakterystyka miRNA kukurydzy zaangażowanych w odpowiedzi na niedobór azotu” . PLOS JEDEN . 7 (1): e29669. Bibcode : 2012PLoSO...729669Z . doi : 10.1371/journal.pone.0029669 . PMC 3250470 . PMID 22235323 .
•   Monavar Feshani A, Mohammadi S, Frazier TP, Abbasi A, Abedini R, Karimi Farsad L, Ehya F, Salekdeh GH, Mardi M (luty 2012). „Identyfikacja i walidacja miRNA Asteraceae za pomocą analizy wyrażonych znaczników sekwencji”. gen . 493 (2): 253–9. doi : 10.1016/j.gene.2011.11.024 . PMID 22146318 .
•    Xu Z, Zhong S, Li X, Li W, Rothstein SJ, Zhang S, Bi Y, Xie C (2011). Mustafa A (red.). „Identyfikacja mikroRNA w całym genomie w odpowiedzi na niską dostępność azotanów w liściach i korzeniach kukurydzy” . PLOS JEDEN . 6 (11): e28009. Bibcode : 2011PLoSO...628009X . doi : 10.1371/journal.pone.0028009 . PMC 3223196 . PMID 22132192 .
•   Lu S, Yang C, Chiang VL (listopad 2011). „Konserwacja i różnorodność miedziowych sieci regulacyjnych związanych z mikroRNA w Populus trichocarpa”. Journal of Integrative Plant Biology . 53 (11): 879–91. doi : 10.1111/j.1744-7909.2011.01080.x . PMID 22013976 .
•   Attallah CV, Welchen E, Martin AP, Spinelli SV, Bonnard G, Palatnik JF, Gonzalez DH (sierpień 2011). „Rośliny zawierają dwa białka SCO, które są w różny sposób zaangażowane w funkcję oksydazy cytochromu c oraz homeostazę miedzi i redoks” . Dziennik botaniki eksperymentalnej . 62 (12): 4281–94. doi : 10.1093/jxb/err138 . PMID 21543521 .
•   Zhu C, Ding Y, Liu H (wrzesień 2011). „MiR398 i reakcje roślin na stres”. Fizjologia Plantarum . 143 (1): 1–9. doi : 10.1111/j.1399-3054.2011.01477.x . PMID 21496029 .
•    Kantar M, Łukasz SJ, Budak H (marzec 2011). „Wzorce ekspresji miRNA Triticum dicoccoides w odpowiedzi na szokowy stres suszy”. Planta . 233 (3): 471–84. doi : 10.1007/s00425-010-1309-4 . PMID 21069383 . S2CID 27289636 .
•    Bouche N (czerwiec 2010). „Nowe spojrzenie na funkcje miR398 w Arabidopsis” . Sygnalizacja i zachowanie roślin . 5 (6): 684–6. doi : 10.4161/psb.5.6.11573 . PMC 3001559 . PMID 20400846 .
•    Miura E, Kato Y, Sakamoto W (maj 2010). „Analiza porównawcza transkryptomu zielono-białych sektorów barwnych u Arabidopsis yellow variegated2: reakcje na stres oksydacyjny i inne stresy w sektorach białych” . Dziennik botaniki eksperymentalnej . 61 (9): 2433–45. doi : 10.1093/jxb/erq075 . PMC 2877895 . PMID 20400527 .
•    Jia X, Mendu V, Tang G (2010). „Platforma macierzowa do identyfikacji mikroRNA reagujących na stres w roślinach”. Roślinna tolerancja na stres . Metody w biologii molekularnej . Tom. 639. s. 253–69. doi : 10.1007/978-1-60761-702-0_15 . ISBN 978-1-60761-701-3 . Identyfikator PMID 20387051 .
•   Li YF, Zheng Y, Addo-Quaye C, Zhang L, Saini A, Jagadeeswaran G, Axtell MJ, Zhang W, Sunkar R (czerwiec 2010). „Identyfikacja całego transkryptomu celów mikroRNA w ryżu”. Dziennik roślin . 62 (5): 742–59. doi : 10.1111/j.1365-313X.2010.04187.x . Identyfikator PMID 20202174 .
•   Ding YF, Wang GY, Fu YP, Zhu C (luty 2010). „[Rola miR398 w reakcjach roślin na stres]”. Yi Chuan = dziedzictwo . 32 (2): 129–34. doi : 10.3724/sp.j.1005.2010.00129 . Identyfikator PMID 20176556 .
•   Beauclair L, Yu A, Bouché N (maj 2010). „Rozszczepienie kierowane przez mikroRNA i represja translacji białka opiekuńczego miedzi dla mRNA dysmutazy ponadtlenkowej u Arabidopsis” (PDF) . Dziennik roślin . 62 (3): 454–62. doi : 10.1111/j.1365-313X.2010.04162.x . PMID 20128885 .
•    Lee H, Yoo SJ, Lee JH, Kim W, Yoo SK, Fitzgerald H, Carrington JC, Ahn JH (maj 2010). „Ramy genetyczne regulacji czasu kwitnienia przez miRNA reagujące na temperaturę otoczenia u Arabidopsis” . Badania kwasów nukleinowych . 38 (9): 3081–93. doi : 10.1093/nar/gkp1240 . PMC 2875011 . PMID 20110261 .
•   Gu M, Xu K, Chen A, Zhu Y, Tang G, Xu G (luty 2010). „Analiza ekspresji sugeruje potencjalną rolę mikroRNA w sygnalizacji mikoryzy fosforanowej i arbuskularnej w Solanum lycopersicum”. Fizjologia Plantarum . 138 (2): 226–37. doi : 10.1111/j.1399-3054.2009.01320.x . PMID 20015123 .
•    Trindade I, Capitão C, Dalmay T, Fevereiro MP, Santos DM (luty 2010). „MiR398 i miR408 są regulowane w górę w odpowiedzi na deficyt wody w Medicago truncatula”. Planta . 231 (3): 705–16. doi : 10.1007/s00425-009-1078-0 . PMID 20012085 . S2CID 12943657 .
•    Hsieh LC, Lin SI, Shih AC, Chen JW, Lin WY, Tseng CY, Li WH, Chiou TJ (grudzień 2009). „Odkrywanie odpowiedzi na niedobór fosforanów u Arabidopsis, w których pośredniczy mały RNA, poprzez głębokie sekwencjonowanie” . Fizjologia roślin . 151 (4): 2120–32. doi : 10.1104/pp.109.147280 . PMC 2785986 . PMID 19854858 .
•    Jia X, Wang WX, Ren L, Chen QJ, Mendu V, Willcut B, Dinkins R, Tang X, Tang G (wrzesień 2009). „Różnicowa i dynamiczna regulacja miR398 w odpowiedzi na ABA i stres solny u Populus tremula i Arabidopsis thaliana”. Biologia molekularna roślin . 71 (1–2): 51–9. doi : 10.1007/s11103-009-9508-8 . PMID 19533381 . S2CID 21096126 .
•   Ding YF, Zhu C (sierpień 2009). „Rola mikroRNA w homeostazie miedzi i kadmu”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 386 (1): 6–10. doi : 10.1016/j.bbrc.2009.05.137 . PMID 19501049 .
•    Siré C, Moreno AB, Garcia-Chapa M, López-Moya JJ, San Segundo B (marzec 2009). „Dobowa oscylacja w akumulacji mikroRNA Arabidopsis, miR167, miR168, miR171 i miR398”. Listy FEBS . 583 (6): 1039–44. doi : 10.1016/j.febslet.2009.02.024 . hdl : 10261/101742 . PMID 19236868 . S2CID 25968907 .
•    Jagadeeswaran G, Saini A, Sunkar R (marzec 2009). „Stres biotyczny i abiotyczny obniża ekspresję miR398 u Arabidopsis”. Planta . 229 (4): 1009-14. doi : 10.1007/s00425-009-0889-3 . PMID 19148671 . S2CID 31993796 .
•    Yamasaki H, Hayashi M, Fukazawa M, Kobayashi Y, Shikanai T (styczeń 2009). „Promotor SQUAMOSA wiążący białko podobne do 7 jest centralnym regulatorem homeostazy miedzi u Arabidopsis” . Komórka Roślinna . 21 (1): 347–61. doi : 10.1105/tpc.108.060137 . PMC 2648088 . PMID 19122104 .
•   Hewezi T, Howe P, Maier TR, Baum TJ (grudzień 2008). „Małe RNA Arabidopsis i ich cele podczas pasożytnictwa cyst nicieni” . Molekularne interakcje roślina-drobnoustroj . 21 (12): 1622–34. doi : 10.1094/MPMI-21-12-1622 . PMID 18986258 .
•    Abdel-Ghany SE, Pilon M (czerwiec 2008). „Ogólnoustrojowa regulacja w dół ekspresji białka miedzi za pośrednictwem mikroRNA w odpowiedzi na niską dostępność miedzi u Arabidopsis” . Journal of Biological Chemistry . 283 (23): 15932–45. doi : 10.1074/jbc.M801406200 . PMC 3259626 . PMID 18408011 .
•    Dugas DV, Bartel B (lipiec 2008). „Indukcja sacharozy przez Arabidopsis miR398 hamuje dwie dysmutazy nadtlenkowe Cu / Zn”. Biologia molekularna roślin . 67 (4): 403–17. doi : 10.1007/s11103-008-9329-1 . PMID 18392778 . S2CID 22984450 .
•    Yamasaki H, Pilon M, Shikanai T (kwiecień 2008). „Jak rośliny reagują na niedobór miedzi?” . Sygnalizacja i zachowanie roślin . 3 (4): 231–2. doi : 10.4161/psb.3.4.5094 . PMC 2634185 . PMID 19704637 .
•   Buhtz A, Springer F, Chappell L, Baulcombe DC, Kehr J (marzec 2008). „Identyfikacja i charakterystyka małych RNA z łyka Brassica napus” . Dziennik roślin . 53 (5): 739–49. doi : 10.1111/j.1365-313X.2007.03368.x . PMID 18005229 .
•   Yamasaki H, Abdel-Ghany SE, Cohu CM, Kobayashi Y, Shikanai T, Pilon M (czerwiec 2007). „Regulacja homeostazy miedzi przez mikro-RNA u Arabidopsis” . Journal of Biological Chemistry . 282 (22): 16369–78. doi : 10.1074/jbc.M700138200 . PMID 17405879 .
•    Sunkar R, Kapoor A, Zhu JK (sierpień 2006). „Indukcja potranskrypcyjna dwóch genów dysmutazy ponadtlenkowej Cu / Zn u Arabidopsis odbywa się za pośrednictwem regulacji w dół miR398 i jest ważna dla tolerancji na stres oksydacyjny” . Komórka Roślinna . 18 (8): 2051–65. doi : 10.1105/tpc.106.041673 . PMC 1533975 . PMID 16861386 .

Linki zewnętrzne

• Strona dla rodziny prekursorów mikroRNA mir-398 w Rfam