CooA

CooA jest czynnikiem transkrypcyjnym zawierającym hem , który reaguje na obecność tlenku węgla . Białko to tworzy homodimery i jest homologiem białka receptora cAMP . CooA reguluje ekspresję dehydrogenazy tlenku węgla , enzymu katalizującego utlenianie CO do _CO2 . Najlepiej zbadany homolog CooA pochodzi z Rhodospirillum rubrum ( RrCooA), ale zbadano również homolog CooA z Carboxydothermus hydrogenoformans ( Ch CooA). Główną różnicą między tymi dwoma homologami CooA jest koordynacja hemu żelazowego. W przypadku Rr CooA żelazo hemowe żelaza jest związane z cysteiną i aminą N-końcowej proliny, podczas gdy w stanie żelazawym następuje zmiana ligandu, gdy pobliska histydyna wypiera tiolan. W przypadku Ch CooA żelazo hemowe jest zligowane przez histydynę i N-końcową aminę zarówno w stanie żelazowym, jak i żelazistym. W przypadku obu homologów CO wypiera ligand aminowy i aktywuje białko do wiązania się z docelową sekwencją DNA. Istnieje kilka struktur CooA: RrCooA w stanie żelaznym (1FT9), ChCooA w stanie żelaznym związanym z imidazolem (2FMY) i ChCooA w stanie żelaznym związanym z CO (2HKX).

Bibliografia _ HJ Sofia; WG Zumft (2003). „Filogeneza bakteryjnej nadrodziny regulatorów transkrypcji Crp-Fnr: wykorzystanie widma metabolicznego poprzez kontrolowanie alternatywnych programów genowych” . Recenzje mikrobiologii FEMS . 27 (5): 559–592. doi : 10.1016/S0168-6445(03)00066-4 . PMID 14638413 .
Bibliografia _ D. Huanga; F. Yan; M. Stranawa; M. Bartosowa; V. Fojtíková; M. Martínkovej (2015). „Gazowy O2, NO i CO w transdukcji sygnału: zależności struktury i funkcji czujników gazu na bazie hemu i czujników hemu-redoks”. chemia ks . 115 (13): 6491–6533. doi : 10.1021/acs.chemrev.5b00018 . PMID 26021768 .
^ Shelver, Daniel; Thorsteinsson, Marc V.; Kerby, Robert L.; Chung, Soo Yeol; Roberts, Gary P.; Reynolds, Mark F.; Parki, Ryan B.; Burstyn, Judith N. (1999-03-01). „Identyfikacja dwóch ważnych reszt w miejscu hemu (cysteiny 75 i histydyny 77) w CooA, czynnika transkrypcyjnego wykrywającego CO Rhodospirillum rubrum” . Biochemia . 38 (9): 2669–2678. doi : 10.1021/bi982658j . ISSN 0006-2960 . PMID 10052937 .
^ Dhawan, Ish K.; Shelver, Daniel; Thorsteinsson, Marc V.; Roberts, Gary P.; Johnson, Michael K. (1999-09-01). „Badanie osiowej ligacji hemu w białku CooA wykrywającym CO za pomocą spektroskopii magnetycznego dichroizmu kołowego” . Biochemia . 38 (39): 12805–12813. doi : 10.1021/bi991303c . ISSN 0006-2960 . PMID 10504250 .
Bibliografia _ Youn, Hwan; Parki, Ryan B.; Cherney, Melisa M.; Roberts, Gary P.; Burstyn, Judith N. (2004-11-01). „Badanie roli N-końcowej proliny, dystalnego ligandu hemu w CooA czujnika CO” . Biochemia . 43 (44): 14149–14160. doi : 10.1021/bi0487948 . ISSN 0006-2960 . PMID 15518565 .
Bibliografia _ Masuda, Chiaki; Akaishi, Tetsuhiro; Nakajima, Hiroshi; Yoshioka, Shiro; Ohta, Takehiro; Pal, Biswajit; Kitagawa, Teizo; Aono, Shigetoshi (luty 2005). „Właściwości spektroskopowe i redoks homologu CooA z Carboxydothermus hydrogenoformans” . Dziennik Chemii Biologicznej . 280 (5): 3269–3274. doi : 10.1074/jbc.m409884200 . ISSN 0021-9258 . PMID 15537640 .
Bibliografia _ RL Kerby; H. Youn; M. Conrad (2005). „CooA, paradygmat białek regulatorowych wykrywających gaz”. J. Inorg. Biochem . 99 (1): 280–92. doi : 10.1016/j.jinorgbio.2004.10.032 . PMID 15598507 .
Bibliografia _ „Właściwości biochemiczne i biofizyczne aktywatora transkrypcyjnego wykrywającego CO CooA”. wg. chemia Rez . 36 (11): 825–31. doi : 10.1021/ar020097p . PMID 14622029 .
^ Lanzilotta, William N.; Schuller, David J.; Thorsteinsson, Marc V.; Kerby, Robert L.; Roberts, Gary P.; Poulos, Thomas L. (październik 2000). „Struktura aktywatora transkrypcji wykrywającego CO CooA” . Biologia strukturalna przyrody . 7 (10): 876–880. doi : 10.1038/82820 . ISSN 1545-9985 . PMID 11017196 . S2CID 26285016 .
^ Komori, Hirofumi; Inagaki, Sayaka; Yoshioka, Shiro; Aono, Shigetoshi; Higuchi, Yoshiki (30.03.2007). „Struktura krystaliczna wykrywającego CO aktywatora transkrypcji CooA związanego z egzogennym ligandem imidazolem” . Journal of Molecular Biology . 367 (3): 864–871. doi : 10.1016/j.jmb.2007.01.043 . ISSN 0022-2836 . PMID 17292914 .
Bibliografia _ Li, H.; Lanz, Dakota Północna; Kerby, RL; Roberts, lekarz ogólny; Poulos, TL (2007-03-01). „Hipoteza oparta na strukturze dotycząca aktywacji czynnika transkrypcyjnego wykrywającego CO CooA” . Acta Crystallographica Sekcja D: Krystalografia biologiczna . 63 (3): 282–287. doi : 10.1107/S0907444906051638 . ISSN 0907-4449 . PMID 17327664 .

[1] Bibliografia _ HJ Sofia; WG Zumft (2003). „Filogeneza bakteryjnej nadrodziny regulatorów transkrypcji Crp-Fnr: wykorzystanie widma metabolicznego poprzez kontrolowanie alternatywnych programów genowych” . Recenzje mikrobiologii FEMS . 27 (5): 559–592. doi : 10.1016/S0168-6445(03)00066-4 . PMID 14638413 .

[2] Bibliografia _ D. Huanga; F. Yan; M. Stranawa; M. Bartosowa; V. Fojtíková; M. Martínkovej (2015). „Gazowy O2, NO i CO w transdukcji sygnału: zależności struktury i funkcji czujników gazu na bazie hemu i czujników hemu-redoks”. chemia ks . 115 (13): 6491–6533. doi : 10.1021/acs.chemrev.5b00018 . PMID 26021768 .

[3] Shelver, Daniel; Thorsteinsson, Marc V.; Kerby, Robert L.; Chung, Soo Yeol; Roberts, Gary P.; Reynolds, Mark F.; Parki, Ryan B.; Burstyn, Judith N. (1999-03-01). „Identyfikacja dwóch ważnych reszt w miejscu hemu (cysteiny 75 i histydyny 77) w CooA, czynnika transkrypcyjnego wykrywającego CO Rhodospirillum rubrum” . Biochemia . 38 (9): 2669–2678. doi : 10.1021/bi982658j . ISSN 0006-2960 . PMID 10052937 .

[4] Dhawan, Ish K.; Shelver, Daniel; Thorsteinsson, Marc V.; Roberts, Gary P.; Johnson, Michael K. (1999-09-01). „Badanie osiowej ligacji hemu w białku CooA wykrywającym CO za pomocą spektroskopii magnetycznego dichroizmu kołowego” . Biochemia . 38 (39): 12805–12813. doi : 10.1021/bi991303c . ISSN 0006-2960 . PMID 10504250 .

[5] Bibliografia _ Youn, Hwan; Parki, Ryan B.; Cherney, Melisa M.; Roberts, Gary P.; Burstyn, Judith N. (2004-11-01). „Badanie roli N-końcowej proliny, dystalnego ligandu hemu w CooA czujnika CO” . Biochemia . 43 (44): 14149–14160. doi : 10.1021/bi0487948 . ISSN 0006-2960 . PMID 15518565 .

[6] Bibliografia _ Masuda, Chiaki; Akaishi, Tetsuhiro; Nakajima, Hiroshi; Yoshioka, Shiro; Ohta, Takehiro; Pal, Biswajit; Kitagawa, Teizo; Aono, Shigetoshi (luty 2005). „Właściwości spektroskopowe i redoks homologu CooA z Carboxydothermus hydrogenoformans” . Dziennik Chemii Biologicznej . 280 (5): 3269–3274. doi : 10.1074/jbc.m409884200 . ISSN 0021-9258 . PMID 15537640 .

[7] Bibliografia _ RL Kerby; H. Youn; M. Conrad (2005). „CooA, paradygmat białek regulatorowych wykrywających gaz”. J. Inorg. Biochem . 99 (1): 280–92. doi : 10.1016/j.jinorgbio.2004.10.032 . PMID 15598507 .

[8] Bibliografia _ „Właściwości biochemiczne i biofizyczne aktywatora transkrypcyjnego wykrywającego CO CooA”. wg. chemia Rez . 36 (11): 825–31. doi : 10.1021/ar020097p . PMID 14622029 .

[9] Lanzilotta, William N.; Schuller, David J.; Thorsteinsson, Marc V.; Kerby, Robert L.; Roberts, Gary P.; Poulos, Thomas L. (październik 2000). „Struktura aktywatora transkrypcji wykrywającego CO CooA” . Biologia strukturalna przyrody . 7 (10): 876–880. doi : 10.1038/82820 . ISSN 1545-9985 . PMID 11017196 . S2CID 26285016 .

[10] Komori, Hirofumi; Inagaki, Sayaka; Yoshioka, Shiro; Aono, Shigetoshi; Higuchi, Yoshiki (30.03.2007). „Struktura krystaliczna wykrywającego CO aktywatora transkrypcji CooA związanego z egzogennym ligandem imidazolem” . Journal of Molecular Biology . 367 (3): 864–871. doi : 10.1016/j.jmb.2007.01.043 . ISSN 0022-2836 . PMID 17292914 .

[11] Bibliografia _ Li, H.; Lanz, Dakota Północna; Kerby, RL; Roberts, lekarz ogólny; Poulos, TL (2007-03-01). „Hipoteza oparta na strukturze dotycząca aktywacji czynnika transkrypcyjnego wykrywającego CO CooA” . Acta Crystallographica Sekcja D: Krystalografia biologiczna . 63 (3): 282–287. doi : 10.1107/S0907444906051638 . ISSN 0907-4449 . PMID 17327664 .