Pudełko na widły d1
Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
FOXD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, FKHL8, FREAC-4, FREAC4, skrzynka widełkowa D1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Forkhead box D1 to białko , które u ludzi jest kodowane przez gen FOXD1 . Forkhead d1 to mapy czynnika transkrypcyjnego wyrażanego w nerkach na chromosomie 5 w pozycji 5q12-q13, zidentyfikowane w białku widelca Drosophila i ssaczym czynniku transkrypcyjnym HNF3. Nazwa pochodzi od dwóch kolczastych struktur głowy w zarodkach mutanta Drosophila forkhead . Należy do czynników transkrypcyjnych , która wykazuje niezwykłą różnorodność funkcjonalną i bierze udział w wielu różnych procesach biologicznych. Najczęściej używane synonimy Forkhead D1 to FOX D1, FREAC-4 i BF2.
Struktura
Domena Forkhead w FOXD1 różni się od innych członków tej samej rodziny, z wyjątkiem FREAC-9, znanego również jako FOXD2. Sekwencja aminokwasowa motywu widełek wiążących DNA FREAC-4 jest podobna do FREAC-9, z wyjątkiem tego, że na poziomie nukleotydów występuje 12 podstawień. Domena wiążąca DNA to skrzydlata helisa składająca się z około 100 aminokwasów, ma cztery helisy i dwie nici beta-kartek, sekwencja rozciąga się od nukleotydu 2521 do 4792. Szacuje się, że ten gen ma około 2,5 kilo par zasad i najprawdopodobniej mniej intronów . Motyw w końcowej części NH2 jest silnie kwaśny i bogaty w proliny na końcu COOH, jest podobny do czynnika transkrypcyjnego UBF i WT-1. W doświadczeniach z kotransfekcją wykazano, że gen supresorowy guza p53 i WT-1 są potencjalnymi regulatorami FREAC-4. FOXD1 jest wyrażany przez dwie linie komórkowe COS 7 i 293 pochodzące z nerki . Ma również wysoki stopień podobieństwa sekwencji z FOXD1 znalezionym przez sklonowane mysie cDNA .
Funkcje
Badania ortologicznego białka mysiego wskazują, że działa ono w rozwoju nerek poprzez promowanie różnicowania prekursorów nefronów , a także działa w rozwoju siatkówki i skrzyżowania nerwów wzrokowych . Może również regulować reakcje zapalne i zapobiegać autoimmunizacji .
FOXD1 i komórka zrębu pełnią istotną funkcję podczas morfogenezy nerek . Łożyskowy czynnik wzrostu (PIGF) jest bezpośrednim i fizjologicznie istotnym celem transkrypcyjnym FOXD1, a zatem jest koeksprymowany z FOXD1 w celu rozwoju zrębu nerki. U człowieka występują dwie izoformy PIGF, PIGF1 i PIGF2. W eksperymencie stwierdzono, że trzy geny zostały zidentyfikowane przez indukowany FOXD1 w analizie Northern blotting. Po pierwsze, PIGF inicjuje sygnał podścieliska, który reguluje różnicowanie nabłonka, który działa jako czynnik wzrostu w reaktywnej angiogenezie podczas gojenia się ran i nowotworzenia . Po drugie, naskórkowy czynnik wzrostu wiążący heparynę i wreszcie białko bHLH G0S8.
Foxd1 jest również wymagany do prawidłowego tworzenia skrzyżowania nerwów wzrokowych . Podczas tworzenia skrzyżowania wzrokowego Foxd1 ulega ekspresji w siatkówce VT, jak również w międzymózgowiu brzusznym w celu rozwoju siatkówki i morfogenezy skrzyżowania. Podczas rozwoju układu wzrokowego komórek zwojowych siatkówki (RGC) opuszczają siatkówkę przez tarczę nerwu wzrokowego, aż dotrą do skrzyżowania nerwów wzrokowych. Foxg1 i Foxd1 ulegają ekspresji w sąsiednich domenach cewy nerwowej w czasie, gdy pęcherzyk optyczny ewaginatuje. Błędna ekspresja Foxd1 i Foxg1 w siatkówce pisklęcia powoduje błąd projekcji w aksonach siatkówki wzdłuż przeciwległej osi w pokrywie , a także odgrywa rolę w specyfikacji przeciwległych RGC. Stwierdzono, że Foxd1 jest niezbędny do prawidłowego tworzenia skrzyżowania nerwów wzrokowych.
FOX D1 ulega ekspresji i działa w zachowaniu komórek glejaka , reguluje w górę i bezpośrednio koreluje ze stopniem glejaka. Opóźniona ekspresja FOX D1 powoduje zmniejszenie wzrostu komórek glejaka i zmniejszenie migracji komórek. Istnieje duże prawdopodobieństwo, że FOXD1 może służyć jako nowy regulator zachowania komórek glejaka, który mógłby zostać wykorzystany jako nowy cel dla terapii ukierunkowanych genowo. U myszy Foxd1 ulega ekspresji w mezenchymie otaczającym przysadkę mózgową, która jest podstawowym źródłem czynników sygnalizacyjnych regulujących organogenezę przysadki mózgowej . Sugeruje to, że Foxd1 jest pośrednio zaangażowany w Lhb i tworzenie chrząstki .
Choroba
Duplikacja chromosomów w regionie 5q12-13 chromosomu 5 powoduje dysplastyczne nerki i zaburzenia psychiczne, co jest istotne dla dystrybucji tkankowej mRNA FREAC-4.
- ^ a b c GRCh38: Ensembl wydanie 89: ENSG00000251493 - Ensembl , maj 2017
- ^ „Referencja Human PubMed:” . Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej, Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych .
- ^ „Odnośnik Mouse PubMed:” . Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej, Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych .
- ^ a b „FOX D1 Forkhead box D1” .
- ^ a b c d e Carlsson P, Mahlapuu M (2002). „Czynniki transkrypcyjne Forkhead: kluczowi gracze w rozwoju i metabolizmie” . Biologia rozwojowa . 250 (1): 1–23. doi : 10.1006/dbio.2002.0780 . PMID 12297093 .
- ^ a b Ernstsson S, Betz R, Lagercrantz S, Larsson C, Ericksson S, Cederberg A, Carlsson P, Enerbäck S (1997). „Klonowanie i charakterystyka freac-9 (FKHL17), nowego ludzkiego genu forkhead wyrażanego w nerkach, który mapuje się na chromosom 1p32-p34”. Genomika . 46 (1): 78–85. doi : 10.1006/geno.1997.4986 . PMID 9403061 .
- ^ a b c d e Ernstsson S, Pierrou S, Hulander M, Cederberg A, Hellqvist M, Carlsson P, Enerbäck S (1996). „Charakterystyka ludzkiego genu forkhead FREAC-4. Dowody na regulację przez gen supresorowy guza Wilmsa (WT-1) i p53” . Journal of Biological Chemistry . 271 (35): 21094–9. doi : 10.1074/jbc.271.35.21094 . PMID 8702877 .
- ^ a b c d e Hatini V, Huh SO, Herzlinger D, Soares VC, Lai E (1996). „Zasadnicza rola mezenchymu zrębu w morfogenezie nerek ujawniona przez ukierunkowane zaburzenie czynnika transkrypcyjnego Winged Helix BF-2” . Geny i rozwój . 10 (12): 1467–78. doi : 10.1101/gad.10.12.1467 . PMID 8666231 .
- ^ a b c d Herrera E, Marcus R, Li S, Williams SE, Erskine L, Lai E, Mason C (2004). „Foxd1 jest wymagany do prawidłowego tworzenia skrzyżowania nerwów wzrokowych” . Rozwój . 131 (22): 5727–39. doi : 10.1242/dev.01431 . PMID 15509772 .
- ^ ab . Gao YF, Zhu T, Mao XY, Mao CX, Li L, Yin JY, Zhou HH, Liu ZQ (2017) „Wyciszenie Forkhead box D1 hamuje proliferację i migrację w komórkach glejaka” . Raporty onkologiczne . 37 (2): 1196–1202. doi : 10.3892/lub.2017.5344 . PMID 28075458 .
- ^ Gumbel JH, Patterson EM, Owusu SA, Kabat BE, Jung DO, Simmons J, Hopkins T, Ellsworth BS (2012). „Czynnik transkrypcyjny forkhead, Foxd1, jest niezbędny do ekspresji hormonu luteinizującego przysadki mózgowej u myszy” . PLOS JEDEN . 7 (12): e52156. doi : 10.1371/journal.pone.0052156 . PMC 3526578 . PMID 23284914 .