TRIO (gen)

TRIO
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, ARHGEF23, tgat, trio Rho guaninowy czynnik wymiany nukleotydów, MEBAS, MRD44, MRD63, gen TRIO
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko o potrójnej domenie funkcjonalnej jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen TRIO .

Interakcje

Wykazano, że TRIO (gen) oddziałuje z filaminą i RHOA .

Dalsza lektura

•   Taviaux S, Diriong S, Bellanger JM, Streuli M, Debant A (1997). „Przypisanie TRIO, genu Trio (interakcja z PTPRF) do ludzkich pasm chromosomów 5p 15.1 -> p 14 przez hybrydyzację in situ” . Cytogenetyka i genetyka komórki . 76 (1–2): 107–8. doi : 10.1159/000134524 . PMID 9154137 .
•    Liu X, Wang H, Eberstadt M, Schnuchel A, Olejniczak ET, Meadows RP, Schkeryantz JM, Janowick DA, Harlan JE, Harris EA, Staunton DE, Fesik SW (październik 1998). „Struktura NMR i mutageneza N-końcowej domeny homologii Dbl czynnika wymiany nukleotydów Trio” . komórka . 95 (2): 269–77. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81757-2 . PMID 9790533 . S2CID 18146575 .
•   Seipel K, Medley QG, ​​Kedersha NL, Zhang XA, O'Brien SP, Serra-Pages C, Hemler ME, Streuli M (czerwiec 1999). „Ekspresja domeny czynnika wymiany nukleotydów guaninowych na końcu grupy aminowej promuje reorganizację cytoszkieletu aktyny, migrację komórek i wzrost komórek niezależny od zakotwiczenia”. Journal of Cell Science . 112 (Pt 12) (12): 1825–34. doi : 10.1242/jcs.112.12.1825 . PMID 10341202 .
•   Medley QG, ​​Serra-Pagès C, Iannotti E, Seipel K, Tang M, O'Brien SP, Streuli M (listopad 2000). „Czynnik wymiany nukleotydów trio guaniny jest celem RhoA. Wiązanie RhoA z domeną podobną do trio immunoglobuliny” . Journal of Biological Chemistry . 275 (46): 36116–23. doi : 10.1074/jbc.M003775200 . PMID 10948190 .
•    Bellanger JM, Astier C, Sardet C, Ohta Y, Stossel TP, Debant A (grudzień 2000). „Domena GEF specyficzna dla Rac1 i RhoG Trio celuje w filaminę w celu przebudowy aktyny cytoszkieletu”. Biologia komórki przyrody . 2 (12): 888–92. doi : 10.1038/35046533 . PMID 11146652 . S2CID 10182923 .
•   Gao Y, Xing J, Streuli M, Leto TL, Zheng Y (grudzień 2001). „Trp (56) rac1 określa interakcję z podzbiorem czynników wymiany nukleotydów guaninowych” . Journal of Biological Chemistry . 276 (50): 47530–41. doi : 10.1074/jbc.M108865200 . PMID 11595749 .
•   Skowronek KR, Guo F, Zheng Y, Nassar N (wrzesień 2004). „C-końcowy zasadowy ogon RhoG wspomaga trio czynnika wymiany nukleotydów guaninowych w wiązaniu z fosfolipidami” . Journal of Biological Chemistry . 279 (36): 37895–907. doi : 10.1074/jbc.M312677200 . PMID 15199069 .
•    Zheng M, Simon R, Mirlacher M, Maurer R, Gasser T, Forster T, Diener PA, Mihatsch MJ, Sauter G, Schraml P (lipiec 2004). „Amplifikacja TRIO i obfita ekspresja mRNA jest związana z inwazyjnym wzrostem guza i szybką proliferacją komórek nowotworowych w raku pęcherza moczowego” . Amerykański Dziennik Patologii . 165 (1): 63-9. doi : 10.1016/S0002-9440(10)63275-0 . PMC 1618551 . PMID 15215162 .
•   Yoshizuka N, Moriuchi R, Mori T, Yamada K, Hasegawa S, Maeda T, Shimada T, Yamada Y, Kamihira S, Tomonaga M, Katamine S (październik 2004). „Alternatywny transkrypt pochodzący z trio locus koduje czynnik wymiany nukleotydów guanozyny z potencjałem transformacji komórek mysich” . Journal of Biological Chemistry . 279 (42): 43998–4004. doi : 10.1074/jbc.M406082200 . PMID 15308664 .
•    Portales-Casamar E, Briançon-Marjollet A, Fromont S, Triboulet R, Debant A (marzec 2006). „Identyfikacja nowych izoform neuronalnych Rho-GEF Trio”. Biologia komórki . 98 (3): 183–93. doi : 10.1042/BC20050009 . PMID 16033331 . S2CID 24166861 .
•    Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R, Eng JK, Li XJ, Bodenmiller B, Watts JD, Hood L, Aebersold R (sierpień 2005). „Ilościowa analiza fosfoproteomu przy użyciu chemii koniugacji dendrymerów i tandemowej spektrometrii mas”. Metody natury . 2 (8): 591–8. doi : 10.1038/nmeth776 . PMID 16094384 . S2CID 20475874 .
•    Adamowicz M, Radlwimmer B, Rieker RJ, Mertens D, Schwarzbach M, Schraml P, Benner A, Lichter P, Mechtersheimer G, Joos S (wrzesień 2006). „Częste amplifikacje i obfita ekspresja TRIO, NKD2 i IRX2 w mięsakach tkanek miękkich”. Geny, chromosomy i rak . 45 (9): 829–38. doi : 10.1002/gcc.20343 . PMID 16752383 . S2CID 24491021 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
•    Chhatriwala MK, Betts L, Worthylake DK, Sondek J (maj 2007). „Domeny DH i PH Trio koordynują angażowanie GTPaz Rho w celu ich wydajnej aktywacji” . Dziennik biologii molekularnej . 368 (5): 1307-20. doi : 10.1016/j.jmb.2007.02.060 . PMC 1890047 . PMID 17391702 .
•    Rojas RJ, Yohe ME, Gershburg S, Kawano T, Kozasa T, Sondek J (październik 2007). „Galphaq bezpośrednio aktywuje p63RhoGEF i Trio poprzez konserwatywne rozszerzenie domeny homologii plekstryny związanej z homologią Dbl” . Journal of Biological Chemistry . 282 (40): 29201–10. doi : 10.1074/jbc.M703458200 . PMC 2655113 . PMID 17606614 .

Linki zewnętrzne

• Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : O75962 (białko z potrójną domeną funkcjonalną) w PDBe-KB .