alametycyna

alametycyna

Nazwy
nazwa IUPAC N -acetylo-2-metyloalanylo- L -prolilo-2-metyloalanylo- L -alanylo-2-metyloalanylo - L -alanylo- L -glutaminylo-2-metyloalanylo -L -walilo-2-metyloalanyloglicylo- L- leucylo-2- metyloalanylo- L -prolilo - L -walilo-2-metyloalanylo-2-metyloalanylo- L -α-glutamylo - N1 -[(1S ) -1-benzylo-2-hydroksyetylo]-L - glutamamid
Identyfikatory
Numer CAS	27061-78-5   Y
Model 3D ( JSmol )	Interaktywny obraz Interaktywny obraz
CHEMBL	ChEMBL438243   Y
ChemSpider	17288702   Y
Karta informacyjna ECHA	100.121.626
Identyfikator klienta PubChem	16132042
UNII	0LT1I1B7S8   Y
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )	DTXSID40893675
InChI InChI=1S/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1   Y Klucz: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNSA-N   Y InChI=1/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1 Klucz: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNBC
UŚMIECH CC(C)C[C@@H](C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C( C)C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C( =O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)CO)NC(=O)CNC(=O )C(C)(C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](CCC( =O)N)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C( C)(C)NC(=O)[C@@H]3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C CC(C)CC(C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(C(C)C)C(=O)NC(C)(C)C( =O)NC(C)(C)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)NC(CCC(=O)N)C(=O)NC(Cc2ccccc2)CO)NC (=O)CNC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(CCC( =O)N)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(= O)C3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
Nieruchomości
Wzór chemiczny	C 92 H 150 N 22 O 25
Masa cząsteczkowa	1964,31 g/mol
Wygląd	Biaława substancja stała
Temperatura topnienia	255 do 270 ° C (491 do 518 ° F; 528 do 543 K)
Rozpuszczalność w wodzie	Nierozpuszczalny
Rozpuszczalność w DMSO , metanolu , etanolu	Rozpuszczalny
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).   N ( co to jest T N ?) Referencje w infoboksie

Alametycyna jest antybiotykiem peptydowym tworzącym kanały , wytwarzanym przez grzyby Trichoderma viride . Należy do peptaibolu , które zawierają niebiałkopochodną resztę aminokwasową Aib ( kwas 2-aminoizomasłowy ). Ta reszta silnie indukuje tworzenie alfa-helikalnej . Sekwencja peptydowa to:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = acetyl, Phl = fenyloalaninol, Aib = kwas 2-aminoizomasłowy )

W błonach komórkowych tworzy zależne od napięcia kanały jonowe poprzez agregację od czterech do sześciu cząsteczek .

Biosynteza

Przypuszcza się, że biosynteza alametycyny jest katalizowana przez syntazę alametycyny, nierybosomalną syntazę peptydową (NRPS), wyizolowaną po raz pierwszy w 1975 r. Chociaż istnieje kilka akceptowanych sekwencji peptydu alametycyny, dowody sugerują, że wszystkie one są zgodne z ogólnym mechanizmem NRPS z niewielkimi zmianami w wybranych aminokwasach . Rozpoczynając od acylowania N-końca pierwszego kwasu aminoizomasłowego enzymu syntazy ALM przez acetylo-CoA , następuje sekwencyjna kondensacja aminokwasów przez każdą modułową jednostkę syntetazy. Aminokwasy są początkowo adenylowane przez domenę „ adenylacji ” (A), zanim zostaną przyłączone wiązaniem tioestrowym do peptydylowego białka nośnikowego podobnego do acylonośnego białka. Rosnący łańcuch jest przyłączony do PCP zawierającego aminokwas przez domenę „kondensacji” (C), po której następuje kolejna runda tych samych reakcji w następnym module.

Ogólny mechanizm syntezy NRPS w alametycynie, przedstawiający kondensację substratów aminokwasowych z modułu do modułu. Ac=Acetyl Aib=kwas aminoizomasłowy. Składniki modułu: A= adenylacja PCP= peptydylowe białko nośnikowe C=kondensacja

Montaż jest zakończony przez dodanie fenyloalaninolu, niezwykłego substratu podobnego do aminokwasu. Po dodaniu fenyloalaninolu ukończony łańcuch peptydowy jest rozszczepiany przez domenę tioesterazy, rozszczepiając wiązanie tioestrowe i pozostawiając alkohol.

Schemat poszczególnych modułów i elongacja biosyntezy alametycyny. Rosnący łańcuch peptydowy jest pokazany dla każdego modułu, kończący się rozszczepieniem tioestru i wytworzeniem liniowej alametycyny. Ac=Acetyl Aib=Kwas aminoizomasłowy Feol=Fenyloalaninol. Składniki modułu: A=Adenylacja PCP= Peptydylowe białko nośnikowe C=Kondensacja

Dalsza lektura

•   Jones, LR; Maddock, SW; Besch, HR Jr (1980). „Demaskujący wpływ alametycyny na (Na +, K +) -ATPazę, cyklazę adenylanową sprzężoną z receptorem beta-adrenergicznym i aktywność kinazy białkowej zależnej od cAMP w pęcherzykach sercowych” . J. Biol. chemia . 255 (20): 9971–9980. doi : 10.1016/S0021-9258(18)43488-6 . PMID 6253461 .
• Zbadaj struktury alametycyny w banku danych białek
• Alametycyna w Norine
  • Z „Modelu kanału jonowego bramkowanego napięciem wywnioskowanego ze struktury krystalicznej alametycyny przy rozdzielczości 1,5 A”.    Fox Junior, RO; Richards, FM (1982). „Model kanału jonowego bramkowanego napięciem wywnioskowano ze struktury krystalicznej alametycyny przy rozdzielczości 1,5 A”. Natura . 300 (5890): 325–30. Bibcode : 1982Natur.300..325F . doi : 10.1038/300325a0 . PMID 6292726 . S2CID 4278453 .
•     Leitgeb, Balázs; Szekeres, András; Manczinger, László; Vágvölgyi, Csaba; Kredics, László (2007-06-01). „Historia alametycyny: przegląd najszerzej zbadanego peptydobolu”. Chemia i różnorodność biologiczna . 4 (6): 1027–1051. doi : 10.1002/cbdv.200790095 . ISSN 1612-1880 . PMID 17589875 . S2CID 40886688 .