Haplogrupa E-M123

Haplogrupa E-M123
Możliwe miejsce pochodzenia Bliski Wschód , północno-wschodnia Afryka lub Róg Afryki
Przodek E-Z830
Potomków E-M34
Definiowanie mutacji M123, L798.1, L799, L857

W genetyce człowieka haplogrupa Y E-M123 jest haplogrupą chromosomu Y i jest zdefiniowana przez mutację polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP) M123 . Podobnie jak jego najbliżsi krewni w ramach większej haplogrupy E-M215, E-M123 występuje w Azji , Europie i Afryce .

Pochodzenie

Jako najbardziej prawdopodobne źródło tej linii zaproponowano Bliski Wschód, a nie Afrykę Wschodnią. W rzeczywistości E-M34 wydaje się być ograniczony do Etiopii, ponieważ nie został wykryty w innych populacjach w regionie, takich jak Somalia, Kenia ( Cruciani i in. 2004 )

Dystrybucja

E-M123 jest najbardziej znany ze swojego głównego podkladu E-M34, który dominuje w tym kladzie. Jednak wcześniejsze badania nie testowały E-M34. Patrząc poza swoje wzorce geograficzne, E-M123 jest również dość powszechny w wielu języków semickich , w tym zarówno wśród Żydów aszkenazyjskich , jak i sefardyjskich , stanowiąc ponad 10% wszystkich linii męskich ( Semino 2004 ) .

Region i ludność N E-M34 Badanie
Natufianie (północny Izrael, 10 000 lat temu) 5 40-100 (dane niepełne) Lazaridis i in. 2016
Jordańczycy (Morze Martwe) 45 31.1 Flores i in. 2005
Amhara etiopska 34 23,5 Crucianiego i in. 2004
Maronici cypryjscy 57 21.05 Analiza porównawcza chromosomu Y wśród Cypryjczyków w kontekście wydarzeń historycznych i migracji. 2021
Żydzi libijscy 20 20.0 Shen i in. 2004
Grek cypryjski 344 13.10 Analiza chromosomu Y Greków cypryjskich ujawnia przede wszystkim wspólne przedosmańskie ojcowskie pochodzenie z Turkami cypryjskimi. 2017
Żydzi etiopscy 22 13.6 Crucianiego i in. 2004
Kurd 59 13.6 Grugni i in. 2012
włoska Kalabria 68 13.2 Semino i in. 2004
Jordańczycy 146 13.01 Floris i in. 2005
Beja Portugalia 8 12,5 Beleza i in. 2006
Oman 121 12.0 Abu-amero i in. 2009
Sahara/Mauretania 189 11.1 Bekada i in. 2013
Asyryjski Teheran Iran 9 11.1 Grugni i in. 2012
Mazara del Vallo Sycylia Włochy 18 11.1 Di Gaetano i in. 2009
Piazza Armerina Sycylia Włochy 28 10.71 Di Gaetano i in. 2009
Troina Sycylia Włochy 30 10.0 Di Gaetano i in. 2009
Kabyle algierskie 19 10,5 Arredi i in. 2004
Północni Egipcjanie 49 10.2 Trombetta i in. 2015
Hazara ( Bamiyan ) 69 10.1 Di Cristofaro i in. 2013
Żydów jemeńskich 20 10.0 Shen i in. 2004
Żydów sefardyjskich 40 10.0 Semino i in. 2004

Żydzi aszkenazyjscy nie-Lewici, nie-Kohanim
74 10.0 Młotek i in. 2009
Palestyńczycy 367 9.5 Zalloua i in. 2008
Azerski Iran 63 9.5 Grugni i in. 2012
etiopska wolayta 12 8.3 Crucianiego i in. 2004
Jemen 62 8.1 Cadenas i in. 2007
Etiopski Oromo 25 8 Crucianiego i in. 2004
Erzurum turecki 25 8 Crucianiego i in. 2004
Omanit 13 7.7 Crucianiego i in. 2004
Beduini 28 7.1 Crucianiego i in. 2004
Sycylijczycy 136 6.6 Crucianiego i in. 2004
sefardyjski turecki 19 5.3 Crucianiego i in. 2004
Zjednoczone Emiraty Arabskie 41 4.9 Crucianiego i in. 2004
Północni Egipcjanie 21 4.8 Crucianiego i in. 2004
południowo-wschodnia turecka 24 4.2 Crucianiego i in. 2004
Ormianie 413 4.1 Herrera i in. 2011
Druzowie Arabowie 28 3.6 Crucianiego i in. 2004
Sardyńczycy 367 3.5 Crucianiego i in. 2004
Berberowie z Marakeszu 29 3.4 Crucianiego i in. 2004
Palestyńczycy 29 3.4 Crucianiego i in. 2004
Centralny Anatolijczyk 61 3.3 Crucianiego i in. 2004
Stambuł turecki 35 2.9 Crucianiego i in. 2004
południowo-zachodni turecki 40 2.5 Crucianiego i in. 2004
Południowi Włosi 87 2.3 Crucianiego i in. 2004
Turków cypryjskich 46 2.2 Crucianiego i in. 2004
azerski 97 2.1 Crucianiego i in. 2004
Północni Włosi 67 1.5 Crucianiego i in. 2004
Korsykanie 140 1.4 Crucianiego i in. 2004
Asturianie 90 1.1 Crucianiego i in. 2004
Kaukaz 1952 0,4 Yunusbajew i in. 2011
Północny Portugalczyk 50 ... Crucianiego i in. 2004
południowy portugalski 49 ... Crucianiego i in. 2004
Pasiegosa z Kantabrii 56 ... Crucianiego i in. 2004
Hiszpanie z południa 62 ... Crucianiego i in. 2004
Hiszpańscy Baskowie 55 ... Crucianiego i in. 2004
Francuski 85 ... Crucianiego i in. 2004
francuskich Basków 16 ... Crucianiego i in. 2004
Wyspiarze z Orkadów 7 ... Crucianiego i in. 2004
duński 35 ... Crucianiego i in. 2004
Środkowi Włosi 89 ... Crucianiego i in. 2004
Polski 38 ... Crucianiego i in. 2004
Estończycy 74 ... Crucianiego i in. 2004
Rosjanie 42 ... Crucianiego i in. 2004
Rumuni 14 ... Crucianiego i in. 2004
Bułgarzy 808 1.9 Karachanak i in. 2013
Albańczycy 19 ... Crucianiego i in. 2004

Dystrybucja podkladów

E-M123* (przetestowany i zdecydowanie bez E-M34)

Takie przypadki są stosunkowo rzadkie, ale zgłoszono następujące.

E-M123 był czasami zgłaszany bez sprawdzania M-34 SNP, na przykład:

  • Boscha i in. (2006) znaleźli przykłady E-M123 w Grecji , Republice Macedonii i Rumunii .
  • Beleza i in. (2006) również znaleźli przykłady w Portugalii.
  • Sanchez i in. (2005) znaleźli jedną próbkę w Somalii.
  • Semino i in. (2004) podaje stosunkowo wysoki poziom 13% w albańskiej społeczności Cosenza w Kalabrii . Szczególnie wysoka częstotliwość regionalna dla E-M123 miała miejsce w Omanie , gdzie najwyraźniej jest dominującym kladem E-M35.
  • Luis i in. (2004) stwierdzili, że 12 mężczyzn na 121 miało pozytywny wynik na E-M123, podczas gdy w Egipcie było 7 na 147. Ale w tym badaniu różnorodność Omanu E-M123 sugerowała młodszy wiek niż E-M123 znaleziony w Egipcie. ( Cruciani i wsp. (2004) przetestowali E-M34 w Omanie i stwierdzili, że 7,7% to E-M34+, bez E-M123*.)
  • Di Gaetano i in. (2008) stwierdzili łącznie 4,66% w swoich 236-osobowych badaniach na Sycylii, z wyższymi poziomami we wschodniej części wyspy. Nie znaleźli nikogo w Trapani (33 osoby), Alcamo (24 osoby) i Cacamo (16 osób) wzdłuż zachodniego wybrzeża północnego; 3,23% w San Ninfa (31 osób) w głębi lądu na zachodzie; 3,57% w Sciacca (28 osób) i Ragusa (28 osób) wzdłuż południowego wybrzeża; a następnie wysokie poziomy na wschodzie w Troinie (10% z 30 osób), Piazza Armerina (10,71% z 28 osób), a także w pobliżu południowo-zachodniego krańca Afryki w Mazaro de Vallo (11,11% z 18 osób).
  • Adamsa i in. (2008) znaleźli 11 osób E-M123 w ich 1140-osobowym badaniu na Iberii: 1 na 95 wschodnich Andaluzyjczyków; 1 na 100 północno-zachodnich Kastylijczyków; 1 na 80 Katalończyków; 2 z 52 Extramadurańczyków; 2 z 60 północnych Portugalczyków, 1 z 78 południowych Portugalczyków, 1 z 73 południowych Portugalczyków; 1 z 73 Walencjan; i najwyższe poziomy najwyraźniej na Balearach z 5 z 37 mieszkańców Minorki i 4 z 54 mieszkańców Ibizy. Nie było ich na Majorce (62 osoby), Gaskonii (24), Galicji (88), NE Kastylii (31), Kastylii-La Manchy (63), Kraju Basków (116), Asturii (20), Zachodniej Andaluzji (73 ) i Aragonii (34).
  • Contu i in. (2008) znaleźli 9 z 323 osób w 3 obszarach Sardynii. 4 na 187 w Cagliari, 1 na 103 w Sorgono i 4 na 86 w Tempio .
  • Shen i in. (2004) stwierdzili, że 10 ze 169 Izraelczyków i Palestyńczyków o różnym pochodzeniu to M123+ i M34+, przy czym grupa najwyższego szczebla to 4 z 20 izraelskich Żydów pochodzenia libijskiego

A E-M34 był czasami testowany bez testowania M123:

  • Według Crucianiego i in. (2004) , E-M34 występuje na małych częstotliwościach w Afryce Północnej i Europie Południowej (6,6% na przykład na Sycylii), a jego najwyższe stężenie występuje w Etiopii i na Bliskim Wschodzie (z najwyższymi poziomami w Omanie i Turcji). Ponieważ jednak różnorodność w Etiopii jest najwyraźniej niska, autorzy sugerują, że E-M34 został prawdopodobnie sprowadzony do Etiopii z Bliskiego Wschodu.
  • W Turcji Cinnioğlu i in. (2004) znaleźli nieco więcej E-M34 (29) niż E-M78 (26) z 523 badanych osobników (znacznie inna populacja E1b1b niż znaleziona na pobliskich Bałkanach).
  • Flores i in. (2004) odnotowali E-M34 w kilku częściach Półwyspu Iberyjskiego, ale najbardziej uderzająco około 10% w Galicji .
  • Gonçalves i in. (2005) stwierdzili mniej więcej takie same poziomy E-M34 w Portugalii jak E-M123*, ale E-M34 głównie w środkowej Portugalii (4 osoby na 102 tam przebadane), z jeszcze jedną osobą na Azorach .
  • Co uderzające, Flores i in. (2005) stwierdzili, że 14 z 45 mężczyzn przebadanych w rejonie Morza Martwego w Jordanii miało pozytywny wynik M34 (31,1%), podczas gdy w stolicy Ammanie było tylko 4 na 101.
  • Cadenas i in. (2007) stwierdzili, że 8,1% z 62 mężczyzn przebadanych w Jemenie miało pozytywny wynik na M34, w porównaniu do znacznie niższych poziomów w Katarze (1,4%) i Zjednoczonych Emiratach Arabskich (3,1%).
  • Arredi i in. (2004) w swoich badaniach 275 mężczyzn w Afryce Północnej znaleźli 2 ze 148 Tunezyjczyków z Tunisu, 2 z 19 algierskich Berberów z Tizi Ouzu w Kabylie (10,5%) i 3 z 44 Egipcjan z północy, 4 z 29 z południa Egipcjanie (czyli 9,5% wszystkich Egipcjan ).
  • Martineza i in. (2007) znaleźli 3 w swoich 168-osobowych badaniach na Krecie, 2 w Heraklionie i 1 w Lasithi.
  • Regueiro i in. (2006) znaleźli jednego w południowym Iranie na 117 osób i żadnego w północnym Iranie na 33 osoby.
  • Zalloua i in. (2008) stwierdzili 26 przypadków E-M123 na Cyprze spośród 164 przebadanych mężczyzn; i 27 Palestyńczyków z 291 przebadanych. To było najwyraźniej wyższe niż poziom E-M78.

Podklady E-M34

  • E-M84 , zdefiniowany przez mutację SNP M84, przy czym M136 definiuje podkladę od października 2008 r. Projekt E-M35 Phylogeny Project szacuje na podstawie dotychczasowych testów (w styczniu 2009 r.), Że E-M84 dominuje w 6 z 8 klastrów E-M34, które identyfikuje ten projekt.
  • E-M290 , zdefiniowany przez mutację SNP M290. Shen i in. (2004) znaleźli 1 palestyński egzemplarz.
  • E-V23 , zdefiniowany przez mutację SNP V23. Trombetta i in. (2011) ogłosili odkrycie tego kladu. Znaleźli to u dwóch osobników z Afryki. Autorzy ostrzegli, że nie potwierdzili jeszcze, że ten klad nie był podkladem ani kladem macierzystym ani M84, ani M290, więc pozycja filogenetyczna E1b1b1c1c jest niepewna.

Starożytne DNA

  • Według analiz genetycznych przeprowadzonych na sześciu szczątkach Natufijczyków z północnego Izraela, Natufianie nosili haplogrupę Y-DNA E-Z830, nieco pod wiatr klad E-M123 (a zatem jego przodek). Natufianie byli jednymi z pierwszych osiadłych ludów na świecie i mogli przyczynić się do udomowienia niektórych upraw, a tym samym do powstania rolnictwa. Odkrycie E-Z830 (bez innych kladów) sugeruje rdzenną obecność w Kanaanie i Izraelu który poprzedza wszystkie inne klady, o których nie wiadomo, że istniały w regionie w tamtym czasie (10 000 lat wcześniej). Uważa się, że E-M123 ma TMRCA około 18 000 lat temu, 8 000 lat przed powstaniem szczątków Natufijczyków (prawdopodobnie przodków).
  • Badanie historii Azji Południowej, Narasimhan et al. (2019) znaleźli kilka osobników należących do E-Y31991 w próbkach z późnej epoki brązu / wczesnej epoki żelaza w dolinie Swat we współczesnym północnym Pakistanie.
  • W badaniu 137 próbek starożytnych genomów eurazjatyckich znaleziono jednego środkowego Scyta, który należał do E-M123 * (E-Y31991), we współczesnym północno-wschodnim Kazachstanie, datowanego na 800-750 pne. Zgodnie z plikiem BAM, udostępnionym przez autorów, przypuszcza się, że jest on E-Y168273, kladem poniżej PF4428, który sam należy do E-M123*.

Filogenetyka

Historia filogenetyczna

Przed 2002 rokiem w literaturze akademickiej istniało co najmniej siedem systemów nazewnictwa drzewa filogenetycznego chromosomu Y. Doprowadziło to do sporego zamieszania. W 2002 roku główne grupy badawcze połączyły siły i utworzyły Konsorcjum Y-Chromosom Consortium (YCC). Opublikowali wspólny artykuł, który stworzył jedno nowe drzewo, którego wszyscy zgodzili się użyć. Później grupa naukowców-obywateli zainteresowanych genetyką populacyjną i genealogią genetyczną utworzyła grupę roboczą w celu stworzenia amatorskiego drzewa, którego celem jest przede wszystkim aktualność. Poniższa tabela zawiera wszystkie te prace w miejscu charakterystycznego drzewa YCC z 2002 roku. Pozwala to badaczowi przeglądającemu starszą opublikowaną literaturę na szybkie poruszanie się między nomenklaturami.

YCC 2002/2008 (stenografia) (α) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 (odręczny) YCC 2005 (odręczny) YCC 2008 (odręczny) YCC 2010r (odręczny) ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
E-P29 21 III 3A 13 UE3 H2 B MI* mi mi mi mi mi mi mi mi mi mi
E-M33 21 III 3A 13 UE3 H2 B E1* E1 E1a E1a E1 E1 E1a E1a E1a E1a E1a
E-M44 21 III 3A 13 UE3 H2 B E1a E1a E1a1 E1a1 E1a E1a E1a1 E1a1 E1a1 E1a1 E1a1
E-M75 21 III 3A 13 UE3 H2 B E2a E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2
E-M54 21 III 3A 13 UE3 H2 B E2b E2b E2b E2b1 - - - - - - -
E-P2 25 III 4 14 UE3 H2 B E3* E3 E1b E1b1 E3 E3 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1
E-M2 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a* E3a E1b1 E1b1a E3a E3a E1b1a E1b1a E1b1a E1b1a1 E1b1a1
E-M58 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a1 E3a1 E1b1a1 E1b1a1 E3a1 E3a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1a1a E1b1a1a1a
E-M116.2 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E1ba12 REMOVED REMOVED
E-M149 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a3 E3a3 E1b1a3 E1b1a3 E3a3 E3a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a1a1c E1b1a1a1c
E-M154 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a4 E3a4 E1b1a4 E1b1a4 E3a4 E3a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a1a1g1c E1b1a1a1g1c
E-M155 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a5 E3a5 E1b1a5 E1b1a5 E3a5 E3a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a1a1d E1b1a1a1d
E-M10 8 III 5 15 UE2 H2 B E3a6 E3a6 E1b1a6 E1b1a6 E3a6 E3a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a1a1e E1b1a1a1e
E-M35 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b* E3b E1b1b1 E1b1b1 E3b1 E3b1 E1b1b1 E1b1b1 E1b1b1 REMOVED REMOVED
E-M78 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b1* E3b1 E1b1b1a E1b1b1a1 E3b1a E3b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a1 E1b1b1a1
E-M148 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b1a E3b1a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E3b1a3a E3b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E1b1b1a1c1
E-M81 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b2* E3b2 E1b1b1b E1b1b1b1 E3b1b E3b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b1 E1b1b1b1a
E-M107 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b2a E3b2a E1b1b1b1 E1b1b1b1a E3b1b1 E3b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1a E1b1b1b1a1
E-M165 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b2b E3b2b E1b1b1b2 E1b1b1b1b1 E3b1b2 E3b1b2 E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b1a2a
E-M123 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b3* E3b3 E1b1b1c E1b1b1c E3b1c E3b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1b2a
E-M34 25 III 4 14 UE4 H2 B E3b3a* E3b3a E1b1b1c1 E1b1b1c1 E3b1c1 E3b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1b2a1
E-M136 25 III 4 14 UE4 H2 B E3ba1 E3b3a1 E1b1b1c1a E1b1b1c1a1 E3b1c1a E3b1c1a E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1b2a1a1

Publikacje naukowe

Następujące zespoły badawcze zgodnie z ich publikacjami były reprezentowane w tworzeniu drzewa YCC.

Drzewa filogenetyczne

  • E-M123 (M123)
    • E-M34 (M34)
      • E-M84 (M84)
        • E-M136 (M136)
      • E-M290 (M290)
      • E-V23 (V23)
      • E-L791 (L791,L792)

Zobacz też

Genetyka

Podklady Y-DNA E

Drzewo szkieletowe Y-DNA

Notatki

Prace cytowane

Źródła tabel konwersji

Dodatkowe źródła