mir-126
| mir-126 | |
|---|---|
 struktura drugorzędowa prekursora miR-126 i konserwacja sekwencji.
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | mir-126 |
| Rfam | RF00701 |
| rodzina miRBase | MIPF0000115 |
| OMIM | 611767 |
| Inne dane | |
| typ RNA | mikroRNA |
| Domeny | Eukariota |
| WIĘC | SO: 0001244 |
| Struktury PDB | PDBe |
W biologii molekularnej mir-126 jest krótką niekodującą cząsteczką RNA. Działanie mikroRNA polega na regulowaniu poziomów ekspresji innych genów za pomocą kilku mechanizmów przed i po transkrypcji.
Mir-126 to ludzkie mikroRNA, które ulega ekspresji tylko w komórkach śródbłonka , w naczyniach włosowatych, jak również w większych naczyniach krwionośnych i działa na różne transkrypty w celu kontrolowania angiogenezy .
Lokalizacja genomowa
miR-126 znajduje się w obrębie 7. intronu genu EGFL7 , który znajduje się na ludzkim chromosomie 9 .
mir-126*
mir-126* jest nicią komplementarną do mir-126, która tworzy się po rozszczepieniu dwuniciowego pri-miRNA i denaturacji dwóch nici, rozdzielając się. mir-126* występuje rzadziej w organizmach niż mir-126 i zidentyfikowano mniej ról w regulacji ekspresji genów. Jednak mir-126* został ostatnio zaangażowany w wyciszanie prostienu w komórkach innych niż śródbłonek. Prostein może być wytwarzany specjalnie w prostacie poprzez wyciszenie zarówno mir-126*, jak i EGFL7.
Regulacja ekspresji
mir-126 jest regulowany przez wiązanie dwóch czynników transkrypcyjnych : ETS1 i ETS2 . Wiązanie tych czynników indukuje transkrypcję pre-miRNA mir-126, w wyniku czego powstaje pri-miRNA spinki do włosów. MiRNA spinki do włosów jest kierowane do Dicer w celu rozszczepienia, w wyniku czego powstają dojrzałe transkrypty mir-126 i mir-126 *.
epigenetyczna genu gospodarza poprzez akumulację metylacji i wyciszania genów nukleosomów zmniejsza ekspresję wpływu intronowego miRNA. Zaobserwowano to w nowotworach, które czerpią korzyści z wyciszenia zarówno EGFL7, jak i mir-126, co skutkuje brakiem ekspresji żadnego z nich.
Zidentyfikowano tylko jeden polimorfizm pojedynczego nukleotydu w mir-126. Zmiana w 24. zasadzie zapobiega przetwarzaniu pri-miRNA w dojrzały miRNA, zmniejszając supresję różnych celów mir-126. Częstotliwość SNP różni się w zależności od pochodzenia etnicznego i potencjalnie jest związana z różnym nabywaniem chorób u ludzi.
Cele mir-126
miRNA wiąże się z sekwencjami docelowymi, zmniejszając ekspresję docelowego genu. miRNA może wiązać się albo bezpośrednio z DNA, zapobiegając transkrypcji , albo z transkrybowanym mRNA, zapobiegając translacji i kierując mRNA do degradacji. Jednym z głównych celów mir-126 jest gen gospodarza EGFL7. Transkrypcja obu występuje, jednak dojrzały mir-126 wiąże się z komplementarną sekwencją w obrębie EGFL7, uniemożliwiając translację mRNA, co skutkuje spadkiem poziomu białka EGFL7. Wiadomo, że EGFL7 bierze udział w migracji komórek i tworzeniu naczyń krwionośnych, co sprawia, że EGFL7 i mir-126 są odpowiednimi celami dla chorób, takich jak nowotwory, które wymagają ciągłego tworzenia naczyń krwionośnych w celu zaopatrywania guza w składniki odżywcze i szlaki migracji komórek w celu pośredniczenia w tkance inwazja.
- CRK , białko zaangażowane w wewnątrzkomórkowe szlaki sygnałowe zaangażowane w regulację adhezji komórkowej, proliferację, migrację i inwazję.
- TOM1 negatywny regulator szlaków sygnałowych IL-1beta i TNF-alfa .
- Produkcja CXCL12 , chemokiny , jest regulowana przez mir-126.
- POU3F1 , czynnik wymagany do aktywacji czynnika transkrypcyjnego PU.1 . PU.1 negatywnie reguluje GATA3 , zmieniając odpowiedź komórek T pomocniczych 2 .
- VEGF-A jest zmniejszone, ponieważ mir-126 wiąże się z nieulegającym translacji regionem 3' mRNA VEGF-A.
- IRS-1 hamuje przejście cyklu G1 do komórkowego z fazy G 0 / fazy S.
- HOXA9 , mir-126 moduluje ekspresję HOXA9 w komórkach krwiotwórczych . Geny HOX są ważnymi genami regulującymi rozwój.
Udział w homeostazie
Naprawa i konserwacja tkanek są ważnymi częściami cyklu życiowego organizmu, komórki i tkanki muszą pozostać w homeostazie , aby zapewnić przeżycie. Obejmuje to kontrolowaną śmierć komórek i reakcje na rany. Podczas apoptozy śmierć komórki uwalnia ciała apoptotyczne zawierające sygnały parakrynne do sąsiednich komórek. W komórkach śródbłonka mir-126 jest również uwalniany i w tych ciałach po wchłonięciu do sąsiedniej komórki indukuje ochronę naczyń zależną od CXCL12. CXCL12 wiąże się z receptorem CXCR4 aktywnie przeciwdziałając apoptozie i rekrutując komórki progenitorowe do miejsca uszkodzenia.
Udział w chorobie
Rak
Wykazano, że mir-126 jest zarówno supresorem guza , jak i onkogenem , w zależności od rodzaju raka. Hamowanie progresji nowotworu zachodzi poprzez negatywną kontrolę mir-126 proliferacji, migracji, inwazji i przeżycia komórek, podczas gdy mir-126 może również wspomagać progresję nowotworu poprzez promowanie tworzenia się naczyń krwionośnych i stanu zapalnego w miejscu aktywacji.
- mir-126 i mir126* ulegają nadekspresji w ostrej białaczce szpikowej .
- ekspresja mir-126 jest zmniejszona w raku jelita grubego .
- ekspresja mir-126 jest zmniejszona w raku żołądka .
- ekspresja mir-126 jest zmniejszona w liniach komórkowych raka płuc .
- ekspresja mir-126 jest zmniejszona w raku prostaty i raku pęcherza .
- ekspresja mir-126 jest zmniejszona w raku piersi . Hamuje również rekrutację śródbłonka przerzutów, angiogenezę i kolonizację poprzez interakcję z docelowymi genami IGFBP2 , PITPNC1 i MERTK .
- Zwiększona ekspresja mir-126 hamuje proliferację komórek niedrobnokomórkowego raka płuc in vitro i zapobiega wzrostowi guza poprzez celowanie w EGFL7.
Ostatnio mir-126 został użyty jako marker nowotworowy w nieinwazyjnej metodzie diagnostycznej. Próbki moczu były w stanie zidentyfikować na raka pęcherza oprócz tych, które nie zostały dotknięte chorobą, ponieważ małe RNA są łatwo wydalane z moczem.
Cukrzyca
cukrzycy typu 2 zaobserwowano niski poziom ekspresji wielu typów miRNA, w tym: mir-15a, mir-20b, mir-21, mir-124, mir-126, mir-191, mir-197, mir- 223 , mir -320 i mir-486. Zaobserwowano również zwiększoną ekspresję mir-28-3p. Konsekwencje błędnej regulacji tych miRNA nie zostały w pełni wyjaśnione, jednak wykazano, że ekspresja mir-126 zmniejsza się w odpowiedzi na wysokie poziomy glukozy. Spadek mir-15a, mir-29b, mir-126 i mir-223 poprzedza manifestację choroby, czyniąc te transkrypty możliwym celem testów diagnostycznych dla cukrzycy typu 2.
Mukowiscydoza
Porównanie mukowiscydozy z komórkami nabłonka dróg oddechowych niezwiązanymi z mukowiscydozą pokazuje, że różne miRNA są różnie regulowane w odpowiedzi na chorobę. Podejrzewa się, że mir-126 odgrywa rolę w regulowaniu wrodzonych odpowiedzi immunologicznych w płucach dotkniętych mukowiscydozą.
Astma alergiczna
mir-126 zwiększa odpowiedź immunologiczną na określone antygeny, co skutkuje nadmierną stymulacją układu odpornościowego i astmą alergiczną . Mir-126 wpływa na komórki T Helper 2 poprzez skomplikowany szlak interakcji, wzrost mir-126 powoduje wzrost odpowiedzi komórek T Helper 2.
Zobacz też
Dalsza lektura
- Kuhnert F, Mancuso MR, Hampton J, Stankunas K, Asano T, Chen CZ, Kuo CJ (2008). „Przypisanie fenotypów naczyniowych mysiego locus Egfl7 do mikroRNA miR-126” . Rozwój . 135 (24): 3989–93. doi : 10.1242/dev.029736 . PMID 18987025 .
- Fish JE, Santoro MM, Morton SU, Yu S, Yeh RF, Wythe JD, Ivey KN, Bruneau BG, Stainier DY, Srivastava D (2008). „miR-126 reguluje sygnalizację angiogenną i integralność naczyń” . Komórka Dev . 15 (2): 272–84. doi : 10.1016/j.devcel.2008.07.008 . PMC 2604134 . PMID 18694566 .
- Guo C, Sah JF, Beard L, Willson JK, Markowitz SD, Guda K (2008). „Niekodujący RNA, miR-126, hamuje wzrost komórek nowotworowych poprzez ukierunkowanie na sygnalizację kinazy fosfatydyloinozytolu 3 i często jest tracony w raku okrężnicy” . Geny Chromosomy Rak . 47 (11): 939–46. doi : 10.1002/gcc.20596 . PMC 2739997 . PMID 18663744 .
- Harris TA, Yamakuchi M, Ferlito M, Mendell JT, Lowenstein CJ (2008). „MicroRNA-126 reguluje śródbłonkową ekspresję cząsteczki adhezyjnej komórek naczyniowych 1” . Proceedings of the National Academy of Sciences, USA . 105 (5): 1516–21. doi : 10.1073/pnas.0707493105 . PMC 2234176 . PMID 18227515 .