miR-338
| miR-338 | |
|---|---|
 Konserwatywna struktura drugorzędowa prekursora miR-338 microRNA
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | miR-338 |
| Alt. Symbolika | MIR338 |
| Rfam | RF00686 |
| miRBase | MI0000814 |
| rodzina miRBase | MIPF0000097 |
| Gen NCBI | 442906 |
| HGNC | 31775 |
| OMIM | 614059 |
| RefSeq | NR_029897 |
| Inne dane | |
| typ RNA | miRNA |
| Domeny | ssaki |
| IŚĆ | 0035195 |
| WIĘC | 0001244 |
| Umiejscowienie | Chr. 17 q25.3 |
| Struktury PDB | PDBe |
miR-338 to rodzina specyficznych dla mózgu prekursorów mikroRNA występujących u ssaków , w tym u ludzi . Dojrzała sekwencja miRNA ~22 nukleotydów jest wycinana z prekursorowej spinki do włosów przez enzym Dicer . Sekwencja ta wiąże się następnie z RISC , co wpływa na interferencję RNA .
miR-338 znajduje się w regionie intronowym w genie kinazy tyrozynowej związanej z apoptozą ( AATK ). Przewiduje się, że może zmniejszać ekspresję genów, które mają negatywny wpływ na ekspresję AATK.
Funkcjonować
miR-338 jest specyficznym dla mózgu miRNA, który reguluje ekspresję oksydazy cytochromu c IV (COX4). Dojrzała sekwencja miRNA miR-338 jest komplementarna do krótkiego odcinka nieulegającego translacji regionu 3' mRNA COX4 . Ta sekwencja mRNA jest prezentowana na szczycie pnia-pętli , co wskazuje, że jest dostępna dla przetwarzania miRNA.
Aplikacje
miR-338 jest rozregulowany w nerwiaku niedojrzałym i może potencjalnie zostać wdrożony jako biomarker lub przyszły środek terapeutyczny. miR-338 został również powiązany z rakiem wątrobowokomórkowym i zasugerowano test diagnostyczny na dużą skalę obejmujący pomiar ekspresji miR-338 w próbkach tkanek. Co więcej, miR-338 jest jednym z siedmiu mikroRNA, których profile ekspresji można łączyć, aby przewidzieć prawdopodobieństwo przeżycia pacjenta z rakiem żołądka .
Dalsza lektura
- On QY, Peng GP, Liu WX, Luo BY (listopad 2010). „[Interakcja microRNA-338 i jego potencjalnego białka kierującego eiF4E3]”. Zhejiang da Xue Xue Bao. Yi Xue Ban = Dziennik Uniwersytetu Zhejiang. Nauki medyczne . 39 (6): 583–8. doi : 10.3785/j.issn.1008-9292.2010.06.006 . PMID 21166051 . (Chiński)
- Saba R, Goodman CD, Huzarewich RL, Robertson C, Booth SA (2008). Akbarian S (red.). „Podpis miRNA neurodegeneracji indukowanej przez priony” . PLOS JEDEN . 3 (11): e3652. Bibcode : 2008PLoSO...3.3652S . doi : 10.1371/journal.pone.0003652 . PMC 2575400 . PMID 18987751 .
Linki zewnętrzne