Chromosom 17

Chromosom 17
Human male karyotpe high resolution - Chromosome 17 cropped.png

Para chromosomów 17 człowieka po pasmowaniu G. Jeden jest od matki, drugi od ojca.
Human male karyotype high resolution - Chromosome 17.png

Para chromosomów 17 w ludzkim kariogramie męskim .
Cechy
Długość ( bp )
84 276 897 pz (CHM13)
Liczba genów 1124 ( CCDS )
Typ autosom
Pozycja centromeru
Submetacentryczny (25,1 Mb/s)
Kompletne listy genów
CCDS Lista genów
HGNC Lista genów
UniProt Lista genów
NCBI Lista genów
Zewnętrzne przeglądarki map
zespół Chromosom 17
Entrez Chromosom 17
NCBI Chromosom 17
UCSC Chromosom 17
Pełne sekwencje DNA
RefSeq NC_000017 ( SZYBKO )
GenBank CM000679 ( SZYBKO )

Chromosom 17 jest jedną z 23 par chromosomów u ludzi . Ludzie zwykle mają dwie kopie tego chromosomu. Chromosom 17 obejmuje ponad 84 miliony par zasad (materiał budulcowy DNA ) i stanowi od 2,5 do 3% całkowitego DNA w komórkach .

Chromosom 17 zawiera klaster genów Homeobox B.

Geny

Liczba genów

Poniżej przedstawiono niektóre szacunki liczby genów ludzkiego chromosomu 17. Ponieważ naukowcy stosują różne podejścia do adnotacji genomu , ich przewidywania liczby genów na każdym chromosomie są różne (szczegóły techniczne można znaleźć w przewidywaniu genów ). Wśród różnych projektów wspólny projekt sekwencji kodowania konsensusu ( CCDS ) przyjmuje niezwykle konserwatywną strategię. Tak więc prognoza liczby genów CCDS stanowi dolną granicę całkowitej liczby genów kodujących ludzkie białka.

Oszacowany przez Geny kodujące białka Niekodujące geny RNA Pseudogenes Źródło Data wydania
CCDS 1124 — — 2016-09-08
HGNC 1132 325 458 2017-05-12
zespół 1184 1199 535 2017-03-29
UniProt 1169 — — 2018-02-28
NCBI 1199 757 566 2017-05-19

Lista genów

Zobacz też: Kategoria: Geny na ludzkim chromosomie 17

Poniżej znajduje się częściowa lista genów na ludzkim chromosomie 17. Aby uzyskać pełną listę, zobacz link w infoboksie po prawej stronie.

Poniżej przedstawiono niektóre geny i odpowiadające im położenie cytogenetyczne na chromosomie 17:

ramię P

ramię q

Choroby i zaburzenia

Inaktywacja mutacji PH w genach EVER1 lub EVER2 , które znajdują się obok siebie na chromosomie 17, powoduje Epidermodysplasia verruciformis .

Następujące choroby są związane z genami na chromosomie 17:

Zespół cytogenetyczny

Ideogramy pasma G ludzkiego chromosomu 17
Ideogram pasma G ludzkiego chromosomu 17 w rozdzielczości 850 bphs. Długość pasma na tym schemacie jest proporcjonalna do długości pary zasad. Ten typ ideogramu jest powszechnie używany w przeglądarkach genomu (np. Ensembl , UCSC Genome Browser ).
Wzorce pasm G ludzkiego chromosomu 17 w trzech różnych rozdzielczościach (400, 550 i 850). Długość pasma na tym schemacie jest oparta na ideogramach z ISCN (2013). Ten typ ideogramu przedstawia rzeczywistą względną długość pasma obserwowaną pod mikroskopem w różnych momentach procesu mitotycznego .
Pasma G ludzkiego chromosomu 17 w rozdzielczości 850 bphs
Chr. Ramię Zespół Początek ISCN
przystanek ISCN
Początek pary bazowej
Zatrzymanie pary bazowej
Plama Gęstość
17 P 13.3 0 385 1 3 400 000 gneg
17 P 13.2 385 550 3 400 001 6 500 000 GPS 50
17 P 13.1 550 784 6500001 10 800 000 gneg
17 P 12 784 990 10 800 001 16 100 000 GPS 75
17 P 11.2 990 1499 16 100 001 22 700 000 gn
17 P 11.1 1499 1664 22 700 001 25 100 000 acen
17 Q 11.1 1664 1815 25 100 001 27 400 000 acen
17 Q 11.2 1815 2104 27 400 001 33 500 000 gneg
17 Q 12 2104 2255 33 500 001 39 800 000 GPS 50
17 Q 21.1 2255 2461 39 800 001 40 200 000 gneg
17 Q 21.2 2461 2599 40 200 001 42 800 000 GPS 25
17 Q 21.31 2599 2874 42 800 001 46 800 000 gneg
17 Q 21.32 2874 3025 46 800 001 49 300 000 GPS 25
17 Q 21.33 3025 3176 49 300 001 52 100 000 gneg
17 Q 22 3176 3383 52 100 001 59 500 000 GPS 75
17 Q 23.1 3383 3451 59 500 001 60 200 000 gneg
17 Q 23.2 3451 3658 60 200 001 63 100 000 GPS 75
17 Q 23.3 3658 3781 63 100 001 64 600 000 gneg
17 Q 24.1 3781 3850 64 600 001 66 200 000 GPS 50
17 Q 24.2 3850 4001 66 200 001 69 100 000 gneg
17 Q 24.3 4001 4166 69 100 001 72 900 000 GPS 75
17 Q 25.1 4166 4400 72 900 001 76 800 000 gneg
17 Q 25.2 4400 4510 76 800 001 77 200 000 GPS 25
17 Q 25.3 4510 4950 77 200 001 83 257 441 gneg

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Chromosome_17&oldid=1133388003 ”