rodzina prekursorów mikroRNA mir-9/mir-79

mir-9
RF00237.jpg
miR-9 struktura drugorzędowa mikroRNA i konserwacja sekwencji.
Identyfikatory
Symbol mir-9
Rfam RF00237
rodzina miRBase MIPF0000014
HGNC 31641
OMIM 611186
Inne dane
typ RNA mikroRNA
Domeny eukariota ;
Struktury PDB PDBe

MikroRNA miR-9 ( homologiczny do miR-79) to krótki niekodujący gen RNA zaangażowany w regulację genów . Dojrzałe ~21nt miRNA są przetwarzane z sekwencji prekursorowych spinki do włosów przez Dicer . Dominująca dojrzała sekwencja miRNA jest przetwarzana z ramienia 5' prekursora mir-9 iz ramienia 3' prekursora mir-79. Uważa się, że dojrzałe produkty pełnią funkcje regulacyjne poprzez komplementarność do mRNA . U kręgowców miR-9 ulega silnej ekspresji w mózgu i sugeruje się, że reguluje różnicowanie neuronów. Zaproponowano szereg konkretnych celów miR-9, w tym czynnik transkrypcyjny REST i jego partner CoREST.

Rozmieszczenie gatunków

miR-9 zidentyfikowano u Drosophila ( MI0000129 ), myszy ( MI0000720 ) i człowieka ( MI0000466 ), a pokrewny miR-79 u C. elegans ( MI0000050 ) i Drosophila melanogaster ( MI0000374 ).

Rola w chorobie

mikroRNA były zaangażowane w raka człowieka w wielu badaniach. Wykazano, że poziomy ekspresji ludzkiego miR-9 są obniżone w wielu raka piersi z powodu hipermetylacji , modyfikacji epigenetycznej . Hildebrandta i in . pokazują, że dwa geny kodujące has-miR-9 są znacząco hipermetylowane w nowotworach raka jasnokomórkowego nerki.

Dalsza lektura

Linki zewnętrzne

  1. ^    Kutty RK, Samuel W, Jaworski C, Duncan T, Nagineni CN, Raghavachari N, Wiggert B, Redmond TM (2010). „Ekspresja mikroRNA w ludzkich komórkach nabłonka barwnikowego siatkówki (ARPE-19): zwiększona ekspresja mikroRNA-9 przez N- (4-hydroksyfenylo) retinamid” . Mol Vis . 16 : 1475–86. PMC 2925906 . PMID 20806079 .
  2. ^    Delaloy C, Gao FB (2010). „Nowa rola mikroRNA-9 w ludzkich progenitorowych komórkach nerwowych” . Cykl komórkowy . 9 (15): 2913–4. doi : 10.4161/cc.9.15.12699 . PMC 5764704 . PMID 20676037 .
  3. ^    Laneve P, Gioia U, Andriotto A, Moretti F, Bozzoni I, Caffarelli E (2010). „Miniobwody obejmujące REST i CREB kontrolują ekspresję miR-9-2 podczas różnicowania ludzkich neuronów” . Kwasy nukleinowe Res . 38 (20): 6895–905. doi : 10.1093/nar/gkq604 . PMC 2978373 . PMID 20624818 .
  4. ^   Almeida MI, Reis RM, Calin GA (2010). „Połączenie MYC-microRNA-9-przerzuty w raku piersi” . Rozdz . komórki 20 (6): 603–4. doi : 10.1038/cr.2010.70 . PMID 20502442 .
  5. ^   Uchida N. (2010). „MicroRNA-9 kontroluje mechanizm migracji w ludzkich progenitorowych komórkach nerwowych” . Komórka Komórka Macierzysta . 6 (4): 294-6. doi : 10.1016/j.stem.2010.03.010 . PMID 20362531 .
  6. ^    Wang K, Długie B, Zhou J, Li PF (2010). „miR-9 i NFATc3 regulują miokardinę w przeroście mięśnia sercowego” . J Biol Chem . 285 (16): 11903–12. doi : 10.1074/jbc.M109.098004 . PMC 2852927 . PMID 20177053 .
  7. ^   Khew-Goodall Y, Goodall GJ (2010). „MiR-9 modulowany przez Myc powoduje więcej przerzutów” . Nat Cell Biol . 12 (3): 209–11. doi : 10.1038/ncb0310-209 . PMID 20173743 .
  8. ^    Ma L, Young J, Prabhala H, Pan E, Mestdagh P, Muth D, Teruya-Feldstein J, Reinhardt F, Onder TT, Valastyan S, Westermann F, Speleman F, Vandesompele J, Weinberg RA (2010). „miR-9, mikroRNA aktywowany przez MYC / MYCN, reguluje E-kadherynę i przerzuty raka” . Nat Cell Biol . 12 (3): 247–56. doi : 10.1038/ncb2024 . PMC 2845545 . PMID 20173740 .
  9. ^    Wan HY, Guo LM, Liu T, Liu M, Li X, Tang H (2010). „Regulacja czynnika transkrypcyjnego NF-kappaB1 przez mikroRNA-9 w ludzkim gruczolakoraku żołądka” . Mol Rak . 9 (1): 16. doi : 10.1186/1476-4598-9-16 . PMC 2835654 . PMID 20102618 .
  10. ^    Guo LM, Pu Y, Han Z, Liu T, Li YX, Liu M, Li X, Tang H (2009). „MicroRNA-9 hamuje wzrost komórek raka jajnika poprzez regulację NF-kappaB1”. FEBS J. 276 (19): 5537–46. doi : 10.1111/j.1742-4658.2009.07237.x . PMID 19702828 . S2CID 19354709 .
  11. ^    Tan HX, Wang Q, Chen LZ, Huang XH, Chen JS, Fu XH, Cao LQ, Chen XL, Li W, Zhang LJ (2010). „MicroRNA-9 zmniejsza inwazję komórek i wydzielanie E-kadheryny w komórce SK-Hep-1”. Med Oncol . 27 (3): 654–60. doi : 10.1007/s12032-009-9264-2 . PMID 19572217 . S2CID 195246235 .
  12. ^    Hsu PY, Deatherage DE, Rodriguez BA, Liyanarachchi S, Weng YI, Zuo T, Liu J, Cheng AS, Huang TH (2009). „Epigenetyczna represja mikroRNA-9-3 wywołana ksenoestrogenem w komórkach nabłonka piersi” . Rak Res . 69 (14): 5936–45. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-4914 . PMC 2855843 . PMID 19549897 .
  13. ^    Luo H, Zhang H, Zhang Z, Zhang X, Ning B, Guo J, Nie N, Liu B, Wu X (2009). „Regulowane w dół miR-9 i miR-433 w ludzkim raku żołądka” . J Exp Clin Cancer Res . 28 (1): 82. doi : 10.1186/1756-9966-28-82 . PMC 2739520 . PMID 19531230 .
  14. ^    Denli AM, Cao X, Gage FH (2009). „miR-9 i TLX: pogoń za ogonami w nerwowych komórkach macierzystych”. Nat Struct Mol Biol . 16 (4): 346–7. doi : 10.1038/nsmb0409-346 . PMID 19343066 . S2CID 9788995 .
  15. ^    Zhao C, Sun G, Li S, Shi Y (2009). „Pętla regulacyjna ze sprzężeniem zwrotnym obejmująca mikroRNA-9 i receptor jądrowy TLX w określaniu losu nerwowych komórek macierzystych” . Nat Struct Mol Biol . 16 (4): 365–71. doi : 10.1038/nsmb.1576 . PMC 2667220 . PMID 19330006 .
  16. ^    Bazzoni F, Rossato M, Fabbri M, Gaudiosi D, Mirolo M, Mori L, Tamassia N, Mantovani A, Cassatella MA, Locati M (2009). „Funkcja indukcyjna i regulacyjna miR-9 w ludzkich monocytach i neutrofilach wystawionych na sygnały prozapalne” . Proc Natl Acad Sci USA . 106 (13): 5282–7. doi : 10.1073/pnas.0810909106 . PMC 2664036 . PMID 19289835 .
  17. ^    Packer AN, Xing Y, Harper SQ, Jones L, Davidson BL (2008). „Dwufunkcyjny mikroRNA miR-9 / miR-9 * reguluje REST i CoREST i jest obniżony w chorobie Huntingtona” . J Neurosci . 28 (53): 14341–6. doi : 10.1523/JNEUROSCI.2390-08.2008 . PMC 3124002 . PMID 19118166 .
  18. ^    Shibata M, Kurokawa D, Nakao H, Ohmura T, Aizawa S (2008). „MicroRNA-9 moduluje różnicowanie komórek Cajala-Retziusa poprzez tłumienie ekspresji Foxg1 w paliuszu przyśrodkowym myszy” . J Neurosci . 28 (41): 10415–21. doi : 10.1523/JNEUROSCI.3219-08.2008 . PMC 6671033 . PMID 18842901 .
  19. ^   Chao TF, Zhang Y, Yan XQ, Yin B, Gong YH, Yuan JG, Qiang BQ, Peng XZ (2008). „[MiR-9 reguluje ekspresję CBX7 w ludzkim glejaku]”. Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao . 30 (3): 268–74. PMID 18686603 .
  20. ^    Pietrzykowski AZ, Friesen RM, Martin GE, Puig SI, Nowak CL, Wynne PM, Siegelmann HT, Treistman SN (2008). „Posttranskrypcyjna regulacja stabilności wariantu składania kanału BK przez miR-9 leży u podstaw neuroadaptacji do alkoholu” . neuron . 59 (2): 274–87. doi : 10.1016/j.neuron.2008.05.032 . PMC 2714263 . PMID 18667155 .
  21. Bibliografia Linki zewnętrzne    , Spector Y, Bentwich Z, Barshack I, Rosenfeld N (2009). „MiR-92b i miR-9/9* ulegają swoistej ekspresji w pierwotnych guzach mózgu i mogą być stosowane do różnicowania pierwotnych i przerzutowych guzów mózgu” . Patol mózgu . 19 (3): 375–83. doi : 10.1111/j.1750-3639.2008.00184.x . PMC 2728890 . PMID 18624795 .
  22. ^    Delaloy C, Gao FB (2008). „wielozadaniowość mikroRNA-9 w pobliżu centrów organizacyjnych” . Nat Neurosci . 11 (6): 625–6. doi : 10.1038/nn0608-625 . PMC 4446695 . PMID 18506136 .
  23. ^    Leucht C, Stigloher C, Wizenmann A, Klafke R, Folchert A, Bally-Cuif L (2008). „MicroRNA-9 kieruje późną aktywnością organizatora granicy śródmózgowia i tyłomózgowia”. Nat Neurosci . 11 (6): 641–8. doi : 10.1038/nn.2115 . PMID 18454145 . S2CID 7031726 .
  24. ^    Laios A, O'Toole S, Flavin R, Martin C, Kelly L, Ring M, Finn SP, Barrett C, Loda M, Gleeson N, D'Arcy T, McGuinness E, Sheils O, Sheppard B, O' Leary J. (2008). „Potencjalna rola miR-9 i miR-223 w nawracającym raku jajnika” . Mol Rak . 7 (1): 35. doi : 10.1186/1476-4598-7-35 . PMC 2383925 . PMID 18442408 .
  25. ^    Lehmann U, Hasemeier B, Christgen M, Müller M, Römermann D, Langer F, Kreipe H (2008). „Epigenetyczna inaktywacja genu mikroRNA hsa-mir-9-1 w ludzkim raku piersi”. J Patol . 214 (1): 17–24. doi : 10.1002/ścieżka.2251 . PMID 17948228 . S2CID 22024957 .
  26. ^   Plaisance V, Abderrahmani A, Perret-Menoud V, Jacquemin P, Lemaigre F, Regazzi R (2006). „MicroRNA-9 kontroluje ekspresję Granuphilin / Slp4 i odpowiedź wydzielniczą komórek produkujących insulinę” . J Biol Chem . 281 (37): 26932–42. doi : 10.1074/jbc.M601225200 . PMID 16831872 .
Pobrane z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mir-9/mir-79_microRNA_precursor_family&oldid=1088610199 ”