FLNA

FLNA
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologiczne:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, filamina A, FGS2 Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ; ; ;
Ontologia genów
Funkcje molekularne
Składnik komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Filamina A, alfa ( FLNA ) jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen FLNA .

Funkcjonować

Białko wiążące aktynę lub filamina jest białkiem o masie 280 kD, które sieciuje włókna aktyny w ortogonalne sieci w cytoplazmie kory mózgowej i uczestniczy w kotwiczeniu białek błonowych cytoszkieletu aktynowego . Przebudowa cytoszkieletu ma kluczowe znaczenie dla modulacji kształtu i migracji komórek. Filamina A, kodowana przez gen FLNA, jest szeroko eksprymowaną filaminą, która reguluje reorganizację cytoszkieletu aktynowego poprzez interakcję z integrynami , kompleksami receptorów transbłonowych i przekaźnikami wtórnymi . Odkryto co najmniej 31 mutacji powodujących choroby w tym genie.

Struktura

Struktura białka obejmuje domenę N-końcową wiążącą aktynę , 24 powtórzenia wewnętrzne i 2 regiony zawiasowe.

Interakcje

Wykazano, że filamina wchodzi w interakcje z:

BRCA2 ,
CD29
CASR ,
FBLIM1 ,
FILIP1 ,
FLNB ,
NPHP1 ,
RALA ,
SH2B3 ,
TRIO i
VHL .

edycja RNA

Edytowana reszta została wcześniej zarejestrowana jako polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) w dbSNP .

Typ

Edycja RNA A do I jest katalizowana przez rodzinę deaminaz adenozynowych działających na RNA (ADAR), które specyficznie rozpoznają adenozyny w dwuniciowych regionach pre-mRNA i deaminują je do inozyny. Inozyny są rozpoznawane jako guanozyna przez maszynerię translacyjną komórki. Istnieje trzech członków rodziny ADAR ADAR 1-3, przy czym ADAR 1 i ADAR 2 są jedynymi członkami aktywnymi enzymatycznie. Uważa się, że ADAR3 pełni rolę regulacyjną w mózgu. ADAR1 i ADAR 2 są szeroko wyrażane w tkankach, podczas gdy ADAR 3 jest ograniczony do mózgu. Dwuniciowe regiony RNA są tworzone przez parowanie zasad między resztami w regionie komplementarnym do regionu miejsca edycji. Ten komplementarny region zwykle znajduje się w sąsiednim intronie , ale może również znajdować się w sekwencji egzonowej. Region, który tworzy pary zasad z regionem edycyjnym, jest znany jako edytująca sekwencja komplementarna (ECS).

Strona

Jedno miejsce edycyjne pre-mRNA FLNA znajduje się w obrębie aminokwasu 2341 końcowego białka. Kodon glutaminy (Q) jest zmieniony z powodu specyficznej dla miejsca deaminacji adenozyny w miejscu edycji do kodonu argininy (R). Przewiduje się, że region edycyjny utworzy dwuniciowy region o długości 32 par zasad z komplementarną sekwencją około 200 nukleotydów poniżej miejsca edycyjnego. Ten ECS znajduje się w sekwencji intronowej. Edycja w miejscu Q/R prawdopodobnie będzie dotyczyć zarówno ADAR1, jak i ADAR2. Myszy Tłumienie ADAR2 pokazuje spadek edycji w miejscu Q/R. Podwójne nokautowanie ADAR1 nie ma wpływu na edycję.

Struktura

Edytowana adenozyna znajduje się w immunogloulinie 22 ^{[ sprawdź pisownię ]} podobnie jak powtórzenie białka. Region ten jest integrynę β i domeną wiążącą RAC1 . Zmiana aminokwasu prawdopodobnie wpłynie na potencjał elektrostatyczny domen wiążących. Miejsce edycji FLNA to 2 nukleotydy od miejsca składania, takiego jak miejsce R/G GluR-2. Oba transkrypty mają 7/8 identycznych nukleotydów wokół ich miejsc edycji. Ponieważ powszechnie uważa się, że edycja w miejscu GLUR-2 Q/R wpływa na splicing, podobieństwo sekwencji i miejsca edycji może oznaczać, że edycja w miejscu FLNA może również regulować splicing. Eksperymenty in vitro z gluR-2 wykazały, że obecność ADAR2 powoduje zahamowanie splicingu. Analiza danych EST dla FLNA pokazuje, że istnieje związek między edycją ostatniego kodonu egzonu a zachowaniem kolejnego intronu.

Funkcjonować

Zmiana potencjału elektrostatycznego prawdopodobnie wpłynie na wiązanie FLNA z wieloma białkami, z którymi oddziałuje.

naprawa DNA

Interakcja FLNA z białkiem BRCA1 jest niezbędna do skutecznej regulacji wczesnych etapów procesów naprawy DNA . FLNA bierze udział w kontroli procesu naprawy DNA rekombinacji homologicznej i łączenia niehomologicznych końców .

Dalsza lektura

Light S, Sagit R, Itychanda SS, Qin J, Elofsson A (wrzesień 2012). „Ewolucja filaminy - perspektywa powtórzeń domeny białkowej” . Dziennik Biologii Strukturalnej . 179 (3): 289–98. doi : 10.1016/j.jsb.2012.02.010 . PMC 3728663 . PMID 22414427 .
Stossel TP, Condeelis J, Cooley L, Hartwig JH, Noegel A, Schleicher M, Shapiro SS (2001). „Filaminy jako integratory mechaniki komórkowej i sygnalizacji”. Nat. Wielebny Mol. Biol komórkowy . 2 (2): 138–45. doi : 10.1038/35052082 . PMID 11252955 . S2CID 5203942 .
van der Flier A, Sonnenberg A (2001). „Strukturalne i funkcjonalne aspekty filamin” . Biochim. Biofiza. Akta . 1538 (2–3): 99–117. doi : 10.1016/S0167-4889(01)00072-6 . PMID 11336782 .

Linki zewnętrzne