Haplogrupa A-L1085

Haplogrupa A-L1085
Możliwy czas pochodzenia 140 000 YBP, 125 000 - 382 000 YBP
Możliwe miejsce pochodzenia Afryka Środkowa - Północno-Zachodnia
Przodek Homo Y-MRCA
Potomków A-V148 (A0), A-P305 (A1)
Najwyższe częstotliwości

Namibia (Tsumkwe San, Nama ) 60-70% Sudan Południowy ( Dinka , Shilluk , Nuer ) 33%-61,5% Etiopia ( Beta Izrael ) 41%-46%

Haplogrupa A-L1085 , znana również jako haplogrupa A0-T, jest haplogrupą ludzkiego Y-DNA . Jest częścią linii ojcowskiej prawie wszystkich żyjących obecnie ludzi. SNP L1085 odegrał dwie role w genetyce populacji : po pierwsze, większość haplogrup Y-DNA oddzieliła się od niego i; po drugie, definiuje niezróżnicowany klad podstawowy A-L1085 *.

A0-T ma dwie główne gałęzie: A-V148 (znana również jako haplogrupa A0) i haplogrupa A-P305 (haplogrupa A1).

Pochodzenie

Haplogrupa A jest powszechna wśród ludów nilotycznych . Wiadomo, że lud Khoisan nosi podkladę haplogrupy A z bardzo wysoką częstotliwością.

Wiele propozycji dotyczących pochodzenia haplogrupy A-L1085 sugeruje, że była ona związana z przodkami populacji łowców-zbieraczy z Afryki Południowej. Dzieje się tak, ponieważ rodowody haplogrupy A-L1085 są częste wśród ludu San .

Jednak linie rodowe A-L1085 z Afryki Południowej są podkladami linii A występujących w innych częściach Afryki, głównie wśród ludów nilotycznych , ale także wśród innych Afrykanów. Sugeruje to, że linie rodowe A-L1085 przybyły do ​​Afryki Południowej z innych miejsc. Dwie najbardziej podstawowe linie haplogrupy A-L1085, A-V148 i A-P305 wykryto w Afryce Zachodniej, Afryce Północno-Zachodniej i Afryce Środkowej. Crucianiego i in. 2011 sugeruje, że te linie mogły pojawić się gdzieś pomiędzy Afryką Środkową i Północno-Zachodnią, chociaż taka interpretacja jest nadal wstępna ze względu na niepełny zasięg geograficzny afrykańskich chromosomów Y.

Wstępne badania wykazały, że linie haplogrupy A-L1085 pojawiły się około 60 000 lat temu, co było znacznie nowsze niż TMRCA w przypadku linii mitochondrialnego DNA, które łączą się do 150-200 kya. Crucianiego i in. Rok 2011 wraz z poważną restrukturyzacją gałęzi cofnął korzeń drzewa chromosomu Y do 142 000 lat temu.

W listopadzie 2012 r. nowe badanie przeprowadzone przez Scozzari i in. potwierdził „hipotezę pochodzenia haplogrupy A1b w północno-zachodniej ćwiartce kontynentu afrykańskiego i wraz z niedawnymi odkryciami starożytnych linii chromosomu Y w środkowo-zachodniej Afryce dostarcza nowych dowodów dotyczących geograficznego pochodzenia ludzkiego MSY różnorodność".

Rozkład geograficzny

Afryka Centralna

Haplogrupa A-M13 została zaobserwowana w populacjach północnego Kamerunu (2/9 = 22% Tupuri , 4/28 = 14% Mandara, 2/17 = 12% Fulbe ) i wschodniej DRK (2/9 = 22% Alur , 1 /18 = 6% Hema , 1/47 = 2% Mbuti ).

Haplogrupę A-M91 (xA-M31, A-M6, A-M32) zaobserwowano u ludu Bakola w południowym Kamerunie (3/33 = 9%).

Bez testowania jakiejkolwiek podklady, haplogrupę A-L1085 zaobserwowano w próbkach kilku populacji Gabonu , w tym 9% (3/33) próbki Baka , 3% (1/36) próbki Ndumu, 2% (1/46) próbki Dumy , 2% (1/57) próbki Nzebi i 2% (1/60) próbki Tsogo .

Wschodnia Afryka

Haplogrupa A-M13 jest powszechna wśród Południowych Sudańczyków (53%), zwłaszcza Dinka (61,5%). Haplogrupę A-M13 zaobserwowano również w innej próbce populacji Sudanu Południowego z częstotliwością 45% (18/40), w tym 1/40 A-M171. Haplogrupa A została również zgłoszona w 14,6% (7/48) próbki Amhara , 10,3% (8/78) próbki Oromo , 13,6% (12/88) innej próbki z Etiopii i 41% próbki z Beta Israel (Cruciani i in. 2002), a także Bantus w Kenii (14%, Luis i in. 2004) oraz Iraku w Tanzanii (3/43 = 7,0% (Luis et al. 2004) do 1/6 = 17% (Knight et al. 2003)).

północna Afryka

Podkladę A1 zaobserwowano u libijskich Berberów , podczas gdy podkladę A-M13 zaobserwowano u około 3% egipskich mężczyzn.

Południowa Afryka

Jedno z badań wykazało haplogrupę A w próbkach różnych grup mówiących po khoisan z częstotliwością w zakresie od 10% do 70%. Ta konkretna haplogrupa nie została znaleziona w próbce Hadzabe z Tanzanii, populacji czasami grupowanej z innymi grupami Khoisan ze względu na obecność spółgłosek kliknięcia w ich języku, ale której język został dokładnie wykazany jako izolat tak niezwiązany z nimi jak inne języków dzięki pracy lingwistki Bonny Sands.

Europa

Haplogrupę A zaobserwowano jako A1 u europejskich mężczyzn w Anglii. Chromosom AY obserwowano również z niską częstotliwością w Azji Mniejszej, na Bliskim Wschodzie i na niektórych wyspach Morza Śródziemnego, wśród Greków Morza Egejskiego, Sycylijczyków (0,2% A1a w Capo d'Orlando i 0,5% A1b na całej wyspie) , Palestyńczyków , Jordańczycy i Jemeńczycy. Bez testowania jakiejkolwiek podklady, haplogrupę A1b zaobserwowano w próbce Greków z Mitilini na wyspie Lesbos na Morzu Egejskim , a A1b zaobserwowano również u 0,1% iberyjskich Żydów . Autorzy jednego z badań zgłosili znalezienie czegoś, co wydaje się być haplogrupą A u 3,1% (2/65) próby Cypryjczyków , chociaż nie wykluczyli ostatecznie możliwości, że którakolwiek z tych osób może należeć do haplogrupy B.

Dystrybucja podkladów

Przekierowanie haplogrupy A (Y-DNA) i jej potomków.

A-V148* (A0)*)

A-V148 jest jedną z dwóch głównych gałęzi w A0-T.

A-P305* (A1*)

Haplogrupa A-P305* jest w dużej mierze ograniczona do części Afryki , choć kilka przypadków odnotowano w Europie i Azji Zachodniej .

A-P305 występuje w najwyższych ilościach u Pigmejów Bakola ( Kamerun Południowy ) na poziomie 8,3% i Berberów z Algierii na poziomie 1,5% oraz w Ghanie . Klad osiąga również wysokie częstotliwości w łowców-zbieraczy Buszmenów w Afryce Południowej , a tuż za nim wiele grup nilotycznych w Afryce Wschodniej . Jednak najstarsze podklady haplogrupy A występują wyłącznie w środkowo - północno- zachodniej Afryce , gdzie uważa się, że on, a co za tym idzie Adam z chromosomem Y, powstał około 140 000 lat temu. Klad obserwowano również ze znaczną częstotliwością w niektórych populacjach w Etiopii , a także w niektórych grupach Pigmejów w Afryce Środkowej.

Haplogrupa A-L1085 jest mniej powszechna wśród osób mówiących w Nigrze i Kongo , którzy w dużej mierze należą do kladu E1b1a . Ogólnie uważa się, że haplogrupa E pochodzi z Afryki północno-wschodniej, a później została wprowadzona do Afryki Zachodniej , skąd rozprzestrzeniła się około 5000 lat temu do Afryki Środkowej, Południowej i Południowo-Wschodniej wraz z ekspansją Bantu . Według Wooda i in. (2005) oraz Rosa i in. (2007), takie stosunkowo niedawne ruchy populacji z Afryki Zachodniej zmieniły istniejącą wcześniej różnorodność chromosomów Y populacji w Afryce Środkowej, Południowej i Południowo-Wschodniej, zastępując poprzednie haplogrupy na tych obszarach dominującymi obecnie liniami E1b1a. Ślady przodków można jednak dziś zaobserwować w tych regionach dzięki obecności haplogrup DNA Y A-M91 i B-M60 , które są powszechne w niektórych populacjach reliktowych, takich jak Pigmeje Mbuti i Khoisan .

Częstotliwości haplogrupy A
Afryka
Badana populacja
Częstotliwość (W %)
Tsumkwe San (Namibia) 66%
Nama (Namibia) 64
Dinka (Sudan) 62
Shilluk (Sudan) 53
Nuba (Sudan) 46
Khoisan 44
Żydzi etiopscy 41
!Kung /Sekele ~40
Borgu (Sudan) 35
Nuer (Sudan) 33
Futro (Sudan) 31
Masajowie (Kenia) 27
Nara (Erytrea) 20
Masalit (Sudan) 19
Amhara (Etiopia) ~16
Etiopczycy 14
Bantu (Kenia) 14
Mandara (Kamerun) 14
Hausa (Sudan) 13
Khwe (Republika Południowej Afryki) 12
Fulbe (Kamerun) 12
Dama (Namibia) 11
Oromo (Etiopia) 10
Kunama (Erytrea) 10
Południowo-semicki (Etiopia) 10
Arabowie (Egipt) 3

W złożonej próbie 3551 afrykańskich mężczyzn haplogrupa A miała częstość 5,4%. Najwyższe częstotliwości haplogrupy A odnotowano wśród Khoisan z Afryki Południowej, Beta Izraela i Nilo-Saharyjczyków .

A-M31

Subklada A-M31 została znaleziona w około 2,8% (8/282) z puli siedmiu próbek różnych grup etnicznych w Gwinei Bissau , zwłaszcza wśród Papel-Manjaco-Mancanha (5/64 = 7,8%). Wcześniejsze badanie, Gonçalves i in. 2003, donieśli o znalezieniu A-M31 w 5,1% (14/276) próbki z Gwinei Bissau iw 0,5% (1/201) pary próbek z Cabo Verde . Autorzy innego badania poinformowali o znalezieniu haplogrupy A-M31 u 5% (2/39) próbki Mandinki z Senegambii i 2% (1/55) próbki Dogonów z Mali . Haplogrupa A-M31 została również znaleziona w 3% (2/64) próby Berberów z Maroka i 2,3% (1/44) próby nieokreślonej przynależności etnicznej z Mali .

Co najmniej siedmiu mężczyzn o przodkach pochodzących z Yorkshire w Anglii i mających charakterystyczne nazwisko Revis zostało zidentyfikowanych jako należących do podklady A-M31. Doniesienia prasowe sugerowały, że mężczyźni byli fenotypowo „europejscy” i nieświadomi żadnego afrykańskiego pochodzenia. Późniejsze badania sugerowały, że mieli wspólnego patrylinearnego przodka w XVIII wieku.

A-M6

A-M6 (dawniej A2) zwykle występuje wśród ludów Khoisan. Autorzy jednego badania zgłosili znalezienie haplogrupy A-M6 (xA-P28) u 28% (8/29) próbki Tsumkwe San i 16% (5/32) próbki! Kung / Sekele oraz haplogrupy A-P28 w 17% (5/29) próbki Tsumkwe San, 9% (3/32) próbki !Kung /Sekele, 9% (1/11) próbki Nama i 6% (1/18) próbki Dama . Autorzy innego badania zgłosili znalezienie haplogrupy A-M6 u 15,4% (6/39) próbki samców Khoisan, w tym 5/39 A-M6 (xA-M114) i 1/39 A-M114.

A-M32

Klad A-M32 (dawniej A3) zawiera najbardziej zaludnione gałęzie haplogrupy A-L1085 i występuje głównie w Afryce Wschodniej i Afryce Południowej .

A-M28

Podklada A-M28 (dawniej A3a) była rzadko obserwowana w Rogu Afryki . U 5% (1/20) mieszanej próby osób posługujących się językami południowo-semickimi z Etiopii, 1,1% (1/88) próby Etiopczyków i 0,5% (1/201) Somalijczyków.

A-M51

Podklada A-M51 (dawniej A3b1) występuje najczęściej wśród ludów Khoisan (6/11 = 55% Nama , 11/39 = 28% Khoisan, 7/32 = 22% ! Kung / Sekele, 6/29 = 21% Tsumkwe San, 1/18 = 6% Damy). Jednak stwierdzono go również z mniejszą częstotliwością wśród ludów Bantu w Afryce Południowej , w tym 2/28 = 7% Sotho-Tswana , 3/53 = 6% mieszkańców Afryki Południowej niebędących Khoisan, 4/80 = 5% Xhosa i 1 /29 = 3% Zulu .

A-M13

Podklada A-M13 (dawniej A3b2), która jest powszechnie spotykana w Afryce Wschodniej i północnym Kamerunie, różni się od tej znalezionej w próbkach Khoisan i jest z nimi tylko zdalnie spokrewniona. To odkrycie sugeruje starożytną rozbieżność.

W Sudanie haplogrupa A-M13 została znaleziona w 28/53 = 52,8% Sudańczyków Południowych , 13/28 = 46,4% Nuba w środkowym Sudanie, 25/90 = 27,8% Sudańczyków Zachodnich , 4/32 = 12,5% miejscowej ludności Hausa i 5/216 = 2,3% mieszkańców Sudanu Północnego.

W Etiopii jedno badanie wykazało znalezienie haplogrupy A-M13 w 14,6% (7/48) próbki Amhary i 10,3% (8/78) próbki Oromo . Inne badanie wykazało znalezienie haplogrupy A-M118 u 6,8% (6/88) i haplogrupy A-M13 (xA-M171, A-M118) u 5,7% (5/88) mieszanej próby Etiopczyków, co stanowi łącznie 12,5% (11/88) A-M13.

Haplogrupa A-M13 była również czasami obserwowana poza Afryką Środkową i Wschodnią, jak w regionie Morza Egejskiego w Turcji (2/30 = 6,7%), jemeńscy Żydzi (1/20 = 5%), Egipt (4/147 = 2,7 %, 3/92 = 3,3%), Palestyńczycy (2/143 = 1,4%), Sardynia (1/77 = 1,3%, 1/22 = 4,5%), stolica Jordanii , Amman (1/101=1 %) i Omanu (1/121 = 0,8%).

Filogenetyka

Historia filogenetyczna

Główny artykuł: Tabela konwersji dla haplogrup chromosomu Y

Przed 2002 rokiem w literaturze akademickiej istniało co najmniej siedem systemów nazewnictwa drzewa filogenetycznego chromosomu Y. Doprowadziło to do sporego zamieszania. W 2002 roku główne grupy badawcze połączyły siły i utworzyły Konsorcjum Y-Chromosom Consortium (YCC). Opublikowali wspólny dokument, który stworzył jedno nowe drzewo, którego wszyscy zgodzili się użyć. Później grupa naukowców-obywateli zainteresowanych genetyką populacyjną i genealogią genetyczną utworzyła grupę roboczą w celu stworzenia amatorskiego drzewa, którego celem jest przede wszystkim aktualność. Poniższa tabela zawiera wszystkie te prace w miejscu charakterystycznego drzewa YCC z 2002 roku. Pozwala to badaczowi przeglądającemu starszą opublikowaną literaturę na szybkie poruszanie się między nomenklaturami.

YCC 2002/2008 (stenografia) (α) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 (odręczny) YCC 2005 (odręczny) YCC 2008 (odręczny) YCC 2010r (odręczny) ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
A-M31 7 I 1A 1 – H1 A A1 A1 A1 A1a A1 A1 A1a A1a A1a A1a A1a
A-M6 27 I 2 3 – H1 A A2* A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A1b1a1a
A-M114 27 I 2 3 – H1 A A2a A2a A2a A2a A2a A2a A2a A2a A2a A2a A1b1a1a1a
A-P28 27 I 2 4 – H1 A A2b A2b A2b A2b A2b A2b A2b A2b A2b A2b A1b1a1a1b
A-M32 * * * * * * * * A3 A3 A3 A3 A3 A3 A3 A3 A3 A1b1b
A-M28 7 I 1A 1 – H1 A A3a A3a A3a A3a A3a A3a A3a A3a A3a A3a A1b1b1
A-M51 7 I 1A 1 – H1 A A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A3b1 A1b1b2a
A-M13 7 I 1A 2 ue1 H1 A A3b2* A3b2 A3b2 A3b2 A3b2 A3b2 A3b2 A3b2 A3b2 A3b2 A1b1b2b
A-M171 7 I 1A 2 ue1 H1 A A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a A3b2a REMOVED
A-M118 7 I 1A 2 ue1 H1 A A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A3b2b A1b1b2b1

Oryginalne publikacje naukowe

Następujące zespoły badawcze zgodnie z ich publikacjami były reprezentowane w tworzeniu Drzewa YCC.

Crucianiego 2011

Zmienione drzewo genealogiczne chromosomu Y autorstwa Cruciani i in. 2011 w porównaniu z drzewem genealogicznym z Karafet et al. 2008. A1b jest obecnie znany jako A0 według ISOGG.

Główna zmiana w rozumieniu drzewa Haplogrupy A pojawiła się wraz z publikacją ( Cruciani 2011 ) . Wstępne sekwencjonowanie ludzkiego chromosomu Y sugerowało, że pierwszy podział w drzewie genealogicznym chromosomu Y nastąpił z mutacją M91, która oddzieliła haplogrupę A od haplogrupy BT . Jednak obecnie wiadomo, że najgłębszy podział w drzewie chromosomu Y występuje między dwiema wcześniej zgłoszonymi podkladami haplogrupy A, a nie między haplogrupą A i haplogrupą BT. Podklady A1b i A1a-T schodzą teraz bezpośrednio z korzenia drzewa. Przegrupowanie drzewa genealogicznego chromosomu Y oznacza, że ​​linie rodowe sklasyfikowane jako haplogrupa A niekoniecznie tworzą klad monofiletyczny . Haplogrupa A odnosi się zatem do zbioru linii, które nie posiadają markerów definiujących haplogrupę BT, chociaż wiele linii w ramach haplogrupy A jest tylko bardzo daleko spokrewnionych.

Mutacje M91 i P97 odróżniają haplogrupę A od haplogrupy BT . W chromosomach haplogrupy A marker M91 składa się z odcinka 8 T jednostek nukleozasadowych. W haplogrupie BT i chromosomach szympansa marker ten składa się z 9 jednostek zasad nukleinowych T. Ten wzorzec sugerował, że odcinek 9T haplogrupy BT był wersją przodków i że haplogrupa A została utworzona przez usunięcie jednej zasady nukleinowej .

Ale według Crucianiego i in. 2011 region otaczający marker M91 jest mutacyjnym hotspotem podatnym na powtarzające się mutacje. Jest zatem możliwe, że odcinek 8T haplogrupy A może być stanem przodków M91, a odcinek 9T haplogrupy BT może być stanem pochodnym, który powstał przez wstawienie 1T. To wyjaśniałoby, dlaczego podklady A1b i A1a-T, najgłębsze gałęzie haplogrupy A, mają odcinek 8T. Ponadto Cruciani i in. 2011 ustalił, że marker P97, który jest również używany do identyfikacji haplogrupy A, posiadał stan przodków w haplogrupie A, ale stan pochodny w haplogrupie BT .

Drzewa filogenetyczne

To drzewo filogenetyczne podkladów haplogrup jest oparte na drzewie Y-Chromosom Consortium (YCC), drzewie haplogrup ISOGG Y-DNA i późniejszych opublikowanych badaniach.

Adam z chromosomem Y

  • A0 (dawniej A1b) (P305, V148, V149, V154, V164, V166, V172, V173, V177, V190, V196, V223, V225, V229, V233, V239)
  • A1 (A1a-T wg Cruciani 2011) (L985, L989, L990, L1002, L1003, L1004, L1009, L1013, L1053, V161, V168, V171, V174, V203, V238, V241, V250, V238, V241, V 250 )
    • A1a (M31, P82, V4, V14, V15, V25, V26, V28, V30, V40, V48, V53, V57, V58, V63, V76, V191, V201, V204, V214, V215, V236)
    • A1b (A2-T według Crucianiego 2011) (P108, V221)
      • A1b1 (L419)
        • A1b1a (V50, V82, V198, V224)
          • A1b1a1 dawniej A2 (M14, M23, L968/M29/P3/PN3, M71, M135, M141, M206, M276/P247, M277/P248, MEH1, P4, P5, P36.1, strona 71, strona 87, strona 95)
            • A1b1a1a (M6, M196)
              • A1b1a1a1 (M212)
                • A1b1a1a1a dawniej A2a (M114)
                • A1b1a1a1b dawniej A2b (P28)
                • A1b1a1a1c dawniej A2c (P262)
        • A1b1b dawniej A3 (M32)
          • A1b1b1 dawniej A3a (M28, M59)
          • A1b1b2 dawniej A3b (M144, M190, M220, P289)
            • A1b1b2a dawniej A3b1 (M51, P100, P291)
              • A1b1b2a1 dawniej A3b1a (P71, P102)
            • A1b1b2b dawniej A3b2 (M13, M127, M202, M219, M305):
              • A1b1b2b1 (M118)
      • BT (M42, M94, M139, M299, M60, M181/strona 32, P85, P90, P97, strona 65.1/SRY1532.1/SRY10831.1, V21, V29, V31, V59, V64, V102, V187, V202, V216, V235)

Zobacz też

Genetyka

Podklady Y-DNA A

  • A-M114
  • A-M118
  • A-M13
  • A-M171
  • A-M28
  • A-M31
  • A-M32
  • A-M51
  • A-M6
  • A-P28

Drzewo szkieletowe Y-DNA

Źródła tabel konwersji

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Haplogroup_A-L1085&oldid=1136415823 ”