mikroRNA mir-96

microRNA mir-96
Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji mir-96
identyfikatorów
Symbol	mir-96
Alt. Symbolika	MIR96
Rfam	RF00669
miRBase	MI0000098
rodzina miRBase	MIPF0000072
Inne dane
typ RNA	gen ; miRNA
Domeny	Eukariota
IŚĆ	GO:0035068 GO:0035195
WIĘC	SO: 0001244
Struktury PDB	PDBe

Prekursor mikroRNA miR-96 to mały niekodujący RNA , który reguluje ekspresję genów . mikroRNA są transkrybowane jako prekursory ~ 80 nukleotydów , a następnie przetwarzane przez enzym Dicer , dając ~ 23 produkty nukleotydowe. W tym przypadku dojrzała sekwencja pochodzi z ramienia 5' prekursora. Uważa się, że dojrzałe produkty pełnią funkcje regulacyjne poprzez komplementarność do mRNA.

Uważa się, że miR-96 jest zachowany w obrębie Nephrozoa Nephrozoa, tj. Deuterostomów i Protostomów .

Zmienność w regionie nasion dojrzałego miR-96 została powiązana z autosomalną dominującą , postępującą utratą słuchu u ludzi i myszy. Homozygotyczne zmutowane myszy były głęboko głuche i nie wykazywały żadnych odpowiedzi ślimakowych . Myszy heterozygotyczne i ludzie stopniowo tracą zdolność słyszenia. Pięć genów spośród 132 przewidywanych celów zostało zweryfikowanych eksperymentalnie jako cele miR-96: Aqp5 , Celsr2 , Myrip, Odf2 i Ryk .

mikromacierzy 4-dniowych myszy typu dzikiego i zmutowanych wykazała, że ​​w 3 'UTR regulowanych w górę genów nastąpiło znaczne wzbogacenie w heptamery komplementarne do miR-96, co sugeruje, że miR-96 normalnie wpływa na szeroki zakres docelowych genów i że mutacja powoduje utratę normalnych celów. Wśród genów o obniżonej regulacji występuje znaczne wzbogacenie w heptamery komplementarne do zmutowanego miR-96, więc zmutowany miR-96 zyskał nowe cele. Wśród genów o obniżonej regulacji znalazło się pięć szczególnie interesujących; Ocm , Pitpnm1 , Prestin , Ptprq i Gfi1 , z których wszystkie są silnie i specyficznie wyrażane w komórkach rzęsatych. Myszy zmutowane dla tych trzech ostatnich wykazują głuchotę i degenerację komórek rzęsatych.

Wielokrotne dopasowanie sekwencji prekursorowych cząsteczek miR-96. Wysoce konserwatywne nukleotydy są zabarwione na czerwono, mniej konserwatywne nukleotydy są zabarwione na pomarańczowo, a niekonserwatywne nukleotydy są zabarwione na niebiesko lub biało. Kolumny odpowiadające sekwencji dojrzałej i nasiennej wskazano powyżej dopasowania. Kanoniczna sekwencja ludzka i dwie ludzkie sekwencje wariantowe, które są zaangażowane w utratę słuchu (13G>A i 14C>A) znajdują się odpowiednio w pierwszym, drugim i trzecim rzędzie.

Doniesienia medialne

• Informacja prasowa Sangera
• Nowe spojrzenie na postępującą utratę słuchu

Dalsza lektura

•    Kondkar AA, Bray MS, Leal SM i in. (2010). „VAMP8 / endobrewina ulega nadekspresji w nadreaktywnych ludzkich płytkach krwi: sugerowana rola mikroRNA płytek krwi” . J. Thromb. Hemost . 8 (2): 369–378. doi : 10.1111/j.1538-7836.2009.03700.x . PMC 3312605 . PMID 19943878 .
•    Modamio-Høybjør S, Moreno-Pelayo MA, Mencía A, et al. (2004). „Nowe miejsce dla autosomalnej dominującej niesyndromicznej utraty słuchu, DFNA50, mapuje się na chromosomie 7q32 między loci głuchoty DFNB17 i DFNB13” . J. Med. Genet . 41 (2): e14. doi : 10.1136/jmg.2003.012500 . PMC 1735673 . PMID 14757864 .
•    Guttilla IK, Biały BA (2009). „Koordynacja regulacji FOXO1 przez miR-27a, miR-96 i miR-182 w komórkach raka piersi” . J. Biol. chemia . 284 (35): 23204–23216. doi : 10.1074/jbc.M109.031427 . PMC 2749094 . PMID 19574223 .

Linki zewnętrzne

• Strona dla rodziny prekursorów mikroRNA mir-96 w Rfam
• Strona miRBase dla rodziny prekursorów mikroRNA mir-96
• Strona HGNC dla rodziny prekursorów mikroRNA mir-96
• Strona OMIM dla rodziny prekursorów mikroRNA mir-96
• Strona ENTREZ dla rodziny prekursorów mikroRNA mir-96