DNAJC5

DNAJC5
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, CLN4, CLN4B, CSP, DNAJC5A, NCL, mir-941-2, mir-941-3, mir-941-4, mir-941-5, członek rodziny białek szoku termicznego DnaJ (Hsp40) C5 Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	nie dotyczy
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Homolog DnaJ członek podrodziny C 5 , znany również jako białko łańcuchowe cysteiny lub CSP , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen DNAJC5 . Po raz pierwszy został opisany w 1990 roku.

Gen

U ludzi gen znajduje się na długim ramieniu chromosomu 20 (20q13.33) na Watsonie (nić dodatnia). Gen ma długość 40 867 zasad, a zakodowane białko ma 198 aminokwasów o przewidywanej masie cząsteczkowej 22,149 kilodaltonów ( kDa). Masa dojrzałego białka wynosi 34 kDa.

Ten gen jest wysoce konserwatywny i występuje zarówno u bezkręgowców , jak i kręgowców . U ludzi pseudogen tego genu znajduje się na krótkim ramieniu chromosomu 8 .

Struktura

Organizacja białka jest następująca:

miejsce fosforylacji na końcu N dla kinazy białkowej A
domena J (~70 aminokwasów)
region linkera
motyw cysteinowy składający się z 13–15 cystein w ciągu 25 aminokwasów. Jest silnie palmitoilowany w motywie cysteiny.
mniej konserwowana domena C-końcowa

Dystrybucja tkanek

Białko to występuje obficie w tkance nerwowej i wykazuje charakterystyczną lokalizację w pęcherzykach synaptycznych i pokrytych klatryną . Znajduje się również na pęcherzykach wydzielniczych w komórkach wydzielania wewnętrznego, neuroendokrynnego i zewnątrzwydzielniczego. Białko to stanowi ~ 1% zawartości białka w pęcherzykach synaptycznych . Wydaje się, że DNAJC5 odgrywa rolę w stymulowanej egzocytozie .

Funkcjonować

Kodowane białko należy do rodziny białek J. Białka te działają w wielu procesach komórkowych poprzez regulację ATPazy białek szoku cieplnego o masie cząsteczkowej 70 kDa ( Hsp70 ). DNAJC5 jest czynnikiem wymiany nukleotydów guaniny dla _białek Gα . CSPα odgrywa rolę w transporcie błonowym i fałdowaniu białek i wykazano, że ma właściwości przeciwzwyrodnieniowe układu nerwowego . Wiadomo, że odgrywa rolę w mukowiscydozie i chorobie Huntingtona .

Białko to zostało zaproponowane jako kluczowy element synaptycznej maszynerii molekularnej przeznaczonej do ratowania białek synaptycznych, które zostały rozwinięte przez stres zależny od aktywności. Syntaksyna 1A , błona plazmatyczna SNARE ( receptor białka przyłączającego rozpuszczalny czynnik wrażliwy na N-etylomaleimid), kluczowa dla neuroprzekaźnictwa, tworzy kompleks z CSPα, białkiem G i kanałem wapniowym typu N. Huntingtyna może być zdolna do wyparcia zarówno syntaksyny 1A, jak i CSPα z kanałów typu N. CSP oddziałuje z białkiem czujnikowym wapnia synaptotagminą 9 poprzez swoją domenę łącznikową.

Białko oddziałujące z huntingtyną 14 , transferaza palmitoilowa, jest wymagane do egzocytozy i kierowania CSP do pęcherzyków synaptycznych. Reszty palmitoilowe są przenoszone na reszty cysteiny. Jeśli te pozostałości są zmutowane, celowanie w błonę jest zmniejszone lub utracone. CSP szczura tworzy kompleks z Sgt ( SGTA ) i Hsc70 ( HSPA8 ) zlokalizowanymi na powierzchni pęcherzyka synaptycznego . Kompleks ten działa jako białko opiekuńcze zależne od ATP, które reaktywuje zdenaturowane substraty. Ponadto wydaje się, że kompleks Csp/Sgt/Hsc70 jest ważny dla utrzymania prawidłowych synaps .

Jego ekspresję można zwiększyć stosując lit. Kwercetyna sprzyja tworzeniu stabilnych dimerów CSPα-CSPα.

Białko cysteiny zwiększa wrażliwość na wapń egzocytozy neuroprzekaźników.

Interakcje

Wykazano, że DNAJC5 oddziałuje z transbłonowym regulatorem przewodnictwa mukowiscydozy .

Znaczenie kliniczne

Mutacje w tym genie mogą powodować neuronalną lipofuscynozę ceroidową .

Dalsza lektura

Chamberlain LH, Burgoyne RD (2000). „Białko łańcuchowe cysteiny: opiekun w synapsie” . J. Neurochem . 74 (5): 1781–1789. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0741781.x . PMID 10800920 . S2CID 7667658 .
Mastrogiacomo A, Parsons SM, Zampighi GA, Jenden DJ, Umbach JA, Gundersen CB (1994). „Białka łańcuchowe cysteiny: potencjalny związek między pęcherzykami synaptycznymi a presynaptycznymi kanałami Ca2 +”. nauka . 263 (5149): 981–82. doi : 10.1126/science.7906056 . PMID 7906056 .
Gundersen CB, Mastrogiacomo A, Faull K, Umbach JA (1994). „Rozległe lipidowanie łańcucha cysteiny Torpedo” . Dziennik Chemii Biologicznej . 269 (30): 19197–19199. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32151-8 . PMID 8034679 .
Mastrogiacomo A, Gundersen CB (1995). „Nukleotyd i wydedukowana sekwencja aminokwasowa białka łańcuchowego cysteiny szczura”. Molekularne badania mózgu . 28 (1): 12–18. doi : 10.1016/0169-328x(94)00172-b . PMID 7535880 .
Coppola T, Gundersen C (1996). „Powszechna ekspresja ludzkich białek łańcuchowych cysteiny” . FEBS Lett . 391 (3): 269–72. doi : 10.1016/0014-5793(96)00750-8 . PMID 8764987 . S2CID 10410573 .
Zhang H, Kelley WL, Chamberlain LH i in. (1999). „Analiza mutacji funkcji białka łańcucha cysteiny w egzocytozie insuliny” . J. Cell Sci . 112 (9): 1345–51. doi : 10.1242/jcs.112.9.1345 . PMID 10194413 .
Hattori A, Okumura K, Nagase T i in. (2001). „Charakterystyka długich klonów cDNA ze śledziony dorosłego człowieka” . DNA Res . 7 (6): 357–66. doi : 10.1093/dnares/7.6.357 . PMID 11214971 .
Evans GJ, Wilkinson MC, Graham ME i in. (2002). „Fosforylacja białka łańcuchowego cysteiny przez kinazę białkową A. Implikacje dla modulacji egzocytozy” . J. Biol. chemia . 276 (51): 47877–85. doi : 10.1074/jbc.M108186200 . PMID 11604405 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J i in. (2002). „Sekwencja DNA i analiza porównawcza ludzkiego chromosomu 20” . Natura . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Miller LC, Swayne LA, Chen L i in. (2004). „Hamowanie kanałów wapniowych typu N przez białko łańcuchowe cysteiny (CSP) jest blokowane przez zmutowaną huntingtynę” . J. Biol. chemia . 278 (52): 53072–81. doi : 10.1074/jbc.M306230200 . PMID 14570907 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T i in. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21 243 pełnej długości ludzkich cDNA” . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Giorgianni F, Beranova-Giorgianni S, Desiderio DM (2004). „Identyfikacja i charakterystyka białek ufosforylowanych w ludzkiej przysadce mózgowej”. Proteomika . 4 (3): 587–98. doi : 10.1002/pmic.200300584 . PMID 14997482 . S2CID 25355914 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Boal F, Zhang H, Tessier C i in. (2005). „Zmienny koniec C białek łańcuchowych cysteiny moduluje egzocytozę i interakcje białko-białko”. Biochemia . 43 (51): 16212–23. doi : 10.1021/bi048612+ . PMID 15610015 .
Natochin M, Campbell TN, Barren B i in. (2005). „Charakterystyka łańcucha cysteinowego regulatora G alfa (s)” . J. Biol. chemia . 280 (34): 30236–41. doi : 10.1074/jbc.M500722200 . PMID 15972823 .
Zhang H, Schmidt BZ, Sun F i in. (2006). „Białko łańcuchowe cysteiny monitoruje późne etapy biogenezy regulatora przewodnictwa przezbłonowego mukowiscydozy” . J. Biol. chemia . 281 (16): 11312–21. doi : 10.1074/jbc.M512013200 . PMID 16469739 .
Chi A, Valencia JC, Hu ZZ i in. (2007). „Proteomiczna i bioinformatyczna charakterystyka biogenezy i funkcji melanosomów”. J. Proteome Res . 5 (11): 3135–44. doi : 10.1021/pr060363j . PMID 17081065 .

Linki zewnętrzne

Wpis GeneReviews/NCBI/NIH/UW dotyczący Neuronal Ceroid-Lipofuscinosis