PSMD6
Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PSMD6 , Rpn7, S10, SGA-113M, p42A, p44S10, podjednostka 26S proteasomu, | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inne niż ATPaza 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Podjednostka regulatorowa 6 niebędąca ATPazą proteasomu 26S jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen PSMD6 .
Znaczenie kliniczne
Proteasom i jego podjednostki mają znaczenie kliniczne z co najmniej dwóch powodów: (1) upośledzony zespół złożony lub dysfunkcyjny proteasom mogą być związane z podstawową patofizjologią określonych chorób oraz (2) mogą być wykorzystywane jako cele leków do celów terapeutycznych interwencje. Niedawno podjęto więcej wysiłków w celu rozważenia proteasomu w celu opracowania nowych markerów i strategii diagnostycznych. Lepsze i kompleksowe zrozumienie patofizjologii proteasomu powinno w przyszłości znaleźć zastosowanie kliniczne.
Proteasomy tworzą kluczowy składnik systemu ubikwityny-proteasomu (UPS) i odpowiadającej mu komórkowej kontroli jakości białka (PQC). Ubikwitynacja białek , a następnie proteoliza i degradacja przez proteasom są ważnymi mechanizmami regulującymi cykl komórkowy , wzrost i różnicowanie komórek , transkrypcję genów, transdukcję sygnału i apoptozę . Następnie upośledzony montaż i funkcja kompleksu proteasomu prowadzi do zmniejszonej aktywności proteolitycznej i akumulacji uszkodzonych lub nieprawidłowo sfałdowanych rodzajów białek. Taka akumulacja białek może przyczyniać się do patogenezy i cech fenotypowych w chorobach neurodegeneracyjnych, chorobach sercowo-naczyniowych, odpowiedziach zapalnych i chorobach autoimmunologicznych oraz ogólnoustrojowych odpowiedziach na uszkodzenia DNA prowadzące do nowotworów złośliwych .
Kilka badań eksperymentalnych i klinicznych wykazało, że aberracje i deregulacja UPS przyczyniają się do patogenezy kilku zaburzeń neurodegeneracyjnych i miodegeneracyjnych, w tym choroby Alzheimera , choroby Parkinsona i choroby Picka , stwardnienia zanikowego bocznego ( ALS ), choroby Huntingtona , choroby Creutzfeldta-Jakoba , i choroby neuronu ruchowego, choroby poliglutaminowe (PolyQ), dystrofie mięśniowe oraz kilka rzadkich postaci chorób neurodegeneracyjnych związanych z demencją . Jako część systemu ubikwityna-proteasom (UPS) , proteasom utrzymuje homeostazę białek serca, a tym samym odgrywa znaczącą rolę w uszkodzeniu niedokrwiennym serca , przeroście komór i niewydolności serca . Ponadto gromadzone są dowody na to, że UPS odgrywa zasadniczą rolę w transformacji złośliwej. Proteoliza UPS odgrywa główną rolę w odpowiedziach komórek nowotworowych na sygnały stymulujące, które są krytyczne dla rozwoju raka. Odpowiednio, ekspresja genów przez degradację czynników transkrypcyjnych , takich jak p53 , c-jun , c-Fos , NF-κB , c-Myc , HIF-1α, MATα2, STAT3 , białka wiążące pierwiastki sterolowe i receptory androgenowe wszystkie są kontrolowane przez UPS, a tym samym zaangażowane w rozwój różnych nowotworów złośliwych. Ponadto UPS reguluje degradację produktów genów supresorowych nowotworów, takich jak gruczolakowata polipowatość jelita grubego ( APC ) w raku jelita grubego, siatkówczaku (Rb). i supresor guza von Hippel-Lindau (VHL), a także szereg protoonkogenów ( Raf , Myc , Myb , Rel , Src , Mos , ABL ). UPS bierze również udział w regulacji reakcji zapalnych. Ta aktywność jest zwykle przypisywana roli proteasomów w aktywacji NF-κB, który dodatkowo reguluje ekspresję cytokin prozapalnych , takich jak TNF-α , IL-β, IL-8 , cząsteczki adhezyjne ( ICAM-1 , VCAM-1 , P-selektyna ) oraz prostaglandyny i tlenek azotu (NIE). Dodatkowo UPS odgrywa również rolę w reakcjach zapalnych jako regulatory proliferacji leukocytów, głównie poprzez proteolizę cyklin i degradację CDK . Wreszcie, pacjenci z chorobami autoimmunologicznymi z SLE , zespołem Sjögrena i reumatoidalnym zapaleniem stawów (RZS) wykazują głównie krążące proteasomy, które można zastosować jako biomarkery kliniczne.
Podczas przetwarzania antygenu dla głównego kompleksu zgodności tkankowej (MHC) klasy I, proteasom jest głównym mechanizmem degradacji, który rozkłada antygen i prezentuje powstałe peptydy cytotoksycznym limfocytom T. Uważa się, że immunoproteasom odgrywa kluczową rolę w poprawie jakości i ilości generowanych ligandów klasy I.
Interakcje
Wykazano, że PSMD6 oddziałuje z PSMD13 .
Dalsza lektura
- Goff SP (2003). „Śmierć przez deaminację: nowy system restrykcji gospodarza dla HIV-1” . komórka . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00602-0 . PMID 12914693 . S2CID 16340355 .
- Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, Tabata S, Ishikawa K, Kawarabayasi Y, Kotani H (1995). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych ludzkich genów. III. Sekwencje kodujące 40 nowych genów (KIAA0081-KIAA0120) wydedukowane na podstawie analizy klonów cDNA z ludzkiej linii komórkowej KG-1” . DNA Res . 2 (1): 37–43. doi : 10.1093/dnares/2.1.37 . PMID 7788527 .
- Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). „HIV-1 tat hamuje proteasom 20 S i jego aktywację za pośrednictwem regulatora 11 S” . J. Biol. chemia . 272 (13): 8145–8. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID 9079628 .
- Madani N, Kabat D (1998). „Endogenny inhibitor ludzkiego wirusa niedoboru odporności w ludzkich limfocytach jest pokonywany przez wirusowe białko Vif” . J. Wirol . 72 (12): 10251–5. doi : 10.1128/JVI.72.12.10251-10255.1998 . PMC 110608 . PMID 9811770 .
- Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (1998). „Dowody na nowo odkryty komórkowy fenotyp anty-HIV-1”. Nat. Med . 4 (12): 1397–400. doi : 10.1038/3987 . PMID 9846577 . S2CID 25235070 .
- Mulder LC, Muesing MA (2000). „Degradacja integrazy HIV-1 przez szlak reguły N-końca” . J. Biol. chemia . 275 (38): 29749–53. doi : 10.1074/jbc.M004670200 . PMID 10893419 .
- Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (2002). „Izolacja ludzkiego genu, który hamuje zakażenie HIV-1 i jest tłumiony przez wirusowe białko Vif”. Natura . 418 (6898): 646–50. Bibcode : 2002Natur.418..646S . doi : 10.1038/natura00939 . PMID 12167863 . S2CID 4403228 .
- Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (2002). „Miejsce RTP wspólne dla białka Tat HIV-1 i podjednostki alfa regulatora 11S ma kluczowe znaczenie dla ich wpływu na funkcje proteasomu, w tym przetwarzanie antygenu”. J. Mol. Biol . 323 (4): 771–82. doi : 10.1016/S0022-2836(02)00998-1 . PMID 12419264 .
- Gaddis NC, Chertova E, Sheehy AM, Henderson LE, Malim MH (2003). „Kompleksowe badanie defektu molekularnego w wirionach ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 z niedoborem vif” . J. Wirol . 77 (10): 5810–20. doi : 10.1128/JVI.77.10.5810-5820.2003 . PMC 154025 . PMID 12719574 .
- Lecossier D, Bouchonnet F, Clavel F, Hance AJ (2003). „Hipermutacja DNA HIV-1 przy braku białka Vif”. nauka . 300 (5622): 1112. doi : 10.1126/science.1083338 . PMID 12750511 . S2CID 20591673 .
- Zhang H, Yang B, Pomerantz RJ, Zhang C, Arunachalam SC, Gao L (2003). „Deaminaza cytydynowa CEM15 indukuje hipermutację w nowo zsyntetyzowanym DNA HIV-1” . Natura . 424 (6944): 94–8. Bibcode : 2003Natur.424...94Z . doi : 10.1038/natura01707 . PMC 1350966 . PMID 12808465 .
- Mangeat B, Turelli P, Caron G, Friedli M, Perrin L, Trono D (2003). „Szeroka obrona przeciwretrowirusowa przez człowieka APOBEC3G poprzez śmiertelną edycję powstających odwrotnych transkryptów”. Natura . 424 (6944): 99–103. Bibcode : 2003Natur.424...99M . doi : 10.1038/natura01709 . PMID 12808466 . S2CID 4347374 .
- Harris RS, biskup KN, Sheehy AM, Craig HM, Petersen-Mahrt SK, Watt IN, Neuberger MS, Malim MH (2003). „Deaminacja DNA pośredniczy w odporności wrodzonej na infekcję retrowirusową” . komórka . 113 (6): 803–9. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00423-9 . PMID 12809610 . S2CID 544971 .
- Harris RS, Sheehy AM, Craig HM, Malim MH, Neuberger MS (2003). „Deaminacja DNA: nie tylko wyzwalacz dywersyfikacji przeciwciał, ale także mechanizm obrony przed retrowirusami”. Nat. immunol . 4 (7): 641–3. doi : 10.1038/ni0703-641 . PMID 12830140 . S2CID 5549252 .
- Gu Y, Sundquist WI (2003). „Dobry dla CU” . Natura . 424 (6944): 21–2. Bibcode : 2003Natur.424...21G . doi : 10.1038/424021a . PMID 12840737 . S2CID 4430569 .
- Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, Navarro F, König R, Bollman B, Münk C, Nymark-McMahon H, Landau NR (2003). „Specyficzne dla gatunku wykluczenie APOBEC3G z wirionów HIV-1 przez Vif” . komórka . 114 (1): 21–31. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00515-4 . PMID 12859895 . S2CID 1789911 .
- KewalRamani VN, Trumna JM (2003). „Wirusologia. Broń mutacyjnego zniszczenia” . nauka . 301 (5635): 923–5. doi : 10.1126/science.1088965 . PMID 12920286 . S2CID 82480782 .