PSME1

PSME1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, IFI5111, PA28A, PA28alpha, REGalpha, HEL-S-129m, podjednostka aktywatora proteasomu 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Podjednostka 1 kompleksu aktywatora proteasomu jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen PSME1 .

Funkcjonować

Proteasom 26S jest multikatalitycznym kompleksem proteinazy o wysoce uporządkowanej strukturze złożonej z 2 kompleksów, rdzenia 20S i regulatora 19S. Rdzeń 20S składa się z 4 pierścieni składających się z 28 nieidentycznych podjednostek; 2 pierścienie składają się z 7 podjednostek alfa, a 2 pierścienie składają się z 7 podjednostek beta. Regulator 19S składa się z podstawy, która zawiera 6 podjednostek ATPazy i 2 podjednostki inne niż ATPaza oraz pokrywy, która zawiera do 10 podjednostek innych niż ATPaza. Proteasomy są rozmieszczone w komórkach eukariotycznych w wysokim stężeniu i rozszczepiają peptydy w procesie zależnym od ATP/ubikwityny na szlaku nielizosomalnym. Istotną funkcją zmodyfikowanego proteasomu, immunoproteasomu, jest przetwarzanie peptydów MHC klasy I. Immunoproteasom zawiera alternatywny regulator, określany jako regulator 11S lub PA28, który zastępuje regulator 19S. Zidentyfikowano trzy podjednostki (alfa, beta i gamma) regulatora 11S. Gen ten koduje podjednostkę alfa regulatora 11S, jedną z dwóch podjednostek 11S, która jest indukowana przez interferon gamma. Trzy podjednostki alfa i trzy beta łączą się, tworząc pierścień heteroheksameryczny. Zidentyfikowano dwa transkrypty kodujące różne izoformy.

Interakcje

Wykazano, że PSME1 wchodzi w interakcje z:

• Emeryna i
• PSME2 .

Dalsza lektura

•   Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). „Struktura i funkcje proteasomów 20S i 26S”. rok Wielebny Biochem . 65 : 801–47. doi : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 .
•   Sijts A, Sun Y, Janek K, Kral S, Paschen A, Schadendorf D, Kloetzel PM (2002). „Rola aktywatora proteasomu PA28 w przetwarzaniu antygenu MHC klasy I”. Mol. immunol . 39 (3–4): 165–9. doi : 10.1016/S0161-5890(02)00099-8 . PMID 12200048 .
•   Goff SP (2003). „Śmierć przez deaminację: nowy system restrykcji gospodarza dla HIV-1” . komórka . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00602-0 . PMID 12914693 .
•    Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, Gesser B, Celis JE, Vandekerckhove J (1993). „Mikrosekwencje 145 białek zarejestrowanych w dwuwymiarowej bazie danych białek żelowych normalnych ludzkich keratynocytów naskórka”. Elektroforeza . 13 (12): 960–9. doi : 10.1002/elps.11501301199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
•   Ahn JY, Tanahashi N, Akiyama K, Hisamatsu H, Noda C, Tanaka K, Chung CH, Shibmara N, Willy PJ, Mott JD (1995). „Pierwotne struktury dwóch homologicznych podjednostek PA28, aktywatora białka indukowanego interferonem gamma proteasomu 20S” . FEBS Lett . 366 (1): 37–42. doi : 10.1016/0014-5793(95)00492-R . PMID 7789512 .
•   Realini C, Dubiel W, Pratt G, Ferrell K, Rechsteiner M (1994). „Klonowanie molekularne i ekspresja aktywatora indukowanego interferonem gamma proteazy multikatalitycznej” . J. Biol. chemia . 269 ​​(32): 20727-32. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32052-5 . PMID 8051173 .
•   Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (1996). „Charakterystyka in vivo regulatora proteasomu PA28” . J. Biol. chemia . 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .
•   Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Genom Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•   Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). „HIV-1 tat hamuje proteasom 20 S i jego aktywację za pośrednictwem regulatora 11 S” . J. Biol. chemia . 272 (13): 8145–8148. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID 9079628 .
•   Soza A, Knuehl C, Groettrup M, Henklein P, Tanaka K, Kloetzel PM (1997). „Ekspresja i lokalizacja subkomórkowa mysiego kompleksu aktywatora proteasomu 20S PA28” . FEBS Lett . 413 (1): 27–34. doi : 10.1016/S0014-5793(97)00864-8 . PMID 9287111 .
•   McCusker D, Jones T, Sheer D, Trowsdale J (1998). „Związki genetyczne genów kodujących podjednostki beta ludzkiego proteasomu i kompleks proteasomu PA28”. Genomika . 45 (2): 362–7. doi : 10.1006/geno.1997.4948 . PMID 9344661 .
•    Johnston SC, Whitby FG, Realini C, Rechsteiner M, Hill CP (1998). „Podjednostka regulatora proteasomu 11S REG alfa (PA28 alfa) jest heptamerem” . Nauka o białkach . 6 (11): 2469–73. doi : 10.1002/pro.5560061123 . PMC 2143584 . PMID 9385652 .
•    Wang X, Omura S, Szweda LI, Yang Y, Bérard J, Seminaro J, Wu J (1998). „Rapamycyna hamuje ekspresję aktywatora proteasomu i aktywność proteasomu”. Eur. J. Immunol . 27 (11): 2781-6. doi : 10.1002/eji.1830271106 . PMID 9394799 . S2CID 23525256 .
•    Knowlton JR, Johnston SC, Whitby FG, Realini C, Zhang Z, Rechsteiner M, Hill CP (1998). „Struktura aktywatora proteasomu REGalpha (PA28alpha)”. Natura . 390 (6660): 639–43. Bibcode : 1997Natur.390..639K . doi : 10.1038/37670 . PMID 9403698 . S2CID 4309279 .
•   Kohda K, Ishibashi T, Shimbara N, Tanaka K, Matsuda Y, Kasahara M (1998). „Charakterystyka mysiej rodziny genów kompleksu aktywatora PA28: pełna organizacja trzech genów członkowskich i fizyczna mapa regionu o wielkości około 150 kb zawierającego geny podjednostek alfa i beta” . J. Immunol . 160 (10): 4923–35. PMID 9590240 .
•    Madani N, Kabat D (1998). „Endogenny inhibitor ludzkiego wirusa niedoboru odporności w ludzkich limfocytach zostaje pokonany przez wirusowe białko Vif” . J. Wirol . 72 (12): 10251–5. doi : 10.1128/JVI.72.12.10251-10255.1998 . PMC 110608 . PMID 9811770 .
•    Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (1998). „Dowody na nowo odkryty komórkowy fenotyp anty-HIV-1”. Nat. Med . 4 (12): 1397–400. doi : 10.1038/3987 . PMID 9846577 . S2CID 25235070 .
•    McCusker D, Wilson M, Trowsdale J (1999). „Organizacja genów kodujących ludzkie aktywatory proteasomów PA28alpha i beta”. Immunogenetyka . 49 (5): 438–45. doi : 10.1007/s002510050517 . PMID 10199920 . S2CID 40575791 .