kalicheamycyna

Kalicheamycyna γ1
Structural formula of Calicheamicin γ1
Ball-and-stick model of the Calicheamicin γ1 molecule
Identyfikatory
Model 3D ( JSmol )
ChemSpider
Identyfikator klienta PubChem
UNII
  • InChI=1S/C55H74IN3O21S4/c1-12-57-30-24-73-35(22-34(30)68-6)78-48-43(63)40(26(3)75-53(48) 77-33-17-15-13-14-16-19-55(67)23-32(61)41(58-54(66)72-10)38(33)29(55)18-20- 82-84-81-11)59-80-36-21-31(60)50(28(5)74-36)83-51(65)37-25(2)39(56)46(49( 71-9)45(37)69-7)79-52-44(64)47(70-8)42(62)27(4)76-52/h13-14,18,26-28,30- 31,33-36,40,42-44,47-48,50,52-53,57,59-60,62-64,67H,12,20-24H2,1-11H3,(H,58,66 )/b14-13-,29-18+/t26-,27+,28-,30+,31+,33+,34+,35+,36+,40-,42+,43+,44- ,47-,48-,50-,52+,53+,55-/m1/s1  ☒ N
    Klucz: HXCHCVDVKSCDHU-LULTVBGHSA-N  ☒ N
  • InChI=1/C55H74IN3O21S4/c1-12-57-30-24-73-35(22-34(30)68-6)78-48-43(63)40(26(3)75-53(48) 77-33-17-15-13-14-16-19-55(67)23-32(61)41(58-54(66)72-10)38(33)29(55)18-20- 82-84-81-11)59-80-36-21-31(60)50(28(5)74-36)83-51(65)37-25(2)39(56)46(49( 71-9)45(37)69-7)79-52-44(64)47(70-8)42(62)27(4)76-52/h13-14,18,26-28,30- 31,33-36,40,42-44,47-48,50,52-53,57,59-60,62-64,67H,12,20-24H2,1-11H3,(H,58,66 )/b14-13-,29-18+/t26-,27+,28-,30+,31+,33+,34+,35+,36+,40-,42+,43+,44- ,47-,48-,50-,52+,53+,55-/m1/s1
    Klucz: HXCHCVDVKSCDHU- LULTVBGHBW
  • CCN[C@H]1CO[C@H](C[C@H]1OC)O[C@@H]2[C@H]([C@@H]([C@H](O [C@H]2O[C@H]3C#C/C=C\C#C[C@]\4(CC(=O)C(=C3/C4=C\CSSSC)NC(=O) OC)O)C)NO[C@H]5C[C@@H]([C@@H]([C@H](O5)C)SC(=O)c6c(c(c(c( c6OC)OC)O[C@H]7[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O7)C)O)OC)O)I) GRUCHAĆ
Nieruchomości
C 55 H 74 I N 3 O 21 S 4
Masa cząsteczkowa - 1368,34 g ·mol 1
Zagrożenia
Oznakowanie GHS :
GHS07: Exclamation markGHS08: Health hazard
Niebezpieczeństwo
H302 , H341 , H361 , H372
P201 , P202 , P260 , P264 , P270 , P281 , P301+P312 , P308+P313 , P314 , P330 , P405 , P501
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).
☒  N ( co to jest check☒ T N ?)

Kalicheamycyny są klasą enediynowych antybiotyków przeciwnowotworowych pochodzących z bakterii Micromonospora echinospora , przy czym najbardziej godną uwagi jest kalicheamycyna γ1 . Pierwotnie został wyizolowany w połowie lat 80. XX wieku z kredowej gleby lub „ dołów caliche ”, znajdujących się w Kerrville w Teksasie . Próbka została pobrana przez naukowca pracującego dla Lederle Labs . Jest niezwykle toksyczny dla wszystkich komórek, aw 2000 roku opracowano i wprowadzono na rynek immunokoniugat N-acetylodimetylohydrazydu kalicheamycyny ukierunkowany na antygen CD33 i wprowadzony na rynek jako ukierunkowana terapia przeciwko ostrej białaczce szpikowej (AML) raka nielitycznego . Drugie przeciwciało monoklonalne związane z kalicheamycyną, inotuzumab ozogamycyny (sprzedawany jako Besponsa ), koniugat przeciwciało-lek skierowany przeciwko CD22, zostało zatwierdzone przez Amerykańską Agencję ds. Żywności i Leków w dniu 17 sierpnia 2017 r. lub opornej na leczenie ostrej białaczki limfoblastycznej prekursorowej limfocytów B. Kalicheamycyna γ1 i pokrewna esperamycyna enediyny to dwa najsilniejsze znane środki przeciwnowotworowe.

Mechanizm toksyczności

Kalicheamycyny celują w DNA i powodują rozcięcie nici. Kalicheamycyny wiążą się z DNA w mniejszym rowku , w którym następnie przechodzą reakcję analogiczną do cyklizacji Bergmana , aby wytworzyć dwurodnikowy gatunek. Ten dwurodnik, 1,4-didehydrobenzen , następnie usuwa atomy wodoru z dezoksyrybozy (cukru) szkieletu DNA, co ostatecznie prowadzi do rozcięcia nici. Specyficzność wiązania kalicheamycyny z mniejszym rowkiem DNA wykazali Crothers i in. (1999) wynika z grupy arylotetrasacharydowej cząsteczki.

Biosynteza

Iteracyjny PKS
Schemat szlaku glikozylacji kalicheamycyny

Podstawowy szlak metaboliczny biosyntezy tej cząsteczki przypomina szlak innych scharakteryzowanych związków enediynowych i zachodzi poprzez iteracyjny szlak syntazy poliketydowej (PKS). Ten typ I PKS ładuje acetylo-CoA, a następnie wielokrotnie dodaje w sumie siedem malonylo-CoA. Na rosnący poliketyd działa domena ketoreduktazy (KR) i domena dehydratazy (DH) podczas każdej iteracji w celu wytworzenia 15-węglowego polienu, który jest następnie przetwarzany przez enzymy pomocnicze w celu uzyskania przypuszczalnego rdzenia enediynowego kalicheamycyny. Przewiduje się, że dojrzewanie rdzenia poliketydowego nastąpi w wyniku działania dodatkowych enzymów w celu dostarczenia półproduktu podobnego do kalicheamycynonu jako substratu do późniejszej glikozylacji.

Glikozylacja kalicheamycynonu wymaga 4 glikozylotransferaz (CalG1-4) i jednej acylotransferazy (CalO4), z których każda rozpoznaje specyficzny nukleotyd cukrowy lub substrat kwasu orselinowego . Przełomowe badania biochemiczne CalG1-G4 przeprowadzone przez Thorsona i współpracowników wykazały, że reakcje katalizowane przez te glikozylotransferazy są wysoce odwracalne. Była to zmiana paradygmatu w kontekście katalizy glikozylotransferazy, a Thorson i współpracownicy wykazali, że jest to ogólne zjawisko, które można wykorzystać do syntezy nukleotydów cukrowych i „ glikorandomizacji ”. Ta sama grupa zgłosiła również struktury wszystkich czterech glikozylotransferaz, ujawniając konserwatywny motyw wiążący kalicheamycynę, który koordynuje dokładne interakcje szkieletu enediyny z resztami aromatycznymi. Wykazano, że miejsce katalityczne CalG1, CalG3 i CalG4 posiada wysoce konserwatywną katalityczną diadę histydyny i asparaginianu , która promuje atak nukleofilowy na akceptorową grupę hydroksylową półproduktów kalicheamycyny. Warto zauważyć, że motyw ten jest nieobecny w CalG2, co sugeruje inny mechanizm katalityczny tego enzymu.

Opór

Kalicheamycyna wykazuje bezstronną toksyczność wobec bakterii , grzybów , wirusów oraz komórek i organizmów eukariotycznych , co rodzi pytania, w jaki sposób Micromonospora wytwarzająca kalicheamycynę nie zatruwa się. Odpowiedź na to pytanie została przedstawiona w 2003 roku, kiedy Thorson i współpracownicy zaprezentowali pierwszy znany przykład mechanizmu oporności „poświęcenia”, kodowanego przez gen calC z biosyntetycznego klastra genów kalicheamycyny. W tym badaniu naukowcy odkryli, że kalicheamycyna rozszczepia białko CalC specyficznie dla miejsca, niszcząc zarówno kalicheamycynę, jak i białko CalC, zapobiegając w ten sposób uszkodzeniu DNA. Ta sama grupa rozwiązała strukturę CalC, a ostatnio, we współpracy z naukowcami z Centrum Badań i Innowacji Farmaceutycznych (CPRI), odkryła homologi strukturalne lub funkcjonalne kodowane przez geny w klastrze genów kalicheamycyny, wcześniej wymienionym jako kodujący nieznany funkcjonować. W tym ostatnim badaniu autorzy sugerują, że homologi CalC mogą służyć w zdolności biosyntetycznej jako długo poszukiwane cyklazy poliketydowe wymagane do fałdowania lub cyklizacji wczesnych związków pośrednich w drodze do kalicheamycyny.

Historia

Zaproponowano, że Aleksander Wielki został otruty przez wypicie wody z rzeki Mavroneri (utożsamianej z mitologiczną rzeką Styks ), która, jak się uważa, została skażona tym związkiem. Jednak toksykolodzy uważają, że do jakiegokolwiek zastosowania tej trucizny w starożytności potrzebna była rozległa wiedza z zakresu chemii biologicznej.

Zobacz też