prekursor mikroRNA mir-7
| prekursor mikroRNA mir-7 | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji mir-7
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | mir-7 |
| Rfam | RF00053 |
| miRBase | MI0000263 |
| rodzina miRBase | MIPF0000022 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; miRNA |
| Domeny | Eukariota |
| IŚĆ | GO:0035195 GO:0035068 |
| WIĘC | SO: 0001244 |
| Struktury PDB | PDBe |
Ta rodzina reprezentuje prekursor mikroRNA (miRNA) mir-7. Ten miRNA został przewidziany lub potwierdzony eksperymentalnie u wielu gatunków. miRNA są transkrybowane jako prekursory ~ 70 nukleotydów (modelowane tutaj), a następnie przetwarzane przez enzym Dicer w celu uzyskania produktu ~ 22 nukleotydów. W tym przypadku dojrzała sekwencja pochodzi z 5' prekursora. Zakres spinki do włosów prekursorów nie są ogólnie znane i są szacowane na podstawie prognozy szpilki do włosów. Zaangażowanie Dicer w przetwarzanie miRNA sugeruje związek ze zjawiskiem interferencji RNA.
Dojrzały miRNA-7 pochodzi z trzech prekursorów mikroRNA w ludzkim genomie, miR-7-1, miR-7-2 i miR-7-3. miRNA są numerowane na podstawie sekwencji dojrzałego RNA.
miR-7 jest bezpośrednio regulowany przez czynnik transkrypcyjny HoxD10.
Uważa się, że miRNA pełnią funkcje regulacyjne poprzez komplementarność do mRNA. miR-7 jest niezbędny do utrzymania stabilności regulacyjnej w warunkach zmian środowiskowych. Odgrywa ważną rolę w kontrolowaniu ekspresji mRNA. Gen miR-7 znajduje się w większości zsekwencjonowanych Urbilateria , a sekwencja jego dojrzałego produktu miRNA jest doskonale zachowana od pierścienic do człowieka, co wskazuje na silną konserwację funkcjonalną.
Cele miR-7
Prognozy bioinformatyczne sugerują, że region 3'-nieulegający translacji mRNA ludzkiego EGFR zawiera trzy docelowe miejsca mikroRNA-7 (miR-7), które nie są konserwowane u ssaków. W komórkach fotoreceptorów Drosophila miR-7 kontroluje sygnalizację receptora naskórkowego czynnika wzrostu (EGFR) i promuje różnicowanie fotoreceptorów. Wśród innych celów miR-7 są receptor insulinopodobnego czynnika wzrostu 1 (IGF1R) i PIK3CD, rodzina genów E(spl) i Pak1 (komórki nowotworowe). c-Fos jest również celem miR-7b u myszy. Translacja Pax6 w bocznej ścianie strefy podkomorowej rozwiniętych myszy jest regulowany potranskrypcyjnie przez wyciszanie genów za pośrednictwem miRNA-7a, co jest niezbędne do kontrolowania szybkości wytwarzania neuronów dopaminergicznych w opuszce węchowej.
Znaczenie kliniczne
Wiele ról i celów miR-7, jak również wzór jego ekspresji, powiązano z mechanizmami regulacyjnymi i patogenezą glejaka wielopostaciowego , raka piersi i innych typów nowotworów, a także schizofrenii i zaburzeń widzenia. Hamowanie ruchliwości, inwazyjności, wzrostu niezależnego od zakotwiczenia i potencjału rakotwórczego wysoce inwazyjnych komórek raka piersi poprzez wprowadzenie miR-7 sugeruje silny potencjał terapeutyczny miR-7.
Dalsza lektura
- Lagos-Quintana M, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T (październik 2001). „Identyfikacja nowych genów kodujących małe RNA ulegające ekspresji”. nauka . 294 (5543): 853–8. Bibcode : 2001Sci...294..853L . doi : 10.1126/science.1064921 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F65F-2 . PMID 11679670 . S2CID 18101169 .
- Ambros V (grudzień 2001). „mikroRNA: małe regulatory o wielkim potencjale” . komórka . 107 (7): 823-6. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458 .
- Chen H, Shalom-Feuerstein R, Riley J, Zhang SD, Tucci P, Agostini M, Aberdam D, Knight RA, Genchi G, Nicotera P, Melino G, Vasa-Nicotera M (kwiecień 2010). „miR-7 i miR-214 ulegają swoistej ekspresji podczas różnicowania nerwiaka niedojrzałego, rozwoju kory mózgowej i różnicowania embrionalnych komórek macierzystych oraz kontrolują wzrost neurytów in vitro”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 394 (4): 921–7. doi : 10.1016/j.bbrc.2010.03.076 . PMID 20230785 .
- Doxakis E (kwiecień 2010). „Post-transkrypcyjna regulacja ekspresji alfa-synukleiny przez mir-7 i mir-153” . Journal of Biological Chemistry . 285 (17): 12726–34. doi : 10.1074/jbc.M109.086827 . PMC 2857101 . PMID 20106983 .
- Pek JW, Lim AK, Kai T (wrzesień 2009). „Drosophila maelstrom zapewnia prawidłowe różnicowanie linii komórek macierzystych linii germinalnej poprzez represję mikroRNA-7” . Komórka rozwojowa . 17 (3): 417–24. doi : 10.1016/j.devcel.2009.07.017 . PMID 19758565 .
- Junn E, Lee KW, Jeong BS, Chan TW, Im JY, Mouradian MM (sierpień 2009). „Represja ekspresji alfa-synukleiny i toksyczności przez mikroRNA-7” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 106 (31): 13052-7. Bibcode : 2009PNAS..10613052J . doi : 10.1073/pnas.0906277106 . PMC 2722353 . PMID 19628698 .
- Correa-Medina M, Bravo-Egana V, Rosero S, Ricordi C, Edlund H, Diez J, Pastori RL (kwiecień 2009). „MicroRNA miR-7 ulega preferencyjnej ekspresji w komórkach wydzielania wewnętrznego rozwijającej się i dorosłej trzustki człowieka”. Wzorce ekspresji genów . 9 (4): 193–9. doi : 10.1016/j.gep.2008.12.003 . PMID 19135553 .
Linki zewnętrzne
- Strona dla prekursora mikroRNA mir-7 w Rfam
- Purow, Benjamin (grudzień 2008). „MIR7-1 (mikroRNA 7-1)” . Atlas genetyki i cytogenetyki w onkologii i hematologii .