Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
HOXB1
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, HCFP3, HOX2, HOX2I, Hox-2.9, homeobox B1
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Białko homeobox Hox-B1 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen HOXB1 .
Funkcjonować
Ten gen należy do rodziny genów homeoboksów. Geny homeobox kodują wysoce konserwatywną rodzinę czynników transkrypcyjnych, które odgrywają ważną rolę w morfogenezie we wszystkich organizmach wielokomórkowych. Ssaki posiadają cztery podobne klastry genów homeoboksów, HOXA, HOXB, HOXC i HOXD, zlokalizowane na różnych chromosomach, składające się z 9 do 11 genów ułożonych w tandemie. Ten gen jest jednym z kilku genów homeobox HOXB zlokalizowanych w klastrze na chromosomie 17.
Interakcje
Wykazano, że HOXB1 oddziałuje z PBX1 .
Zobacz też
Dalsza lektura
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (1989). „Rodzina ludzkich genów HOX” . Kwasy nukleinowe Res . 17 (24): 10385–402. doi : 10.1093/nar/17.24.10385 . PMC 335308 . PMID 2574852 .
Boncinelli E, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Somma R, Gaudino G, Stornaiuolo A, Cafiero M, Faiella A, Simeone A (1989). „Organizacja ludzkich genów homeobox klasy I”. Genom . 31 (2): 745–56. doi : 10.1139/g89-133 . PMID 2576652 .
Guazzi S, Lonigro R, Pintonello L, Boncinelli E, Di Lauro R, Mavilio F (1994). „Gen czynnika transkrypcyjnego tarczycy-1 jest kandydatem na cel regulacji przez białka Hox” . EMBO J. 13 (14): 3339–47. doi : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06636.x . PMC 395231 . PMID 7913891 .
Miano JM, Firulli AB, Olson EN, Hara P, Giachelli CM, Schwartz SM (1996). „Ograniczona ekspresja genów homeobox odróżnia komórki mięśni gładkich płodu od dorosłego człowieka” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 93 (2): 900–5. Bibcode : 1996PNAS...93..900M . doi : 10.1073/pnas.93.2.900 . PMC40155 . _ PMID 8570656 .
Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). „Dokładne mapowanie ludzkich klastrów genów HOX” . Cytogenet. Genet komórkowy . 73 (1–2): 114–5. doi : 10.1159/000134320 . PMID 8646877 .
Berthelsen J, Zappavigna V, Ferretti E, Mavilio F, Blasi F (1998). „Nowa homeoproteina Prep1 moduluje kooperatywność białek Pbx-Hox” . EMBO J. 17 (5): 1434–45. doi : 10.1093/emboj/17.5.1434 . PMC 1170491 . PMID 9482740 .
Piper DE, Batchelor AH, Chang CP, Cleary ML, Wolberger C (1999). „Struktura heterodimeru HoxB1-Pbx1 związanego z DNA: rola heksapeptydu i czwartej helisy homeodomeny w tworzeniu kompleksu” . komórka . 96 (4): 587–97. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . PMID 10052460 . S2CID 16122785 .
Jungbluth S, Bell E, Lumsden A (1999). „Specyfikacja odrębnych tożsamości neuronów ruchowych przez pojedyncze działania poszczególnych genów Hox” . Rozwój . 126 (12): 2751-8. doi : 10.1242/dev.126.12.2751 . PMID 10331985 .
Jacobs Y, Schnabel CA, Cleary ML (1999). „Trimeryczne powiązanie białek homeodomen Hox i TALE pośredniczy w aktywności wzmacniającej tyłomózgowia Hoxb2” . Mol. Komórka. Biol . 19 (7): 5134–42. doi : 10.1128/mcb.19.7.5134 . PMC84356 . _ PMID 10373562 .
Faiella A, Zortea M, Barbaria E, Albani F, Capra V, Cama A, Boncinelli E (1998). „Polimorfizm genetyczny w ludzkim genie homeoboksu HOXB1, implikujący powtórzenie tandemowe 9 pz w regionie kodującym koniec aminowy. Mutacje w skrócie nr 200. Online” . Szum. Mutacja . 12 (5): 363. PMID 10671062 .
Mikkola I, Bruun JA, Holm T, Johansen T (2001). „Superaktywacja transaktywacji, w której pośredniczy Pax6, z miejsc wiązania sparowanych domen przez niezależną od DNA rekrutację różnych białek homeodomen” . J. Biol. chemia . 276 (6): 4109–18. doi : 10.1074/jbc.M008882200 . PMID 11069920 .
Ingram JL, Stodgell CJ, Hyman SL, Figlewicz DA, Weitkamp LR, Rodier PM (2000). „Odkrycie wariantów allelicznych HOXA1 i HOXB1: genetyczna podatność na zaburzenia ze spektrum autyzmu” . Teratologia . 62 (6): 393–405. doi : 10.1002/1096-9926(200012)62:6<393::AID-TERA6>3.0.CO;2-V . PMID 11091361 .
Di Rocco G, Gavalas A, Popperl H, Krumlauf R, Mavilio F, Zappavigna V (2001). „Rekrutacja kompleksów SOX / OCT i zróżnicowana aktywność HOXA1 i HOXB1 modulują funkcję wzmacniacza autoregulacji Hoxb1” . J. Biol. chemia . 276 (23): 20506-15. doi : 10.1074/jbc.M011175200 . PMID 11278854 .
Li J, Tabor HK, Nguyen L, Gleason C, Lotspeich LJ, Spiker D, Risch N, Myers RM (2002). „Brak związku między wariantami genów HoxA1 i HoxB1 a autyzmem w 110 rodzinach multipleksowych”. Jestem. J. Med. Genet . 114 (1): 24–30. doi : 10.1002/ajmg.1618 . PMID 11840501 .
Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K, Tomita M, McGinnis W, Matsuo N (2002). „Pełny panel analizy mutacji 39 ludzkich genów HOX” . Teratologia . 65 (2): 50–62. doi : 10.1002/tera.10009 . PMID 11857506 .
Fognani C, Kilstrup-Nielsen C, Berthelsen J, Ferretti E, Zappavigna V, Blasi F (2002). „Charakterystyka PREP2, paralogu PREP1, który definiuje nową podrodzinę homeodomenowych czynników transkrypcyjnych MEINOX TALE” . Kwasy nukleinowe Res . 30 (9): 2043–51. doi : 10.1093/nar/30.9.2043 . PMC 113854 . PMID 11972344 .
Subramaniam N, Campión J, Rafter I, Okret S (2003). „Rozmowa krzyżowa między sygnałami glukokortykoidów i kwasu retinowego, obejmująca interakcję receptora glukokortykoidów z białkiem homeodomeny Pbx1” . Biochem. J. _ 370 (część 3): 1087–95. doi : 10.1042/BJ20020471 . PMC 1223238 . PMID 12487626 .
Linki zewnętrzne
Galeria WPB
1b72 : PBX1, HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1/DNA TRÓJCZĘŚCIOWY KOMPLEKS
(1) Domeny podstawowe
(1.1) Podstawowy zamek leucynowy ( bZIP )
(1.2) Podstawowa helisa-pętla-helisa ( bHLH )
grupa A
Grupa B
Grupa C bHLH- PAS
Grupa D
Grupa E
Grupa F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Podstawowa helisa-rozpiętość-helisa (bHSH)
(2) Domeny wiążące DNA
palca cynkowego
(2.1) Receptor jądrowy (Cys 4 )
podrodzina 1
podrodzina 2
podrodzina 3
podrodzina 4
podrodzina 5
podrodzina 6
podrodzina 0
(2.2) Inne Cys4
(2.3) Cys 2 His 2
(2.4) Cys 6
(2.5) Naprzemienny skład
(2.6) BRAK
(4) Czynniki β-rusztowania ze stykami z mniejszymi rowkami
(0) Inne czynniki transkrypcyjne
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .